MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTTTG	2	10	382	391	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014507	GAGGG	2	10	441	450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014507	TTATA	2	10	6696	6705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014507	CGGAG	2	10	41098	41107	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014507	ATATT	2	10	52240	52249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014507	CCGGC	2	10	66526	66535	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_014507	TTTAT	2	10	98631	98640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014507	ATAGT	2	10	110189	110198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014507	TTTCT	2	10	115575	115584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014507	CTTCC	2	10	122494	122503	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014507	TGGAA	2	10	122610	122619	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014507	TTCTT	2	10	129469	129478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014507	GCCAG	2	10	137112	137121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014507	GGGGC	2	10	143828	143837	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014507	AGGAA	2	10	143945	143954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014507	TCCTG	2	10	144048	144057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014507	TCGGG	2	10	144306	144315	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014507	CCGTG	2	10	161957	161966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014507	TTGAT	2	10	162013	162022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014507	TGAAA	2	10	170032	170041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014507	ATTAT	2	10	173312	173321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014507	TTTCC	2	10	191468	191477	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014507	AAAAC	2	10	204714	204723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014507	TAAAA	2	10	211550	211559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014507	GACTA	2	10	211637	211646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014507	CTGCC	2	10	211766	211775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014507	ATAAA	2	10	215372	215381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014507	GCGAA	2	10	234214	234223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014507	TTAAA	2	10	255258	255267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014507	ATTAT	2	10	257219	257228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014507	GAAAA	2	10	266632	266641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014507	GATAT	2	10	268949	268958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014507	GTTTT	2	10	277634	277643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014507	CTTCT	2	10	281867	281876	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014507	TTTTA	2	10	290279	290288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014507	ATTTT	2	10	296299	296308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014507	AATTA	2	10	301616	301625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014507	TTAAT	2	10	301733	301742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014507	ATTAT	2	10	303573	303582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014507	ATTAT	2	10	307614	307623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014507	TAATA	2	10	307639	307648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014507	CGGAA	2	10	314585	314594	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014507	GCATT	2	10	314948	314957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014507	CAATA	2	10	326637	326646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014507	CACTA	2	10	341725	341734	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014507	ATATT	2	10	357242	357251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014507	CATTT	2	10	360666	360675	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014507	AATTT	2	10	362973	362982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014507	CCAAA	2	10	369713	369722	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014507	AAGTT	2	10	369982	369991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014507	AGCAT	2	10	380106	380115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014507	AGCAT	2	10	384532	384541	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014507	TTCAT	2	10	393431	393440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014507	GACTA	2	10	395877	395886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014507	TTTCA	2	10	410858	410867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014507	ATGGC	2	10	416042	416051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014507	TATTT	2	10	416235	416244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014507	TGTTT	2	10	432879	432888	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014507	GATTG	2	10	434590	434599	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014507	AGGTT	2	10	440824	440833	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014507	GTATA	2	10	447765	447774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014507	ATTTA	2	10	457701	457710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014507	CATTC	2	10	457714	457723	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014507	TACTG	2	10	464217	464226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014507	AAAAT	2	10	464397	464406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014507	ATCAG	2	10	467857	467866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014507	CAGTT	2	10	469214	469223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014507	ATGAT	2	10	471040	471049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014507	ATTTT	2	10	478603	478612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014507	TTATA	2	10	478675	478684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014507	CTGCC	2	10	478776	478785	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014507	TCCCT	2	10	485205	485214	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014507	AAAAG	2	10	494063	494072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014507	GCCTT	2	10	506055	506064	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014507	AAAGT	2	10	511189	511198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014507	TCTTT	2	10	521102	521111	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014507	CCCTC	2	10	531869	531878	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_014507	TGAGT	2	10	534924	534933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014507	GCCTT	2	10	538103	538112	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014507	TTTTA	2	10	550902	550911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014507	TAAAT	2	10	576384	576393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014507	TGTTT	2	10	576497	576506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014507	AAACA	2	10	584228	584237	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014507	GCGAA	2	10	589716	589725	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014507	AATTT	2	10	600859	600868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014507	ATTCT	2	10	604305	604314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014507	TTCAT	2	10	604378	604387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014507	TACCA	2	10	624750	624759	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014507	TACTT	2	10	638265	638274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014507	GAAAT	2	10	644040	644049	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014507	TAAAA	2	10	649992	650001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014507	AAGCA	2	10	657384	657393	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014507	ATTTT	2	10	660875	660884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014507	TGTTT	2	10	662095	662104	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014507	TTCTA	2	10	674736	674745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014507	GGCTG	2	10	692843	692852	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014507	CAGGA	2	10	694456	694465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014507	TTCGC	2	10	708027	708036	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014507	ATTGT	2	10	708131	708140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014507	TTCCC	2	10	708263	708272	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_014507	CCTGA	2	10	744715	744724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014507	GTTTT	2	10	745221	745230	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014507	CTGAT	2	10	758512	758521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014507	TAATG	2	10	763787	763796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014507	AAGGC	2	10	779224	779233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014507	TATAA	2	10	781851	781860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014507	TCTCC	2	10	808522	808531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_014507	GGAAT	2	10	815476	815485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014507	AATTA	2	10	820717	820726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014507	ATTAT	2	10	826866	826875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014507	TGAAT	2	10	827227	827236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014507	GGTCT	2	10	833628	833637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014507	TCTGG	2	10	833644	833653	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014507	AATTA	2	10	846136	846145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014507	TTCAG	2	10	846334	846343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014507	CAATA	2	10	851071	851080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014507	TAAAA	2	10	855205	855214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014507	AAAAT	2	10	863070	863079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014507	TCCCT	2	10	863175	863184	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_014507	TGTTT	2	10	866721	866730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014507	TTTTA	2	10	866736	866745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014507	AGGGA	2	10	874218	874227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014507	ATTTT	2	10	874339	874348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014507	ATCCT	2	10	874863	874872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014507	ATTCT	2	10	878379	878388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014507	TCCGG	2	10	880942	880951	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014507	CAAGG	2	10	883500	883509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014507	TGAGG	2	10	883689	883698	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014507	GGAAA	2	10	886256	886265	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014507	ATTTT	2	10	909419	909428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014507	TTAAT	2	10	911661	911670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014507	TCCCC	2	10	919226	919235	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_014507	TCTCA	3	15	926549	926563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014507	GAATA	2	10	926598	926607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014507	ATATT	2	10	927290	927299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014507	TTCAT	2	10	944809	944818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014507	AATTT	2	10	945530	945539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014507	TGGCA	2	10	948361	948370	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014507	CTGTC	2	10	950021	950030	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014507	GCCTT	2	10	973082	973091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014507	CGTTA	2	10	973257	973266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014507	GTGCA	2	10	973287	973296	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014507	TAGTG	2	10	973561	973570	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014507	TAGCC	2	10	973655	973664	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014507	TTCAT	2	10	977127	977136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014507	TAGTG	2	10	979072	979081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014507	CAAAA	2	10	986470	986479	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_014507	TGTAA	2	10	1308286	1308295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014507	TTTAA	2	10	1310236	1310245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014507	TTCTC	2	10	1314317	1314326	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_014507	GTTCC	2	10	1734721	1734730	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014507	TCATA	2	10	1747543	1747552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_014507	TTTCT	2	10	1815877	1815886	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_014507	TGATT	2	10	1830148	1830157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_014507	CTCCC	2	10	2149407	2149416	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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409	NC_014507	TTATA	2	10	2839340	2839349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_014507	TGTTT	2	10	2843093	2843102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.