MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinomonas mediterranea MMB-1 chromosome

Total Repeats: 502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015276	TCGCT	2	10	16649	16658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015276	TCGAC	2	10	26511	26520	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015276	AATAA	2	10	27930	27939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015276	AGGAG	2	10	93231	93240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015276	ATTCT	2	10	104137	104146	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015276	AGAGA	2	10	123657	123666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015276	TTAGT	2	10	127401	127410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015276	TTTGC	2	10	127721	127730	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015276	ATTCA	2	10	128172	128181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015276	CCCCT	2	10	139656	139665	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_015276	TCCCC	2	10	141173	141182	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_015276	CTTAA	2	10	150387	150396	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015276	GCATG	2	10	167082	167091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015276	ATAGG	2	10	185047	185056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015276	ATAAG	2	10	216190	216199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015276	CCTTT	2	10	219568	219577	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015276	AATAA	2	10	223230	223239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015276	GGTAT	2	10	234382	234391	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015276	AGTTG	2	10	251240	251249	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015276	GCGCG	2	10	272262	272271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015276	GTTGT	2	10	284377	284386	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015276	GATCT	2	10	290768	290777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015276	AGTCG	2	10	309959	309968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015276	CAGGG	2	10	310180	310189	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015276	ATCCC	2	10	312047	312056	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_015276	CTTTC	2	10	312320	312329	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015276	GTTTT	2	10	328473	328482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015276	TTTTG	2	10	343029	343038	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015276	TGAAT	2	10	343092	343101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015276	CTGTG	2	10	377867	377876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015276	GGATA	2	10	423332	423341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015276	AATCG	2	10	425066	425075	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015276	ATGTC	2	10	433837	433846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015276	CGACA	2	10	434619	434628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015276	TGAGA	2	10	445827	445836	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015276	TATTT	2	10	456685	456694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015276	ACCAA	2	10	482859	482868	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015276	TGAAT	2	10	485474	485483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015276	GCTTA	2	10	486744	486753	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015276	AACCA	2	10	486839	486848	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015276	CTAAA	2	10	492973	492982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015276	AGGTG	2	10	495707	495716	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015276	GAATT	2	10	505646	505655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015276	CTTTC	3	15	514197	514211	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015276	GAATT	2	10	521933	521942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015276	TAGGG	2	10	522961	522970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015276	AGAAC	2	10	547880	547889	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015276	GTTGA	2	10	556945	556954	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015276	TGTTA	2	10	567538	567547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015276	TTTTA	2	10	569543	569552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015276	CTATT	2	10	569562	569571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015276	AAGGG	2	10	579848	579857	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015276	TTATT	2	10	580171	580180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015276	GCAAT	2	10	599199	599208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015276	GCGGT	2	10	599235	599244	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015276	CTAAT	2	10	600079	600088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015276	CTATG	2	10	609552	609561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015276	ATTTA	2	10	621182	621191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015276	GAGAA	2	10	621194	621203	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015276	GAAAA	2	10	623456	623465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015276	CTAAT	2	10	633714	633723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015276	GAAGG	2	10	633789	633798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015276	TCAGC	2	10	662966	662975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015276	TTTCA	2	10	674985	674994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015276	TCAAA	2	10	676526	676535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015276	GACTA	2	10	678097	678106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015276	TTTTC	2	10	679384	679393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015276	AAGCT	2	10	681507	681516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015276	AACCG	2	10	693903	693912	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015276	TTTTA	2	10	702870	702879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015276	TCCAA	2	10	710323	710332	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015276	GAATT	2	10	713624	713633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015276	TTAAA	2	10	718370	718379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015276	TTCTT	2	10	720613	720622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015276	CTTTT	2	10	720626	720635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015276	AAATA	2	10	721730	721739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015276	TTCTA	2	10	752534	752543	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015276	CTTCA	2	10	754489	754498	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015276	AAATA	2	10	793446	793455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015276	TTTCT	2	10	799223	799232	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015276	GCGTT	2	10	799364	799373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015276	GTGTT	2	10	807733	807742	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015276	AGTCG	2	10	812456	812465	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015276	CAGGG	2	10	812677	812686	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015276	ATCCC	2	10	814545	814554	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015276	AAACT	2	10	815073	815082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015276	CCCCA	2	10	817412	817421	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_015276	TTTTA	2	10	821977	821986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015276	ATGTG	2	10	860757	860766	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015276	GTATC	2	10	878346	878355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015276	GTTAC	2	10	881965	881974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015276	TGCGC	2	10	882962	882971	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015276	AAGAT	2	10	888184	888193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015276	AGGCC	2	10	891494	891503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015276	GAGTA	2	10	892846	892855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015276	CGTAA	2	10	897244	897253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015276	GATCA	2	10	897738	897747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015276	AGCGT	2	10	900458	900467	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015276	TTTGT	2	10	904509	904518	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015276	AGCTG	2	10	906027	906036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015276	TATTG	2	10	913114	913123	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015276	ATACT	2	10	925960	925969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015276	TTTAG	2	10	932831	932840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015276	TTTAG	2	10	970084	970093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015276	GTATG	2	10	975331	975340	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015276	AATAA	2	10	1033461	1033470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015276	GTAGT	2	10	1034777	1034786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015276	AAGTT	2	10	1045438	1045447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015276	ATTTA	2	10	1089830	1089839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015276	AAATT	2	10	1090034	1090043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015276	CGTTA	2	10	1109051	1109060	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015276	TGCCT	5	25	1126870	1126894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015276	CTTTT	2	10	1154598	1154607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015276	GGTTT	2	10	1158008	1158017	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015276	TAATT	2	10	1165206	1165215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015276	TTCTG	2	10	1173895	1173904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015276	TTACT	2	10	1183831	1183840	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015276	AATGT	2	10	1198589	1198598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015276	CTTTT	2	10	1216432	1216441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015276	CAATG	2	10	1244488	1244497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015276	TCTTT	2	10	1247938	1247947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015276	TTGAT	2	10	1249882	1249891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015276	AAACT	2	10	1262316	1262325	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015276	GGTTG	2	10	1299291	1299300	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015276	CAATT	2	10	1300812	1300821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015276	AAGGT	2	10	1305579	1305588	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015276	CACGA	2	10	1306018	1306027	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015276	TTAAC	2	10	1341212	1341221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015276	TTGAA	2	10	1344433	1344442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015276	TATTT	2	10	1377542	1377551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015276	AACGT	2	10	1387878	1387887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015276	TTTAA	2	10	1391899	1391908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015276	AAGAA	2	10	1397549	1397558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015276	TTTTA	2	10	1404940	1404949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015276	TTTAT	2	10	1410331	1410340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015276	CCCCG	2	10	1415567	1415576	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
137	NC_015276	TCTTT	2	10	1424696	1424705	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015276	TTCAG	2	10	1446453	1446462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015276	CGGTA	2	10	1467253	1467262	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015276	TAAAA	2	10	1473943	1473952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015276	CCTAC	2	10	1475921	1475930	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_015276	AAATA	2	10	1476084	1476093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015276	TAGAT	2	10	1479074	1479083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015276	TAGAA	2	10	1483302	1483311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015276	AAGGG	2	10	1498742	1498751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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