MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015387	AT	3	6	20764	20769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015387	CA	4	8	25854	25861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015387	CG	3	6	25905	25910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015387	CG	3	6	27095	27100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015387	CG	3	6	27918	27923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015387	AT	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015387	GC	3	6	31875	31880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015387	TA	3	6	44073	44078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015387	TC	3	6	47293	47298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015387	TC	3	6	48420	48425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015387	GA	3	6	48951	48956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015387	AG	3	6	49795	49800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015387	CT	3	6	52317	52322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015387	CT	3	6	52636	52641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015387	AG	3	6	54165	54170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015387	TA	3	6	54444	54449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015387	AT	3	6	71663	71668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015387	TA	3	6	71699	71704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015387	CG	3	6	71716	71721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015387	GC	3	6	71801	71806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015387	TA	3	6	85232	85237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015387	GT	3	6	96080	96085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015387	AG	3	6	116453	116458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015387	GT	3	6	119124	119129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015387	GT	3	6	120452	120457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015387	GC	3	6	122238	122243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015387	CT	3	6	122373	122378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015387	GT	3	6	127443	127448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015387	TA	4	8	129701	129708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015387	CG	3	6	142831	142836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015387	GC	3	6	154541	154546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015387	CG	4	8	157067	157074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015387	CG	3	6	166278	166283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015387	GC	3	6	166320	166325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015387	GC	4	8	170115	170122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015387	GA	3	6	180343	180348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015387	AC	3	6	180768	180773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015387	CG	3	6	180906	180911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015387	AG	3	6	181004	181009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015387	CG	3	6	197368	197373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015387	TG	3	6	206386	206391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015387	CG	3	6	217734	217739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015387	CG	3	6	224041	224046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015387	CG	3	6	236972	236977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015387	GC	4	8	236992	236999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015387	GC	3	6	241325	241330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015387	GC	3	6	241436	241441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015387	GC	3	6	249956	249961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015387	GT	3	6	250028	250033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015387	CT	3	6	251425	251430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015387	AG	3	6	251538	251543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015387	GC	3	6	252081	252086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015387	GC	3	6	253800	253805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015387	CG	4	8	264860	264867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015387	TA	3	6	274029	274034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015387	CG	3	6	274886	274891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015387	GT	3	6	275311	275316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015387	CG	3	6	275764	275769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015387	GC	3	6	276727	276732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015387	CG	3	6	277434	277439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015387	GC	3	6	277633	277638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015387	GC	3	6	279305	279310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015387	GC	3	6	279493	279498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015387	CG	3	6	289709	289714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015387	TC	3	6	290881	290886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015387	GC	3	6	291119	291124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015387	GC	4	8	291426	291433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015387	CG	3	6	291697	291702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015387	GC	3	6	304234	304239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015387	GC	3	6	308173	308178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015387	GC	3	6	308825	308830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015387	GC	3	6	309015	309020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015387	GC	3	6	309063	309068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015387	AC	3	6	309417	309422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015387	AC	3	6	309587	309592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015387	CA	3	6	309743	309748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015387	TG	3	6	312492	312497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015387	CT	3	6	314985	314990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015387	CT	3	6	315305	315310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015387	CG	3	6	317122	317127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015387	CG	4	8	321608	321615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015387	GC	3	6	329304	329309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015387	CG	3	6	329347	329352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015387	CG	3	6	337179	337184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015387	GC	3	6	340758	340763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015387	CG	3	6	342944	342949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015387	TA	3	6	353106	353111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015387	CG	4	8	358686	358693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015387	CG	3	6	362639	362644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015387	GC	3	6	377685	377690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015387	GC	3	6	382286	382291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015387	CG	4	8	382835	382842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015387	TG	3	6	388938	388943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015387	AC	3	6	418256	418261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015387	GT	3	6	418923	418928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015387	AC	3	6	441201	441206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015387	CG	4	8	441642	441649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015387	CG	3	6	461469	461474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015387	CG	4	8	461490	461497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015387	TA	3	6	472099	472104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015387	CT	3	6	478673	478678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015387	CG	3	6	478807	478812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015387	GC	3	6	499939	499944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015387	TG	3	6	500888	500893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015387	AC	3	6	503659	503664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015387	GC	3	6	503768	503773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015387	CT	3	6	504893	504898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015387	GC	3	6	512220	512225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015387	GC	3	6	522030	522035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015387	GC	3	6	532974	532979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015387	CG	4	8	540629	540636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015387	GC	3	6	553178	553183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015387	AC	3	6	555372	555377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015387	GC	3	6	562336	562341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015387	GC	3	6	564444	564449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015387	GC	3	6	580121	580126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015387	GC	3	6	599132	599137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015387	GC	4	8	604176	604183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015387	GC	3	6	604203	604208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015387	GC	3	6	614860	614865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015387	CA	3	6	615607	615612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015387	TG	3	6	615614	615619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015387	GC	3	6	615717	615722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015387	CG	3	6	617618	617623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015387	TG	3	6	620439	620444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015387	TA	3	6	694247	694252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015387	GC	3	6	699987	699992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015387	GC	3	6	748477	748482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015387	GC	3	6	757148	757153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015387	GC	5	10	766149	766158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015387	GC	3	6	766341	766346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015387	CT	3	6	766681	766686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015387	CT	3	6	767003	767008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015387	CG	3	6	768770	768775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015387	CG	3	6	768988	768993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015387	AC	3	6	775934	775939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015387	AG	3	6	777718	777723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015387	GA	3	6	778038	778043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015387	CG	3	6	778340	778345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015387	CG	3	6	808760	808765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015387	CG	3	6	811102	811107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015387	CT	3	6	816547	816552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015387	CT	3	6	816867	816872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015387	CG	3	6	833761	833766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015387	GC	3	6	839750	839755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015387	CT	3	6	839786	839791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015387	TC	3	6	839899	839904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015387	CT	3	6	873695	873700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015387	GC	3	6	885268	885273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015387	GA	3	6	888170	888175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015387	CG	3	6	889025	889030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015387	CG	3	6	907542	907547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015387	CG	3	6	907556	907561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.