MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 9995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015416	TAC	2	6	295380	295385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015416	GCC	3	9	295395	295403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015416	TGGG	2	8	295441	295448	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015416	CAA	2	6	295511	295516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015416	CT	3	6	295602	295607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_015416	GTC	2	6	295654	295659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015416	GCA	2	6	295727	295732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015416	GTT	2	6	295748	295753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015416	CGT	2	6	295789	295794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015416	GGTT	2	8	295844	295851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015416	AGC	2	6	295915	295920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015416	GT	3	6	296020	296025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015416	CTA	2	6	296059	296064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015416	GGC	2	6	296207	296212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015416	AGA	2	6	296251	296256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015416	TTA	2	6	296341	296346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015416	GCT	2	6	296454	296459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015416	GGC	2	6	296473	296478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015416	CGGA	2	8	296479	296486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_015416	CTTT	2	8	296507	296514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_015416	T	6	6	296512	296517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015416	TAT	2	6	296552	296557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015416	GCA	2	6	296608	296613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015416	GACA	2	8	296647	296654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_015416	TTAC	2	8	296685	296692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_015416	AGG	2	6	296738	296743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015416	CAT	2	6	297286	297291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015416	CAT	2	6	297376	297381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015416	CCCAC	2	10	297405	297414	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1030	NC_015416	GACA	2	8	297438	297445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_015416	ATC	2	6	297475	297480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015416	TCAGA	2	10	297610	297619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_015416	TAA	2	6	297633	297638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015416	TCA	2	6	297649	297654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015416	GCCT	2	8	297667	297674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_015416	GAT	2	6	297675	297680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015416	CT	3	6	297705	297710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_015416	ATC	2	6	297741	297746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015416	CTTC	2	8	297766	297773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015416	TCT	2	6	297797	297802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015416	AT	3	6	298077	298082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015416	ATT	2	6	298734	298739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015416	TGA	2	6	298777	298782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015416	TAG	2	6	298852	298857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015416	ATT	2	6	298886	298891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015416	ATA	3	9	299847	299855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015416	CTT	2	6	299873	299878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015416	CAC	2	6	300322	300327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_015416	T	7	7	300328	300334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015416	ACC	2	6	300342	300347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_015416	TA	3	6	300352	300357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015416	GAT	2	6	300646	300651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015416	GA	3	6	300659	300664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015416	AGC	2	6	301126	301131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015416	GAA	2	6	301228	301233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015416	CAG	2	6	301259	301264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015416	TGG	2	6	301272	301277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015416	AG	3	6	301348	301353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015416	CTTG	2	8	301420	301427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_015416	AGC	2	6	301474	301479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015416	AGC	2	6	301656	301661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015416	TAA	2	6	301662	301667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015416	GAG	2	6	301676	301681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015416	TGGC	2	8	301727	301734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_015416	ATC	2	6	301789	301794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015416	GGC	2	6	301837	301842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015416	AAG	2	6	301933	301938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015416	GAA	2	6	301945	301950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015416	GATCA	2	10	302116	302125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_015416	CGG	2	6	302169	302174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015416	CCG	2	6	302200	302205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_015416	GGA	2	6	302238	302243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015416	AT	3	6	302250	302255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015416	TCGT	2	8	302310	302317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_015416	TGA	2	6	302327	302332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015416	GCC	2	6	302365	302370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015416	GCA	2	6	302372	302377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015416	AGGAT	2	10	302390	302399	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015416	TCA	2	6	302423	302428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015416	TGCCG	2	10	302616	302625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_015416	TCC	2	6	302642	302647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_015416	CGG	2	6	302754	302759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015416	GCC	2	6	302842	302847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015416	GGT	2	6	302880	302885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015416	GAG	2	6	302917	302922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015416	CGC	2	6	302963	302968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_015416	TCGAT	2	10	303052	303061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_015416	GCCT	2	8	303063	303070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_015416	TCA	2	6	303101	303106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015416	ATC	2	6	303118	303123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015416	AGG	2	6	303311	303316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015416	TGAA	2	8	304258	304265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015416	AAAT	2	8	304285	304292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015416	AGG	2	6	304336	304341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015416	TTG	2	6	304357	304362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015416	TGC	2	6	305330	305335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015416	TAATT	2	10	305437	305446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015416	TTC	2	6	305564	305569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015416	TAT	2	6	305576	305581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015416	GTC	2	6	305602	305607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015416	GGGA	2	8	305616	305623	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015416	CAG	2	6	306792	306797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015416	TAT	2	6	307552	307557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015416	AGG	2	6	309321	309326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015416	ATA	2	6	309452	309457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015416	AAT	2	6	309514	309519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015416	T	8	8	309524	309531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015416	ATT	2	6	309553	309558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015416	GCC	2	6	309574	309579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015416	TCC	2	6	309640	309645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015416	TAT	2	6	309745	309750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015416	ATC	2	6	310831	310836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015416	GT	3	6	310860	310865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015416	CAG	2	6	310870	310875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015416	TCT	2	6	310888	310893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015416	ATC	2	6	310903	310908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015416	CCA	2	6	311036	311041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_015416	GCA	2	6	316423	316428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015416	TAGT	2	8	316436	316443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015416	A	6	6	316537	316542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015416	TGAT	2	8	317492	317499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015416	TAAA	2	8	317513	317520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015416	CAG	2	6	317608	317613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015416	GCT	2	6	317627	317632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015416	AAT	2	6	319281	319286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015416	TGG	2	6	319356	319361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015416	TC	4	8	321525	321532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015416	TTCCA	2	10	322441	322450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_015416	GAA	2	6	324445	324450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015416	CAT	2	6	324512	324517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015416	CAT	2	6	324527	324532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015416	TTC	2	6	324536	324541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015416	ATA	2	6	324547	324552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015416	ATTAT	2	10	324566	324575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015416	AGGC	2	8	324593	324600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_015416	GT	3	6	324601	324606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015416	TGCGA	2	10	324622	324631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1138	NC_015416	TGT	2	6	324637	324642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015416	CTAAG	2	10	324655	324664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1143	NC_015416	GCT	2	6	326347	326352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_015416	GGAT	2	8	326424	326431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_015416	G	6	6	326692	326697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_015416	AG	3	6	326827	326832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1153	NC_015416	GAAA	2	8	329580	329587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_015416	CAC	2	6	329682	329687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1155	NC_015416	A	7	7	329746	329752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_015416	TGC	2	6	330635	330640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1158	NC_015416	GCA	2	6	331152	331157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_015416	TC	3	6	332680	332685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1162	NC_015416	GAA	2	6	332702	332707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_015416	ATG	2	6	333206	333211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_015416	TA	3	6	378801	378806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_015416	AATT	2	8	381685	381692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_015416	CCA	2	6	381764	381769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1259	NC_015416	CAT	2	6	381798	381803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_015416	TCA	2	6	381809	381814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_015416	ATC	2	6	381815	381820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1263	NC_015416	CG	3	6	381855	381860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1264	NC_015416	T	7	7	381876	381882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_015416	TCT	3	9	381905	381913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_015416	TAG	2	6	382007	382012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_015416	AC	3	6	382024	382029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_015416	TG	3	6	382074	382079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_015416	TAC	2	6	382149	382154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1279	NC_015416	TAC	2	6	383096	383101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1391	NC_015416	ATC	2	6	410728	410733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1392	NC_015416	ATCTA	2	10	411595	411604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1393	NC_015416	TGTAT	2	10	411617	411626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1394	NC_015416	TCA	2	6	411736	411741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1395	NC_015416	AGA	2	6	411754	411759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1396	NC_015416	CATC	2	8	411812	411819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1397	NC_015416	TGTGG	2	10	412226	412235	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1398	NC_015416	GTG	2	6	412275	412280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_015416	GAA	2	6	412364	412369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_015416	ATT	2	6	412416	412421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_015416	A	7	7	412582	412588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_015416	AAG	2	6	412593	412598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_015416	A	8	8	412720	412727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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