MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma fermentans M64 chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014921	TTCATT	2	12	34	45	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014921	AAATGA	2	12	9122	9133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014921	TTTAGA	2	12	9437	9448	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014921	ATAAAA	2	12	12830	12841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014921	TTTTAT	2	12	15547	15558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014921	ATTAAA	2	12	19985	19996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014921	ATTTTT	2	12	20229	20240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014921	TAAAAA	2	12	22006	22017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014921	ATTAAA	2	12	26714	26725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014921	TTTAGT	2	12	91709	91720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014921	AATATA	2	12	99565	99576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014921	TATTAA	2	12	110647	110658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014921	AAATTT	2	12	110828	110839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014921	AAAATT	2	12	112025	112036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014921	AAATTT	2	12	114215	114226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014921	TAAAAA	2	12	123174	123185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014921	ATCTTT	2	12	129670	129681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014921	AAAAAT	2	12	131519	131530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014921	TAAAAA	2	12	141084	141095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014921	TAAAAT	2	12	148041	148052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014921	AATTTT	2	12	178545	178556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014921	ATTAAT	2	12	178830	178841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014921	TTATCT	2	12	194829	194840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014921	GTATTG	2	12	197998	198009	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014921	TTTAGT	2	12	228593	228604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014921	AATATA	2	12	235791	235802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014921	TATTAA	2	12	246873	246884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014921	ATTTTA	2	12	251447	251458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014921	TAAAAA	2	12	264206	264217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014921	AGAAAA	2	12	277608	277619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014921	ACATTA	2	12	279455	279466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014921	AAAATT	2	12	294638	294649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014921	ATTTAA	2	12	300790	300801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014921	AATATT	2	12	301763	301774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014921	TTTTAT	2	12	313195	313206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014921	AATTTT	2	12	318768	318779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014921	TTTTAT	2	12	348348	348359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014921	TAATTT	2	12	378520	378531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014921	ACTTTT	2	12	379899	379910	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014921	AATATT	2	12	388195	388206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014921	TAAAAT	2	12	392451	392462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014921	TATTTT	2	12	405702	405713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014921	ATTTTT	2	12	472023	472034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014921	TATTTT	2	12	488285	488296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014921	TTTTAA	2	12	510548	510559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014921	TAATAT	2	12	510763	510774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014921	TTTATA	2	12	522064	522075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014921	ATTTTT	2	12	537549	537560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014921	AAAATA	2	12	543819	543830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014921	AAAAAT	2	12	548259	548270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014921	TGTTTT	2	12	549531	549542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014921	ATTGAC	2	12	551778	551789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014921	GAATTA	2	12	562583	562594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014921	AAAAAT	2	12	576891	576902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014921	ATTTTT	2	12	584474	584485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014921	ATATAA	2	12	590039	590050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014921	AATATT	3	18	602427	602444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014921	ATTTTT	2	12	603424	603435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014921	AAAATT	2	12	625890	625901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014921	ATTTTT	2	12	639759	639770	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014921	TGCAAG	2	12	665141	665152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014921	ATAATT	2	12	672791	672802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014921	TTAATA	2	12	672803	672814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014921	CTCCAG	2	12	696163	696174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014921	TTAAAA	2	12	718091	718102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014921	TTTTTA	2	12	718294	718305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014921	CCAACT	2	12	723212	723223	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014921	ATTTCT	2	12	730276	730287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014921	TAAAAT	2	12	765175	765186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014921	TTCTTA	2	12	765324	765335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014921	ATTTTT	2	12	776261	776272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014921	CTCCAG	2	12	787252	787263	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014921	AAATAG	2	12	821654	821665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014921	ATTTAA	2	12	826291	826302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014921	TATGCT	2	12	826767	826778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014921	TAAAAT	2	12	830300	830311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014921	AAATAA	2	12	856771	856782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014921	TTTTAA	2	12	859172	859183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014921	CAATAA	2	12	869662	869673	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014921	TATTTT	2	12	886221	886232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014921	TCTTTT	2	12	934606	934617	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014921	AATTTT	2	12	984353	984364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014921	ATTTGT	2	12	992726	992737	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014921	TATATT	2	12	1001259	1001270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014921	TAAATA	2	12	1017438	1017449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014921	TATTAA	2	12	1038131	1038142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014921	ATTTTT	2	12	1053484	1053495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014921	TTAACT	2	12	1079609	1079620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014921	AAAAAT	2	12	1088019	1088030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.