MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 3970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015387	GCCC	2	8	241050	241057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_015387	G	6	6	241094	241099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015387	CGTG	2	8	241110	241117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_015387	AAGC	2	8	241203	241210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_015387	GAGCA	2	10	241234	241243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_015387	GC	3	6	241325	241330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015387	GGC	2	6	241359	241364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015387	CGCTG	2	10	241397	241406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
509	NC_015387	GC	3	6	241436	241441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015387	TCC	2	6	243672	243677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_015387	TGCAG	2	10	243689	243698	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_015387	AGG	3	9	243726	243734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015387	CCT	2	6	248892	248897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015387	CGC	2	6	248942	248947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015387	CCA	3	9	248968	248976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015387	GCA	2	6	248994	248999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015387	GAGGGC	2	12	249851	249862	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_015387	CCGG	2	8	249876	249883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_015387	CCGG	2	8	249892	249899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015387	TGG	2	6	249907	249912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015387	CCT	2	6	249937	249942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015387	GC	3	6	249956	249961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_015387	GT	3	6	250028	250033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015387	T	6	6	251180	251185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015387	G	6	6	251254	251259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015387	GTC	2	6	251299	251304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015387	TACCGT	2	12	251357	251368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015387	CT	3	6	251425	251430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_015387	GCC	2	6	251448	251453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_015387	CTGG	2	8	251459	251466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
531	NC_015387	AGG	2	6	251470	251475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015387	CTT	2	6	251499	251504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015387	TGC	2	6	251506	251511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015387	AG	3	6	251538	251543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015387	GCTG	2	8	251922	251929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_015387	G	6	6	251985	251990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015387	GCG	2	6	252003	252008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015387	ACG	2	6	252034	252039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015387	GC	3	6	252081	252086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_015387	CGG	2	6	252088	252093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015387	GGA	2	6	252094	252099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015387	AGGTG	2	10	252120	252129	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015387	GGAA	2	8	252166	252173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015387	AGG	2	6	252180	252185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015387	G	6	6	253354	253359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015387	GCA	2	6	253397	253402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015387	GGAGGG	2	12	253418	253429	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015387	GC	3	6	253800	253805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015387	CGG	2	6	253817	253822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015387	CGG	2	6	253835	253840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015387	GTG	2	6	253873	253878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015387	TGC	2	6	254041	254046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015387	G	6	6	254048	254053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015387	T	6	6	254100	254105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015387	GTT	2	6	254237	254242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015387	T	6	6	254286	254291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015387	AGG	2	6	254328	254333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015387	GCC	2	6	254619	254624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_015387	AAACG	2	10	254631	254640	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_015387	GCA	2	6	254642	254647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015387	GGAG	2	8	254650	254657	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015387	CCGG	2	8	256896	256903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015387	CCGG	2	8	256918	256925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015387	GCCCC	2	10	256949	256958	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
565	NC_015387	GCG	2	6	256968	256973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015387	GGA	2	6	257016	257021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015387	CG	4	8	264860	264867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015387	GCC	2	6	266294	266299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_015387	G	6	6	266349	266354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015387	CGC	2	6	266363	266368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_015387	GGC	2	6	266379	266384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015387	ATT	2	6	273951	273956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015387	TA	3	6	274029	274034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015387	GCC	2	6	274169	274174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_015387	GAGG	2	8	274305	274312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015387	CGACC	2	10	274465	274474	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
577	NC_015387	GCAACG	2	12	274526	274537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015387	CGT	2	6	274541	274546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015387	C	6	6	274608	274613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
580	NC_015387	TTG	2	6	274624	274629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015387	GGTTT	2	10	274740	274749	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015387	CG	3	6	274886	274891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015387	G	7	7	274955	274961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015387	CAT	2	6	275093	275098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015387	GCA	2	6	275099	275104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015387	GT	3	6	275311	275316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015387	CGC	2	6	275387	275392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015387	CGGG	2	8	275468	275475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
589	NC_015387	G	6	6	275689	275694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015387	CG	3	6	275764	275769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015387	CCT	2	6	275911	275916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_015387	CGT	2	6	275976	275981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015387	TTG	2	6	275999	276004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015387	ACCTC	2	10	276061	276070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
595	NC_015387	ACGGGC	2	12	276125	276136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015387	GCG	2	6	276272	276277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015387	TTG	2	6	276368	276373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015387	CAG	2	6	276432	276437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015387	GCT	2	6	276558	276563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015387	TAC	2	6	276657	276662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015387	GC	3	6	276727	276732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_015387	TCG	2	6	277000	277005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015387	GCG	2	6	277141	277146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015387	GCTC	2	8	277155	277162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_015387	CGGT	2	8	277293	277300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_015387	A	6	6	277301	277306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015387	CG	3	6	277434	277439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_015387	CCA	2	6	277450	277455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015387	TGCG	2	8	277519	277526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_015387	GCG	2	6	277555	277560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015387	AGC	2	6	277599	277604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015387	GC	3	6	277633	277638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_015387	C	7	7	277940	277946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
614	NC_015387	GCC	2	6	277977	277982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_015387	GAG	2	6	278080	278085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015387	GGTG	2	8	278114	278121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015387	TTAA	2	8	278126	278133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015387	GGC	2	6	278161	278166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015387	ACC	2	6	278190	278195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015387	TTC	2	6	278249	278254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015387	ACC	2	6	278268	278273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_015387	TCC	2	6	278286	278291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_015387	AGG	2	6	278301	278306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015387	TCC	2	6	278413	278418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015387	GAT	2	6	278427	278432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015387	CTT	2	6	278439	278444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015387	GGA	2	6	278509	278514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015387	CCT	2	6	278526	278531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_015387	CGC	2	6	278674	278679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015387	GTG	2	6	278761	278766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015387	GCC	2	6	278876	278881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015387	CGGGCC	2	12	278990	279001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015387	AAGCA	2	10	279126	279135	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
634	NC_015387	AAG	2	6	279194	279199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015387	TCA	2	6	279216	279221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015387	AAG	2	6	279240	279245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015387	GGT	2	6	279277	279282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015387	GC	3	6	279305	279310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_015387	GAG	2	6	279386	279391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015387	GGGT	2	8	279469	279476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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