MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	TTTTCT	2	12	15185	15196	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014658	GGAAGA	2	12	15292	15303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014658	ATTTTT	2	12	41073	41084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014658	TGTTTT	2	12	43928	43939	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014658	TTTAAA	2	12	44059	44070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014658	ATTTAA	2	12	64912	64923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014658	GAAAAA	2	12	102938	102949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014658	CTTATC	2	12	121803	121814	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014658	ATTTTA	2	12	123674	123685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014658	AACTTT	2	12	154142	154153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014658	ATGATT	2	12	205343	205354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014658	TAAAAT	2	12	252499	252510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014658	TAAAAA	2	12	266294	266305	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014658	TTTAGA	2	12	271908	271919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014658	AAAATC	2	12	414402	414413	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014658	AGGTAA	2	12	414936	414947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014658	ATTTAA	2	12	464479	464490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014658	ATCTTA	2	12	479358	479369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014658	TAAAAA	2	12	523546	523557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014658	ATTTAT	2	12	526605	526616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014658	TTTATC	2	12	540936	540947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014658	TAAAAA	2	12	540995	541006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014658	ATATTT	2	12	550358	550369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014658	AATGGA	2	12	553163	553174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014658	ATTTTT	2	12	559252	559263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014658	TCTTTT	2	12	591192	591203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014658	CAATGC	2	12	608567	608578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014658	ATATTT	2	12	639097	639108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014658	TTTGTG	2	12	684461	684472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014658	TAAATA	2	12	733937	733948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014658	TTATTT	2	12	775819	775830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014658	AGCTAA	2	12	784815	784826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014658	AATATT	2	12	785897	785908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014658	AATTTT	2	12	803187	803198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014658	AAAAAT	2	12	812059	812070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014658	TAAAAT	2	12	820496	820507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014658	TCATTT	2	12	897179	897190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014658	CATTAA	2	12	899213	899224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014658	ATTTTA	2	12	899513	899524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014658	TAATTT	2	12	947678	947689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014658	ATAATT	2	12	953725	953736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014658	TAAAAA	2	12	953778	953789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014658	GATAAA	2	12	953800	953811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014658	ATTTTA	2	12	975698	975709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014658	ATTTTA	2	12	993477	993488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014658	AAAGAT	2	12	1006692	1006703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014658	GATAGT	2	12	1006725	1006736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014658	ATTAAA	2	12	1027700	1027711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014658	TTCTAA	2	12	1052682	1052693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014658	TCTTTT	2	12	1058255	1058266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014658	AAATTA	2	12	1073535	1073546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014658	AATAGA	2	12	1080876	1080887	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014658	AAAAAT	2	12	1092146	1092157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014658	AAAAAT	2	12	1093502	1093513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014658	AATTAA	2	12	1136211	1136222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014658	TTTTTC	2	12	1146718	1146729	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014658	CCCTCT	2	12	1167565	1167576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014658	AATTTT	2	12	1185744	1185755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014658	TATTTT	2	12	1195682	1195693	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014658	ATTTTT	2	12	1205876	1205887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014658	ACCAAC	2	12	1241457	1241468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.