MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 plasmid pMESCI01

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014918	TGGC	2	8	7663	7670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014918	GATC	2	8	11292	11299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014918	CGGA	2	8	11758	11765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014918	CGGA	2	8	15786	15793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014918	CGGA	2	8	16193	16200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014918	ACTG	2	8	16219	16226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014918	CGAA	2	8	16354	16361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014918	CAGC	2	8	17304	17311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014918	GTTT	2	8	20009	20016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014918	GCTT	2	8	20204	20211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014918	TCGG	2	8	20327	20334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014918	TGCG	2	8	20412	20419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014918	GCCG	2	8	20479	20486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014918	GTGG	2	8	20975	20982	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014918	GGGC	2	8	20997	21004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014918	AGGA	2	8	21181	21188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014918	GTCA	2	8	21205	21212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014918	CAGC	2	8	21474	21481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014918	CAGG	2	8	21909	21916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014918	CGGC	2	8	21985	21992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014918	GCAG	2	8	22093	22100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014918	GGAT	2	8	22127	22134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014918	ATGG	2	8	22471	22478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014918	CAAG	2	8	29699	29706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014918	CGCC	2	8	29900	29907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_014918	CGGC	2	8	29908	29915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014918	CGTC	2	8	30261	30268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014918	GGCC	2	8	30801	30808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014918	TGTC	2	8	32635	32642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014918	CAAG	2	8	34433	34440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014918	CACG	2	8	37241	37248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014918	GGAT	2	8	38836	38843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014918	GGGC	2	8	43479	43486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014918	TTCC	2	8	43627	43634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014918	TGCG	2	8	43705	43712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014918	TCAG	2	8	45289	45296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014918	CCGT	2	8	45577	45584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014918	GCCC	2	8	50100	50107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_014918	GGCT	2	8	56440	56447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014918	AGCG	2	8	58414	58421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014918	GCCA	2	8	58650	58657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014918	TCCC	2	8	58688	58695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014918	GTTC	2	8	60173	60180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014918	GATT	2	8	63284	63291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014918	AAGT	2	8	63403	63410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014918	TGCT	2	8	64058	64065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014918	TGTT	2	8	64091	64098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014918	TGCG	2	8	64524	64531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014918	TGAT	2	8	64869	64876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014918	AAGG	2	8	65314	65321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014918	GACA	2	8	65822	65829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014918	GCAA	2	8	65956	65963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014918	CAAG	2	8	65970	65977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014918	GATC	2	8	66122	66129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014918	TCAA	2	8	67930	67937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014918	TCGG	2	8	68151	68158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014918	ATCC	2	8	68176	68183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014918	ATCC	2	8	69098	69105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014918	GGGA	2	8	69228	69235	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014918	CCAT	2	8	71011	71018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014918	GAAG	2	8	71065	71072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014918	ACAT	2	8	71088	71095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014918	GCCA	2	8	71348	71355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014918	GATG	2	8	71786	71793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014918	GGTC	2	8	71864	71871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014918	GCTG	2	8	71874	71881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014918	CGGT	2	8	73068	73075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014918	GCCT	2	8	73996	74003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014918	CATT	2	8	75124	75131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014918	GAGC	2	8	80421	80428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014918	CCCT	2	8	80488	80495	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014918	GCAG	2	8	81133	81140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014918	CTGG	2	8	81950	81957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014918	GGAG	2	8	83514	83521	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014918	CAAG	2	8	83655	83662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014918	TCGG	2	8	83720	83727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014918	GGAC	2	8	89601	89608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014918	AGGT	2	8	89891	89898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014918	GATC	2	8	89969	89976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014918	GCAA	2	8	90891	90898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014918	GCCG	2	8	91253	91260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014918	GCTG	2	8	96983	96990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014918	CGAG	2	8	97335	97342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014918	CGAA	2	8	98098	98105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014918	GACA	2	8	100330	100337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014918	TGGC	2	8	101254	101261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014918	CTGC	2	8	101411	101418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014918	ATCG	2	8	103043	103050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014918	TCCC	2	8	104342	104349	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_014918	ATGC	2	8	105542	105549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014918	AGCG	2	8	105600	105607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014918	GGCG	2	8	105617	105624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014918	CAAC	2	8	105638	105645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014918	TGGT	2	8	105671	105678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014918	GTTG	2	8	106071	106078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014918	TCAT	2	8	106113	106120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014918	TGTC	2	8	108336	108343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014918	CCCG	2	8	110402	110409	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014918	CAAA	2	8	110462	110469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014918	AGGA	2	8	110735	110742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014918	TTGG	2	8	111385	111392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014918	TCAT	2	8	112794	112801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014918	GGCG	2	8	116578	116585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014918	GATG	2	8	116666	116673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014918	GGCG	2	8	117064	117071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014918	GGGA	2	8	121317	121324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014918	CTGG	2	8	127339	127346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014918	CTAT	2	8	129521	129528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014918	CGTG	2	8	131284	131291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014918	TGCC	2	8	131785	131792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014918	TTCC	2	8	135609	135616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014918	CGCC	2	8	135778	135785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_014918	GTGC	2	8	138015	138022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014918	ATCT	2	8	138129	138136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014918	TCCT	2	8	138171	138178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014918	TTCG	2	8	149356	149363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014918	GCTG	2	8	149733	149740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014918	ATTC	2	8	150320	150327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014918	AGGC	2	8	160204	160211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014918	TTGT	2	8	165993	166000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014918	GTGC	2	8	173829	173836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014918	ATCT	2	8	177478	177485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014918	TCTT	2	8	183107	183114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014918	AGGC	2	8	183210	183217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014918	TCCT	2	8	183326	183333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014918	CACC	2	8	184172	184179	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_014918	GTTC	2	8	184532	184539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014918	GGTC	2	8	188550	188557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014918	TCCT	2	8	189179	189186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014918	TCGC	2	8	199032	199039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014918	CAAA	2	8	201548	201555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014918	CGCT	2	8	203310	203317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014918	GCCC	2	8	203728	203735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_014918	AGAC	2	8	203762	203769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014918	CGAG	2	8	204037	204044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014918	TGCC	2	8	204623	204630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014918	GAAA	2	8	206665	206672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014918	GACG	2	8	213231	213238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014918	GCTC	2	8	213453	213460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014918	GAAA	2	8	223254	223261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014918	CAAA	2	8	223321	223328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014918	CTGG	2	8	223363	223370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014918	ATGC	2	8	223453	223460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014918	GCTA	2	8	233279	233286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014918	CGAT	2	8	233402	233409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014918	CGGT	2	8	233699	233706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014918	CTAA	2	8	234211	234218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014918	CCAT	2	8	234374	234381	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014918	GAAG	2	8	234685	234692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014918	GCCC	2	8	234729	234736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014918	AGGG	2	8	235255	235262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014918	GCCT	2	8	235453	235460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014918	CGCT	2	8	235471	235478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014918	AGGC	2	8	236971	236978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014918	CGAG	2	8	237284	237291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_014918	TGGC	2	8	237328	237335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_014918	CGGC	2	8	237782	237789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_014918	CCTT	2	8	237839	237846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_014918	GCGG	2	8	238544	238551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014918	GAAG	2	8	238555	238562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014918	AGTG	2	8	238628	238635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014918	ATCG	2	8	238888	238895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_014918	AGCG	2	8	239146	239153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_014918	ACGG	2	8	239341	239348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_014918	GCCG	2	8	243874	243881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_014918	GGTG	2	8	243895	243902	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014918	GGCG	2	8	245824	245831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_014918	CTTG	2	8	246937	246944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014918	GGGC	2	8	247615	247622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
173	NC_014918	GATC	2	8	248695	248702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_014918	GGGC	2	8	249984	249991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
175	NC_014918	CGCT	2	8	250138	250145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_014918	TCGA	2	8	250427	250434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_014918	GAGC	2	8	250595	250602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_014918	ATCG	2	8	253130	253137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_014918	GGCG	2	8	253529	253536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
180	NC_014918	TTCC	2	8	262987	262994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014918	TGAG	2	8	263288	263295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014918	GTGG	2	8	263337	263344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014918	GCTG	2	8	274488	274495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_014918	GTGA	2	8	275417	275424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014918	ATCG	2	8	276096	276103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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187	NC_014918	TGGA	2	8	278299	278306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014918	CAGA	2	8	279602	279609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_014918	GGGT	2	8	279622	279629	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014918	AAGA	2	8	279666	279673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014918	GGGT	2	8	281295	281302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014918	CAAG	2	8	281309	281316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_014918	CGTT	2	8	281351	281358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
194	NC_014918	TCGA	2	8	281713	281720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_014918	TAGG	2	8	285096	285103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014918	AAGG	2	8	289084	289091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014918	GCTT	2	8	289627	289634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
198	NC_014918	ATGG	2	8	289756	289763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_014918	ACAT	2	8	343941	343948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
208	NC_014918	AGGC	3	12	347466	347477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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210	NC_014918	GAAG	2	8	360641	360648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
211	NC_014918	CGAC	2	8	361153	361160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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222	NC_014918	CGGC	2	8	382882	382889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
223	NC_014918	CATC	2	8	383667	383674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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231	NC_014918	GCGA	2	8	400690	400697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
232	NC_014918	TCCT	2	8	400723	400730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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239	NC_014918	TGCC	2	8	424281	424288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.