MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis PG45 chromosome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014760	TAAATA	2	12	71862	71873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014760	GTATTA	2	12	81140	81151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014760	TAATAT	2	12	111699	111710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014760	TGCTTC	2	12	159048	159059	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014760	TTTCAT	2	12	160947	160958	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014760	AAGCAA	2	12	165606	165617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014760	GTTTGC	2	12	165619	165630	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014760	TAAAAT	2	12	176679	176690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014760	ATATAA	2	12	176693	176704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014760	TATCTT	2	12	190178	190189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014760	TATCTT	2	12	191924	191935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014760	ATATTG	2	12	192456	192467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014760	TATCTT	2	12	193655	193666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014760	TAATGT	2	12	194318	194329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014760	TTATTT	2	12	198397	198408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014760	TTAGTT	2	12	204707	204718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014760	GACAAA	2	12	206098	206109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014760	TTGGTG	2	12	206117	206128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014760	TTATGG	2	12	206295	206306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014760	AAAATA	2	12	206553	206564	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014760	AATGGT	2	12	226273	226284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014760	TCTTTA	2	12	226861	226872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014760	CAAAAA	2	12	231815	231826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014760	TTAAAT	2	12	232202	232213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014760	ATTTTT	2	12	255635	255646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014760	TATCAG	2	12	257019	257030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014760	ATATTA	2	12	258198	258209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014760	TTTGCT	2	12	261766	261777	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014760	TTCTTT	2	12	271883	271894	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014760	TTCTTT	2	12	271985	271996	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014760	TTCTTT	2	12	272087	272098	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014760	TTCTTT	2	12	272189	272200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014760	TTCTTT	2	12	272291	272302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014760	TTCTTT	2	12	272393	272404	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014760	TTTTTA	2	12	288765	288776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014760	ACACTG	2	12	316839	316850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014760	CTGGAG	2	12	320442	320453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014760	ACACTG	2	12	321833	321844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014760	CTGGAG	2	12	325434	325445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014760	TAAACA	2	12	329366	329377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014760	TTTGTT	2	12	403920	403931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014760	TTTATT	2	12	414399	414410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014760	TACTTT	2	12	416967	416978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014760	AAAATA	2	12	472473	472484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014760	TCAATA	2	12	510574	510585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014760	ATTATA	2	12	539505	539516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014760	TCTCAT	2	12	568608	568619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014760	TCTATT	2	12	573816	573827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014760	AACCTT	2	12	588923	588934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014760	TCAAAT	2	12	589191	589202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014760	AAAGAA	2	12	589841	589852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014760	AAAGAA	2	12	590045	590056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014760	AAAGAA	2	12	590147	590158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014760	AGAAAA	2	12	590224	590235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014760	AAAAAT	2	12	592345	592356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014760	AATTAA	2	12	614644	614655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014760	TTTGTT	2	12	643004	643015	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014760	AAACTT	2	12	651456	651467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014760	TTTTTA	2	12	657961	657972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014760	AACAAA	2	12	667425	667436	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014760	TAGCTT	2	12	668672	668683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014760	GTAAAA	2	12	668935	668946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014760	ATTTTA	2	12	677692	677703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014760	CTAAAA	2	12	682798	682809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014760	CCAGAA	2	12	685793	685804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014760	ATTTTT	2	12	703123	703134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014760	ATGTTA	2	12	706683	706694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014760	ATTTTT	2	12	712857	712868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014760	AAATAA	2	12	716904	716915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014760	ATTTTT	2	12	721206	721217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014760	TTGATG	2	12	746033	746044	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014760	TCAATT	2	12	776423	776434	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014760	ATAATT	2	12	780769	780780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014760	TTTTTG	2	12	808236	808247	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014760	ATTTTT	2	12	811642	811653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014760	ACCTTT	2	12	814082	814093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014760	ATTTTT	2	12	831028	831039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014760	ATTTTT	2	12	861902	861913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014760	TTTATT	2	12	862038	862049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014760	ATTTTT	2	12	868593	868604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014760	ACCTTT	2	12	869610	869621	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014760	TATGCA	2	12	894226	894237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014760	ATATTA	2	12	897592	897603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014760	ATATAA	2	12	946435	946446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014760	ATTACT	2	12	951515	951526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014760	ACCTTT	2	12	980353	980364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014760	TAGAAT	2	12	981442	981453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.