MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 plasmid pGP6

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015430	TAC	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015430	GTT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015430	CTG	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015430	TGA	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015430	TCT	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015430	GGT	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015430	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015430	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015430	CTC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015430	TAG	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015430	ATC	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015430	GTT	2	6	2745	2750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015430	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015430	TGA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015430	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015430	GAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015430	ATA	2	6	3446	3451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015430	ACC	2	6	3495	3500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015430	CTC	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015430	AAG	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015430	ACC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015430	TTG	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015430	TGA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015430	TAC	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015430	ATT	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015430	GCC	2	6	6957	6962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015430	TCC	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015430	AGC	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015430	TTC	2	6	7165	7170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015430	AAG	2	6	7183	7188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015430	ATT	2	6	7493	7498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015430	TTA	2	6	7548	7553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015430	TCT	2	6	9917	9922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015430	CTT	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015430	AAG	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015430	TCT	2	6	10697	10702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015430	TAT	2	6	10795	10800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015430	AAT	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015430	CTC	2	6	11823	11828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015430	ATT	2	6	11982	11987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015430	TTC	2	6	12098	12103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015430	GCA	2	6	12237	12242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015430	GGC	2	6	12250	12255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015430	TGA	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015430	AGA	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015430	ATT	2	6	13025	13030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015430	TAG	2	6	14882	14887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015430	ATC	2	6	14908	14913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015430	CTG	2	6	15094	15099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015430	GCC	2	6	15128	15133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015430	GTT	2	6	15348	15353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015430	CTG	2	6	15725	15730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015430	TGA	2	6	15743	15748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015430	TCT	2	6	15842	15847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015430	ACA	2	6	15907	15912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015430	GGT	2	6	17104	17109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015430	CTT	2	6	17118	17123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015430	ATA	2	6	17130	17135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015430	TGG	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015430	CGA	2	6	17705	17710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015430	GAG	2	6	17800	17805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015430	CTT	2	6	17841	17846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015430	AGG	2	6	17911	17916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015430	ACC	2	6	17924	17929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015430	CTC	2	6	17930	17935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015430	ATT	2	6	17952	17957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.