MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis PG45 chromosome

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014760	ATATT	2	10	14517	14526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014760	AAGCA	2	10	28354	28363	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014760	AAAAT	2	10	49745	49754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014760	TCTTT	2	10	51234	51243	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014760	TTCTT	2	10	51245	51254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014760	TCTTT	2	10	52768	52777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014760	TTTAA	2	10	52862	52871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014760	TATAA	2	10	52923	52932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014760	TTGTC	2	10	60459	60468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014760	ACATT	2	10	64119	64128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014760	ATATA	2	10	81152	81161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014760	TATAA	2	10	113939	113948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014760	AGATG	2	10	114521	114530	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014760	TAAAT	2	10	129479	129488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014760	AAATA	2	10	145954	145963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014760	TAAAT	2	10	165364	165373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014760	TAGTT	2	10	165440	165449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014760	TTATG	2	10	179429	179438	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014760	AATTA	2	10	184355	184364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014760	ATTTG	2	10	184655	184664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014760	TCTTT	2	10	187458	187467	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014760	TTTAA	2	10	187552	187561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014760	TTTTG	2	10	187616	187625	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014760	ATTTG	2	10	190305	190314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014760	TAAAT	2	10	192400	192409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014760	ATTTC	2	10	194176	194185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014760	CATAA	2	10	194504	194513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014760	AAAGA	2	10	197470	197479	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014760	GAAAA	2	10	197950	197959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014760	GTTAA	2	10	199158	199167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014760	CTATA	2	10	207768	207777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014760	TAATG	2	10	207929	207938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014760	AATGA	2	10	208172	208181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014760	TCTGT	2	10	208325	208334	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014760	CAATT	2	10	208985	208994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014760	TAATT	2	10	209090	209099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014760	TTTTC	2	10	209140	209149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014760	TAAAT	2	10	209263	209272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014760	GAAAT	2	10	210739	210748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014760	TACTT	2	10	210802	210811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014760	TTGTT	2	10	212094	212103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014760	TCCAA	3	15	212354	212368	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014760	TAAAT	2	10	212638	212647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014760	ATTAA	2	10	212675	212684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014760	AATTT	2	10	212995	213004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014760	ATTAT	2	10	220599	220608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014760	TTAAA	2	10	222113	222122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014760	AAAGA	2	10	222207	222216	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014760	AACTT	2	10	228753	228762	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014760	CATTA	2	10	229835	229844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014760	TTTTC	2	10	232630	232639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014760	TGCAA	2	10	232939	232948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014760	ATTCT	2	10	235335	235344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014760	CTTTT	2	10	240173	240182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014760	CATTA	2	10	243878	243887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014760	TTAAA	2	10	246082	246091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014760	ATTTA	2	10	246319	246328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014760	ATTGG	3	15	246946	246960	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014760	TAATT	2	10	247202	247211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014760	AACAA	2	10	251588	251597	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014760	TTAAT	2	10	255320	255329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014760	ACACA	2	10	255460	255469	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014760	ATTTT	2	10	256911	256920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014760	TTTTG	2	10	270686	270695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014760	TTTTC	2	10	270765	270774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014760	ATCAA	2	10	270830	270839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014760	TTTTC	2	10	272557	272566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014760	TAATT	2	10	272830	272839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014760	ATATT	2	10	288977	288986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014760	AATTT	2	10	293468	293477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014760	ATTAT	2	10	294510	294519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014760	GTTTA	2	10	296722	296731	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014760	TAAAT	2	10	297323	297332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014760	TAAAA	2	10	297708	297717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014760	ATAAA	2	10	303456	303465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014760	TATTT	2	10	303597	303606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014760	TCGTG	2	10	317150	317159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014760	GCTAC	2	10	317439	317448	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014760	GAAAA	2	10	318140	318149	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014760	TCGTG	2	10	322144	322153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014760	GCTAC	2	10	322433	322442	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014760	GAAAA	2	10	323132	323141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014760	TATAA	2	10	326060	326069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014760	TAATA	2	10	335518	335527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014760	TTTAT	2	10	339209	339218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014760	AATTA	2	10	357178	357187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014760	TCTTT	2	10	367819	367828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014760	TTTAA	2	10	367913	367922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014760	TATAA	2	10	367965	367974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014760	TAAAA	2	10	368407	368416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014760	TAATT	2	10	379209	379218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014760	GTTTT	2	10	382671	382680	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014760	ACAAA	2	10	382749	382758	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014760	GATAG	2	10	386298	386307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014760	ATTTT	2	10	387774	387783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014760	TAAAT	2	10	394461	394470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014760	TAATA	2	10	406754	406763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014760	TCTTT	2	10	410904	410913	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014760	TTTAA	2	10	410998	411007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014760	ATTCC	2	10	414383	414392	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014760	ATATT	2	10	415119	415128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014760	AAAGT	2	10	415823	415832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014760	TGGAA	2	10	421678	421687	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014760	AGTTA	2	10	429158	429167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014760	TGCAT	2	10	454306	454315	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014760	TAAAT	2	10	463883	463892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014760	TATTT	2	10	474399	474408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014760	TTTAC	2	10	474498	474507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014760	AATTT	2	10	475757	475766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014760	GCTTT	2	10	475816	475825	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014760	GCTTT	2	10	477237	477246	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014760	TAATT	2	10	481606	481615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014760	TAAAA	2	10	481695	481704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014760	ATTTT	2	10	484172	484181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014760	AAATA	2	10	484320	484329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014760	ACAAA	2	10	484941	484950	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014760	TAATA	2	10	484979	484988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014760	TAAAT	2	10	487705	487714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014760	ATTAA	2	10	487795	487804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014760	TATAT	2	10	487828	487837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014760	TAAAT	2	10	488292	488301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014760	TTTTA	2	10	489922	489931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014760	ATTAA	2	10	495413	495422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014760	TTATT	2	10	495909	495918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014760	TTATT	2	10	503003	503012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014760	AAACA	2	10	507234	507243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014760	TAAAA	2	10	510523	510532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014760	TATAA	2	10	523540	523549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014760	TTATA	2	10	527283	527292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014760	TTTTA	2	10	531299	531308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014760	TTGTT	2	10	535249	535258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014760	AAAGT	2	10	550047	550056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014760	CTTTT	2	10	563540	563549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014760	TTTTG	2	10	572770	572779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014760	AATAT	2	10	573962	573971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014760	ATGAA	2	10	574172	574181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014760	TTTCT	2	10	574265	574274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014760	ACATT	2	10	576525	576534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014760	ATTTT	2	10	578640	578649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014760	AAATA	2	10	589593	589602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014760	TAATA	2	10	590451	590460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014760	TTAAA	2	10	590801	590810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014760	AATGT	2	10	593191	593200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014760	AGTAT	2	10	604401	604410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014760	TAAAA	2	10	604419	604428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014760	TTTAT	2	10	616508	616517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014760	TTTTC	2	10	617205	617214	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014760	TCAAA	2	10	617949	617958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.