MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	AGATTA	2	12	25102	25113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015416	ATTTAT	2	12	52411	52422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015416	GGATCC	2	12	113426	113437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015416	ATTATA	2	12	115954	115965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015416	ATTTTT	2	12	116574	116585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015416	GATCGA	2	12	119200	119211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015416	AGATCC	2	12	139539	139550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015416	GCTCGT	2	12	153130	153141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015416	AGAATA	2	12	158874	158885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015416	AGTTAT	2	12	189775	189786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015416	GTGCCA	2	12	203186	203197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015416	GGATTC	2	12	213851	213862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015416	ATCAAG	2	12	220766	220777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015416	CATGTT	2	12	242315	242326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015416	TCAATA	2	12	242328	242339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015416	ACTTGC	2	12	247367	247378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015416	TGCAAA	2	12	257841	257852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015416	AGGGGT	2	12	291989	292000	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015416	GTAGCA	2	12	294536	294547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015416	ATGCAC	2	12	412741	412752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015416	TTGCTT	2	12	442104	442115	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015416	CGGTGG	2	12	467535	467546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015416	TTTGTA	2	12	473257	473268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015416	AAAAAG	2	12	490398	490409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015416	CATGAT	2	12	528227	528238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015416	CATAAA	2	12	554773	554784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015416	ATCAAG	2	12	572748	572759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015416	AATCAG	2	12	618107	618118	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015416	TGATTG	2	12	624808	624819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015416	ATTATA	2	12	628488	628499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015416	TAAACC	2	12	650550	650561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015416	ATATAA	2	12	651472	651483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015416	TTCAAC	2	12	671154	671165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015416	CTTGAT	2	12	671247	671258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015416	CATATA	2	12	672095	672106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015416	ATAAGG	2	12	673648	673659	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015416	GGATAT	2	12	685068	685079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015416	ACTGCT	2	12	687687	687698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015416	TTCTAT	2	12	737198	737209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015416	ATTGAT	2	12	807998	808009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015416	AGGGGT	2	12	837312	837323	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015416	GTAGCA	2	12	839848	839859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015416	TAAAAA	2	12	847134	847145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015416	CATTCG	2	12	849515	849526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015416	GCAATA	2	12	861246	861257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015416	ATTGAT	2	12	873095	873106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015416	CATTCA	2	12	908851	908862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015416	TAAATA	2	12	913523	913534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015416	CCGGGA	2	12	934741	934752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015416	TTCGCC	2	12	944519	944530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015416	GCAATG	2	12	991439	991450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015416	TTCAGT	2	12	1016770	1016781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015416	TCATAC	2	12	1057486	1057497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015416	ATTTTA	2	12	1080091	1080102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015416	CTTAAG	2	12	1132213	1132224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015416	CCCCAC	2	12	1137529	1137540	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_015416	TTAATA	2	12	1144239	1144250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015416	AGGCCG	2	12	1157441	1157452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015416	CTTGAT	2	12	1166189	1166200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015416	GGATAT	2	12	1168579	1168590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015416	GCTCAC	2	12	1180494	1180505	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015416	GATCTG	2	12	1202431	1202442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015416	TATATG	2	12	1225486	1225497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015416	GTCTCT	2	12	1231186	1231197	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015416	CTTTGG	2	12	1290638	1290649	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015416	ATATTA	2	12	1310975	1310986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015416	GTGCGC	2	12	1318248	1318259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015416	TAAAAA	2	12	1320325	1320336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015416	AGATAT	2	12	1337668	1337679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015416	GAGAAA	2	12	1360483	1360494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015416	CCCCAA	2	12	1364206	1364217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015416	ATTTTG	2	12	1366665	1366676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015416	GGCACC	2	12	1366933	1366944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015416	AGGGCT	2	12	1382731	1382742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015416	TATATT	2	12	1428058	1428069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015416	AATCCC	2	12	1443143	1443154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015416	TATCCC	2	12	1444009	1444020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015416	ATCTGG	2	12	1467798	1467809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015416	ATCAAT	2	12	1486183	1486194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015416	TTTAAA	2	12	1495037	1495048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015416	GATTGA	2	12	1506806	1506817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015416	ACTTTA	2	12	1575293	1575304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015416	TAAACC	2	12	1577817	1577828	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015416	GGTCAG	2	12	1582410	1582421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015416	GAGGCA	2	12	1607200	1607211	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015416	CGAATG	2	12	1621749	1621760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015416	GTCCAG	2	12	1649846	1649857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015416	TTTAAT	2	12	1675908	1675919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015416	TAGAAA	2	12	1688184	1688195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015416	TAAAAA	2	12	1714135	1714146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015416	TGAGCC	2	12	1736343	1736354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015416	GGTTTA	2	12	1760160	1760171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015416	TATATG	2	12	1799617	1799628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015416	TAATCA	2	12	1806461	1806472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015416	GCGGAT	2	12	1833958	1833969	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015416	ATGTGT	2	12	1837887	1837898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015416	CGAATG	2	12	1843992	1844003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015416	CTGCTT	2	12	1897292	1897303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015416	GTGGCC	2	12	1899680	1899691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015416	GATGCA	2	12	1902404	1902415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015416	ATGATA	2	12	1917874	1917885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015416	AACTGC	2	12	1951465	1951476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015416	CATGAT	2	12	1970831	1970842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015416	ATACAT	2	12	1991125	1991136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015416	GGTCAG	2	12	2039922	2039933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015416	CGTGCA	2	12	2076541	2076552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015416	GCATAT	2	12	2107159	2107170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015416	ACATAA	2	12	2123132	2123143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015416	GGCAAA	2	12	2125397	2125408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015416	CCATTT	2	12	2129140	2129151	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015416	TAGGAA	2	12	2143203	2143214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015416	TATGAT	2	12	2171169	2171180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015416	CGATAT	2	12	2195697	2195708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015416	GAGAAG	2	12	2200894	2200905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015416	GAAAAA	2	12	2261739	2261750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015416	CCCCAG	2	12	2326004	2326015	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015416	TTTATT	2	12	2329239	2329250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015416	ATCAAT	2	12	2350868	2350879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015416	TTTGGG	2	12	2366583	2366594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015416	ATCTCT	2	12	2371532	2371543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015416	TAACGA	2	12	2379330	2379341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015416	CATTCG	2	12	2379678	2379689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015416	TCAGGA	2	12	2379837	2379848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015416	CAGCTC	2	12	2385716	2385727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015416	ATAGGT	2	12	2396535	2396546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015416	GAACTG	2	12	2405862	2405873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015416	CGGGAA	2	12	2417982	2417993	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015416	TATAGA	2	12	2418097	2418108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015416	CGATCG	2	12	2468307	2468318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015416	CTGATT	2	12	2468507	2468518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015416	TTGCGC	2	12	2484182	2484193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015416	GCCCCT	2	12	2490410	2490421	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015416	CCTGCA	2	12	2502670	2502681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015416	CCTTTC	2	12	2523717	2523728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015416	GAAATA	2	12	2558371	2558382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015416	CGATTG	2	12	2564169	2564180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015416	CCTTTC	2	12	2613262	2613273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015416	TTCTCC	2	12	2635179	2635190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015416	CATATA	2	12	2663473	2663484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015416	GGCCGG	2	12	2666278	2666289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015416	ATGTCT	2	12	2670815	2670826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_015416	GTGAAT	2	12	2674631	2674642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015416	GGGCCT	2	12	2694218	2694229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015416	CGAAGG	2	12	2694856	2694867	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_015416	CATTTA	2	12	2695491	2695502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015416	GTTGAA	2	12	2704529	2704540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015416	ACACTA	2	12	2705519	2705530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015416	AAATTG	2	12	2709008	2709019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015416	TTCGAT	2	12	2773101	2773112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_015416	CAGAGA	2	12	2839630	2839641	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_015416	TGCGGC	2	12	2953518	2953529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015416	TTAATC	2	12	2971532	2971543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.