MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 5966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015416	AAG	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015416	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015416	CTT	2	6	3064	3069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015416	TGG	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015416	TCT	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015416	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015416	CTG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015416	TCA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015416	CAT	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015416	TGA	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015416	CAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015416	CTC	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015416	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015416	GTT	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015416	CTT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015416	CAT	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015416	TCT	2	6	4045	4050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015416	TCC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015416	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015416	CTA	2	6	4202	4207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015416	TCC	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015416	GCG	2	6	9182	9187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015416	GAT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015416	ATC	2	6	9320	9325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015416	AAC	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015416	AGA	2	6	9371	9376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015416	TCC	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015416	CTT	2	6	11592	11597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015416	TAT	2	6	11602	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015416	CAC	2	6	11611	11616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015416	TTA	2	6	11736	11741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015416	ATA	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015416	CTG	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015416	TGA	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015416	TAT	2	6	12249	12254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015416	ATT	2	6	13224	13229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015416	CTC	2	6	16025	16030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015416	GCT	2	6	16057	16062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015416	CAT	2	6	16081	16086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015416	CAC	2	6	16176	16181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015416	GAA	2	6	16189	16194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015416	CCG	2	6	16320	16325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015416	CCT	2	6	16366	16371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015416	GGC	2	6	16375	16380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015416	ACC	2	6	16433	16438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015416	AGC	2	6	16449	16454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015416	CCT	2	6	16611	16616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015416	CGT	2	6	16812	16817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015416	CTG	2	6	16948	16953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015416	TGT	2	6	16960	16965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015416	GGT	2	6	17050	17055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015416	GCC	2	6	17102	17107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015416	GAA	2	6	17128	17133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015416	GAT	2	6	17164	17169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015416	TGA	2	6	17202	17207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015416	TGA	2	6	17221	17226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015416	TGC	2	6	17392	17397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015416	GAT	2	6	17449	17454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015416	GAT	2	6	17456	17461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015416	CAC	2	6	17852	17857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015416	ATA	2	6	17878	17883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015416	TGG	3	9	17895	17903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015416	AGG	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015416	CCT	2	6	19671	19676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015416	ACC	2	6	19759	19764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015416	CCA	2	6	21083	21088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015416	ATA	3	9	21150	21158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015416	GAA	2	6	21366	21371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015416	GAA	2	6	21384	21389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015416	TAA	2	6	21440	21445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015416	ATC	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015416	GAT	2	6	26072	26077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015416	AGG	2	6	28416	28421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015416	TAC	2	6	31975	31980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015416	ATG	2	6	32056	32061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015416	TCT	2	6	34786	34791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015416	TTA	2	6	35278	35283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015416	TCG	2	6	36857	36862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015416	ATA	2	6	39394	39399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015416	GGA	2	6	39531	39536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015416	ATT	2	6	39616	39621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015416	GCT	2	6	39674	39679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015416	ATT	2	6	39690	39695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015416	CAG	2	6	39743	39748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015416	GAG	2	6	39773	39778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015416	ATA	2	6	40239	40244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015416	GCA	2	6	40313	40318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015416	ATT	2	6	40448	40453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015416	TCA	2	6	43085	43090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015416	ATG	2	6	43170	43175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015416	TCT	2	6	44177	44182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015416	TAA	2	6	44196	44201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015416	GAA	2	6	46305	46310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015416	GCT	2	6	46317	46322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015416	AAT	2	6	46327	46332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015416	ATT	2	6	46365	46370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015416	TGA	2	6	46466	46471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015416	GGC	2	6	46550	46555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015416	TAA	2	6	47044	47049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015416	TCA	2	6	47472	47477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015416	ATT	2	6	47934	47939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015416	ATA	2	6	47982	47987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015416	ATT	2	6	48003	48008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015416	TGG	2	6	48526	48531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015416	CAG	2	6	48642	48647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015416	ATT	2	6	48648	48653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015416	AAG	2	6	49762	49767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015416	TTA	2	6	51167	51172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015416	AAC	2	6	51193	51198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015416	CAC	2	6	51208	51213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015416	GGA	2	6	51231	51236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015416	GTC	2	6	51270	51275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015416	ATT	2	6	51288	51293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015416	CAG	2	6	51315	51320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015416	TCA	2	6	51322	51327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015416	TGC	2	6	51332	51337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015416	GCC	2	6	52292	52297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015416	GCC	2	6	52341	52346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015416	CTA	2	6	52354	52359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015416	ATG	2	6	52424	52429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015416	TCA	2	6	52443	52448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015416	ATG	2	6	52517	52522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015416	GCA	2	6	52607	52612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015416	TTG	2	6	52712	52717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015416	AGG	2	6	52810	52815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015416	CAG	2	6	53066	53071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015416	CTC	2	6	53108	53113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015416	TCG	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015416	TCC	2	6	53193	53198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015416	TTA	2	6	53319	53324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015416	TTA	2	6	53551	53556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015416	TCC	2	6	53585	53590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015416	TAT	2	6	53627	53632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015416	TGC	2	6	53655	53660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015416	TAC	2	6	53661	53666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015416	AGC	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015416	ATT	2	6	53694	53699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015416	ACT	2	6	53700	53705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015416	ATT	2	6	54580	54585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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