MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	TAAAA	2	10	19436	19445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014658	ACCGG	2	10	27937	27946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014658	TATTT	2	10	29108	29117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014658	TAAAA	2	10	41095	41104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014658	AAAAT	2	10	44108	44117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014658	CTTTT	2	10	52296	52305	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014658	AAAAT	2	10	73728	73737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014658	AAAAT	2	10	75702	75711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014658	CCTTT	2	10	77341	77350	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014658	AATTG	2	10	102221	102230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014658	TATAG	2	10	103937	103946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014658	AAAAT	2	10	107742	107751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014658	TTTTC	2	10	122031	122040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014658	CTTTA	2	10	154111	154120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014658	ATTCA	2	10	156573	156582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014658	TTTAT	2	10	164504	164513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014658	TTAAT	2	10	216605	216614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014658	TAAAA	2	10	223398	223407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014658	TTTTA	2	10	311003	311012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014658	CTTTT	2	10	311883	311892	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014658	TAGTG	2	10	345312	345321	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014658	GAAAT	2	10	379274	379283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014658	TTTTA	2	10	386010	386019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014658	TTTAA	2	10	386028	386037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014658	AATTA	2	10	414750	414759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014658	ATGTA	2	10	422518	422527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014658	TTATA	2	10	450107	450116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014658	TATTC	2	10	458521	458530	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014658	AGGGG	2	10	464320	464329	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014658	TTAAA	2	10	464512	464521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014658	TATTT	2	10	475998	476007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014658	TAAAA	2	10	479275	479284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014658	AATCA	2	10	479387	479396	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014658	TTTTC	2	10	518170	518179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014658	TTACA	2	10	526649	526658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014658	AATAA	2	10	528330	528339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014658	TTGTA	2	10	552423	552432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014658	GCATT	2	10	552790	552799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014658	AAAGA	2	10	554235	554244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014658	TATTT	2	10	601268	601277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014658	GGCTA	2	10	624190	624199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014658	GGCTA	2	10	624277	624286	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014658	TTTGT	2	10	625947	625956	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014658	TGGTA	2	10	638823	638832	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014658	TAGAT	2	10	639081	639090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014658	CTTTT	2	10	680485	680494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014658	ATATT	2	10	687294	687303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014658	GAGTA	2	10	735254	735263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014658	AGAAA	2	10	754427	754436	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014658	ATTTA	2	10	765185	765194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014658	CCGGT	2	10	768502	768511	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014658	TCTGT	2	10	784852	784861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014658	GGAAT	2	10	797216	797225	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014658	TCTTT	2	10	800296	800305	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014658	AAATA	2	10	803146	803155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014658	TAGCC	2	10	843310	843319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014658	AAACA	2	10	867687	867696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014658	TCTAT	2	10	873020	873029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014658	TAAGA	2	10	875173	875182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014658	GAAAA	2	10	879309	879318	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014658	AAGTA	2	10	881221	881230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014658	GCATT	2	10	890210	890219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014658	ATAAA	2	10	895122	895131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014658	TTTTA	2	10	895136	895145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014658	TTGTA	2	10	897225	897234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014658	TTTTC	2	10	898991	899000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014658	TTACC	2	10	903108	903117	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014658	GTATG	2	10	903239	903248	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014658	CATGT	2	10	938078	938087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014658	ATATT	2	10	941650	941659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014658	TTAAA	2	10	950299	950308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014658	TTTAA	2	10	953684	953693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014658	AGGCT	2	10	971847	971856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014658	AATTA	2	10	991586	991595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014658	GGGGT	2	10	1003742	1003751	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014658	ATAAA	2	10	1006618	1006627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014658	TTTAA	2	10	1009977	1009986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014658	TTTTA	2	10	1027876	1027885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014658	TAAAA	2	10	1033740	1033749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014658	AACTT	2	10	1045462	1045471	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014658	AACAA	2	10	1047096	1047105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014658	ATTTT	2	10	1055165	1055174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014658	AAGAA	2	10	1055383	1055392	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014658	CAAGT	2	10	1056322	1056331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014658	TTTTC	2	10	1062564	1062573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014658	TAAAA	2	10	1076995	1077004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014658	TCTAA	2	10	1082991	1083000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014658	CTTTT	2	10	1084182	1084191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014658	TTTCT	2	10	1084369	1084378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014658	ATTAG	2	10	1085300	1085309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014658	ATTTT	2	10	1086124	1086133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014658	AAGTA	2	10	1086586	1086595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014658	TATAT	2	10	1086881	1086890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014658	TCCAT	2	10	1088226	1088235	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014658	TCCCT	2	10	1092075	1092084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014658	AGTGA	2	10	1094414	1094423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014658	GAGTA	2	10	1111518	1111527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014658	ACTCC	2	10	1123672	1123681	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_014658	AAATT	2	10	1129576	1129585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014658	AATAT	2	10	1129657	1129666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014658	ATAAA	2	10	1136633	1136642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014658	TTACA	2	10	1142843	1142852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014658	ATATA	2	10	1167666	1167675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014658	ACCCC	2	10	1175524	1175533	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_014658	TAAAA	2	10	1179751	1179760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014658	GTAAT	2	10	1218103	1218112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014658	GAAAA	2	10	1241561	1241570	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.