MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis KI3806

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015153	ACTAA	2	10	6980	6989	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015153	TGTAG	2	10	38488	38497	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015153	TAATT	2	10	45136	45145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015153	CAAAG	2	10	75925	75934	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015153	ATTAA	2	10	77291	77300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015153	AAAAC	2	10	109910	109919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015153	ATTTA	2	10	117315	117324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015153	TTAAA	2	10	126662	126671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015153	GAAAA	2	10	139045	139054	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015153	AGTTC	2	10	140302	140311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015153	AATAA	2	10	155952	155961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015153	TAAAT	2	10	163919	163928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015153	TTAAT	2	10	176474	176483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015153	GAAAA	2	10	180649	180658	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015153	ACTCT	2	10	183421	183430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015153	TCTTT	2	10	183471	183480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015153	CGCTT	2	10	183717	183726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015153	TCTTT	2	10	183919	183928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015153	TAGGA	2	10	185297	185306	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015153	TCTTT	2	10	185361	185370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015153	TTTAA	2	10	185629	185638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015153	TTTAG	2	10	215626	215635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015153	TAAAT	2	10	223883	223892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015153	ATTTA	2	10	246571	246580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015153	TCTTT	2	10	261657	261666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015153	GAAAG	2	10	273284	273293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015153	ACTTT	2	10	273333	273342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015153	CTTTT	2	10	284910	284919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015153	GAAAA	2	10	288004	288013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015153	GAAAT	2	10	288831	288840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015153	AATTT	2	10	288990	288999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015153	AAGTT	2	10	290347	290356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015153	GTTAA	2	10	290490	290499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015153	AAATT	2	10	290855	290864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015153	TAAGA	2	10	309426	309435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015153	ATTTT	2	10	309452	309461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015153	ACTAA	2	10	313688	313697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015153	AGATT	2	10	319135	319144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015153	TCCCT	2	10	334971	334980	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015153	AGAGG	2	10	339778	339787	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015153	AATTA	2	10	357746	357755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015153	AGTCT	2	10	359710	359719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015153	ATTTA	2	10	383339	383348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015153	ATTTA	2	10	417306	417315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015153	TTAAT	2	10	418047	418056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015153	CTTCT	2	10	419275	419284	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015153	AATTA	2	10	427546	427555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015153	AACTT	2	10	430506	430515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015153	AGAAA	2	10	445374	445383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015153	AAAAG	2	10	446111	446120	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015153	AAATT	2	10	453842	453851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015153	GAAAA	2	10	455034	455043	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015153	AAGAG	2	10	456780	456789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015153	ACTTA	2	10	456792	456801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015153	AGCTA	2	10	464265	464274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015153	AAATT	2	10	467163	467172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015153	TTCAA	2	10	475387	475396	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015153	AACTA	2	10	482102	482111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015153	AAATT	2	10	492946	492955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015153	AGGAG	2	10	492986	492995	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015153	CTTAA	2	10	496062	496071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015153	TGAAT	2	10	496343	496352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015153	TCTTT	2	10	502965	502974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015153	AAAAT	2	10	503601	503610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015153	AGAAA	2	10	519817	519826	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015153	AGTTA	2	10	522253	522262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015153	TTAAA	2	10	524189	524198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015153	TAAGT	2	10	524254	524263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015153	CGCTG	2	10	530518	530527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015153	AATTT	2	10	536185	536194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015153	TTTAA	2	10	553369	553378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015153	ATTAA	2	10	564089	564098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015153	GGCTG	2	10	574034	574043	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015153	TTTCT	2	10	575962	575971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015153	TATTT	2	10	576684	576693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015153	GAAAA	2	10	581468	581477	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015153	AATTA	2	10	581526	581535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015153	AGTTA	2	10	581628	581637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015153	CAGGG	2	10	586745	586754	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015153	TTTCT	2	10	587565	587574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015153	AAAAG	2	10	589831	589840	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015153	CAATC	2	10	590054	590063	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015153	CTAAA	2	10	597506	597515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015153	CATTC	2	10	598102	598111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015153	GTTAA	2	10	599122	599131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015153	TAAAT	2	10	599150	599159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015153	GAAAA	2	10	600082	600091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015153	TTAAT	2	10	602992	603001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015153	GTTTG	2	10	606601	606610	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015153	AATTA	2	10	609409	609418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015153	GAAAA	2	10	620228	620237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015153	TAAAA	2	10	621838	621847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015153	AATTA	2	10	621962	621971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015153	GAAAA	2	10	622180	622189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015153	CTAGT	2	10	623108	623117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015153	CAAAT	2	10	625093	625102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015153	TCCCC	2	10	625632	625641	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_015153	CTTAA	2	10	625643	625652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015153	ACTTA	2	10	627981	627990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015153	AAATT	2	10	631598	631607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015153	AATGG	2	10	631667	631676	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015153	AAAGC	2	10	635423	635432	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015153	TTGTT	2	10	635467	635476	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015153	TAAAA	2	10	635482	635491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015153	CTTAA	2	10	638085	638094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015153	TCTTT	2	10	643723	643732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015153	TTCTT	2	10	644929	644938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015153	AGAGA	2	10	653884	653893	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015153	CTAAA	2	10	654299	654308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015153	CTCTT	2	10	658209	658218	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015153	ATTAA	2	10	675163	675172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015153	GTTTT	2	10	683470	683479	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015153	TACCT	2	10	683560	683569	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015153	CTAAA	2	10	690502	690511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015153	CTAGT	2	10	706186	706195	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015153	TTAAA	2	10	706390	706399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.