MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. capri LC str. 95010

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015431	AATTTT	2	12	38062	38073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015431	AAATTT	2	12	48224	48235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015431	ATTTTT	2	12	70157	70168	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015431	ATATCT	2	12	84158	84169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015431	AATATA	2	12	96593	96604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015431	TTGCTT	2	12	102447	102458	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015431	TTTTAC	2	12	104769	104780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015431	TTTTAA	2	12	111460	111471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015431	TAAAAA	2	12	140844	140855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015431	TAAAAT	2	12	147334	147345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015431	TTATTT	2	12	178015	178026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015431	TTTAAT	2	12	191502	191513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015431	TTTTAA	2	12	205220	205231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015431	ATCTAA	2	12	214470	214481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015431	AATTAA	2	12	219891	219902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015431	TTTTAA	2	12	323678	323689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015431	TCATTT	2	12	333527	333538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015431	AAGCTT	2	12	346194	346205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015431	TATTAA	2	12	352369	352380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015431	TAAAAA	2	12	363197	363208	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015431	TATAAA	2	12	385511	385522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015431	TATAAA	2	12	386757	386768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015431	TTGTTT	2	12	392708	392719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015431	GTTATT	2	12	401119	401130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015431	TACTTT	2	12	426743	426754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015431	ATAAAT	2	12	464543	464554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015431	TATAAA	2	12	471628	471639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015431	TATAAA	2	12	472847	472858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015431	TATAAA	2	12	473071	473082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015431	TATAAA	2	12	474097	474108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015431	TATAAA	2	12	474332	474343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015431	ATATTT	2	12	474344	474355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015431	TATAAA	2	12	477525	477536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015431	TAATTT	2	12	477684	477695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015431	CTAATA	2	12	509330	509341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015431	TCTTTT	2	12	521271	521282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015431	TTTTTA	2	12	547509	547520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015431	TTTAAT	2	12	620810	620821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015431	ATTTTT	2	12	629370	629381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015431	TTTATA	2	12	659495	659506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015431	TTATTT	2	12	680481	680492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015431	TAAAAA	2	12	707148	707159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015431	AAAAAC	2	12	719026	719037	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015431	GAATTT	2	12	772201	772212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015431	AAATTT	2	12	791766	791777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015431	AGAAAT	2	12	827498	827509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015431	TAACAA	2	12	852255	852266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015431	TTTTTA	2	12	878321	878332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015431	TTAAAC	2	12	914166	914177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015431	TAAATT	2	12	924051	924062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015431	AACTTA	2	12	944222	944233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015431	TAATAG	2	12	954174	954185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015431	TTTATA	2	12	954806	954817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015431	ATTTTT	2	12	976263	976274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015431	TTAGTT	2	12	1017540	1017551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015431	AATATA	2	12	1019025	1019036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015431	ACAATT	2	12	1043968	1043979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015431	TTTTAT	2	12	1049459	1049470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015431	AAAACA	2	12	1077875	1077886	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015431	CTAATA	2	12	1105235	1105246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015431	ATAAAA	2	12	1111292	1111303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015431	ATATTA	2	12	1111382	1111393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015431	TAAAAA	2	12	1111989	1112000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015431	ATTTTT	2	12	1134409	1134420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015431	CAGATC	2	12	1149120	1149131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.