MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma fermentans JER chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014552	TTTGTT	2	12	12064	12075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014552	ATAAAA	2	12	12803	12814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014552	TTTTAT	2	12	15520	15531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014552	ATTAAA	2	12	19958	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014552	ATTTTT	2	12	20202	20213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014552	TAAAAA	2	12	21972	21983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014552	TATGAA	2	12	22467	22478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014552	ACAAAA	2	12	23842	23853	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014552	TTTAAG	2	12	31115	31126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014552	ATTAAA	2	12	32550	32561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014552	AAATTT	2	12	52921	52932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014552	GAATTT	2	12	64722	64733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014552	TTTTCA	2	12	66959	66970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014552	AAAATT	2	12	95608	95619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014552	AAATTT	2	12	97798	97809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014552	TAAAAA	2	12	106757	106768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014552	ATCTTT	2	12	113253	113264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014552	TATCAT	2	12	125926	125937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014552	TAAAAT	2	12	131612	131623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014552	GTGGTT	2	12	145558	145569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014552	AATTTT	2	12	162115	162126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014552	ATTAAT	2	12	162400	162411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014552	ATATGA	2	12	171373	171384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014552	AAAAAG	2	12	171430	171441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014552	TTATCT	2	12	178402	178413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014552	CAATCA	2	12	181391	181402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014552	GTATTG	2	12	181571	181582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014552	ATTTTA	2	12	214933	214944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014552	TAAAAA	2	12	227687	227698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014552	ACATTA	2	12	242936	242947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014552	AAAATT	2	12	258121	258132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014552	ATTTAA	2	12	266567	266578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014552	AATATT	2	12	267540	267551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014552	TTTTAT	2	12	279045	279056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014552	AATTTT	2	12	284618	284629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014552	TTTAGT	2	12	312506	312517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014552	TGAATT	2	12	320921	320932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014552	TTTCTA	2	12	332556	332567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014552	TTTTAT	2	12	337405	337416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014552	AAGTGG	2	12	341362	341373	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014552	AACAAA	2	12	341895	341906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014552	GAAAAA	2	12	342662	342673	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014552	TGCAAT	2	12	353566	353577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014552	TAATTT	2	12	367575	367586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014552	ACTTTT	2	12	368954	368965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014552	ACTGGA	2	12	369686	369697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014552	ACAAAA	2	12	382360	382371	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014552	ATTTTA	2	12	406523	406534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014552	AAATTT	2	12	419921	419932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014552	AAAATT	2	12	432813	432824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014552	ATTTTT	2	12	455865	455876	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014552	AAAATA	2	12	462135	462146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014552	AAAAAT	2	12	466575	466586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014552	TGTTTT	2	12	467847	467858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014552	ATTGAC	2	12	470094	470105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014552	GAATTA	2	12	480899	480910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014552	AAAAAT	2	12	495207	495218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014552	ATTTTT	2	12	502790	502801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014552	ATATAA	2	12	508355	508366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014552	TATTAA	2	12	520751	520762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014552	ATTTTT	2	12	521741	521752	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014552	ATATTT	2	12	527514	527525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014552	TTTCTT	2	12	534455	534466	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014552	TTGTTT	2	12	538076	538087	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014552	TAATAT	2	12	565058	565069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014552	ATAGAA	2	12	566335	566346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014552	AATTCA	2	12	577971	577982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014552	TGCAAG	2	12	588336	588347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014552	ATAATT	2	12	595986	595997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014552	TTAATA	2	12	595998	596009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014552	CTCCAG	2	12	619365	619376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014552	TTAAAA	2	12	641286	641297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014552	TTTTTA	2	12	641489	641500	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014552	ATTATG	2	12	644181	644192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014552	ACCTTA	2	12	644645	644656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014552	ATTTCT	2	12	653472	653483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014552	CTTTTG	2	12	655454	655465	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014552	AAATTT	2	12	679574	679585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014552	TAAAAT	2	12	689555	689566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014552	TTCTTA	2	12	689704	689715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014552	AAATTA	2	12	690101	690112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014552	ATAAAT	2	12	692110	692121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014552	ATTTTT	2	12	699235	699246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014552	CTCCAG	2	12	710228	710239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014552	AAAATA	2	12	739868	739879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014552	CTTTTA	2	12	739925	739936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014552	AAATAG	2	12	744628	744639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014552	TAAAAT	2	12	753339	753350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014552	AAATAA	2	12	757496	757507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014552	TTTTAA	2	12	759898	759909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014552	CAATAA	2	12	770219	770230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014552	ACAAAA	2	12	784891	784902	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014552	TGAAAA	2	12	785034	785045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014552	TAAAAT	2	12	785170	785181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014552	TCTTTT	2	12	805880	805891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014552	TATTAA	2	12	822125	822136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014552	ATTTGT	2	12	849859	849870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014552	TATATT	2	12	858392	858403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014552	TAAATA	2	12	875964	875975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014552	TAAAAA	2	12	879714	879725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014552	TATTAA	2	12	896699	896710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014552	ATTTTT	2	12	912051	912062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014552	TTAACT	2	12	938193	938204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014552	AAATTT	2	12	939322	939333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014552	AAAAAT	2	12	946603	946614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.