MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 8606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014507	A	6	6	2802350	2802355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_014507	TCC	2	6	2802900	2802905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_014507	GAT	2	6	2802931	2802936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_014507	CCG	2	6	2804291	2804296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_014507	GCGGA	2	10	2804324	2804333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8506	NC_014507	TTA	2	6	2806781	2806786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_014507	T	6	6	2807689	2807694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_014507	CGA	2	6	2810188	2810193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_014507	AT	3	6	2810231	2810236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_014507	ATA	2	6	2810797	2810802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_014507	ACAA	2	8	2810825	2810832	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8512	NC_014507	T	6	6	2810837	2810842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_014507	ATT	2	6	2810865	2810870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_014507	T	7	7	2810869	2810875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_014507	TTAA	2	8	2810887	2810894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_014507	CCA	2	6	2810905	2810910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8517	NC_014507	TA	3	6	2810942	2810947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014507	AT	3	6	2810958	2810963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_014507	T	6	6	2811389	2811394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_014507	AGG	2	6	2811446	2811451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_014507	CGA	2	6	2812916	2812921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_014507	CCAT	2	8	2812960	2812967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_014507	T	6	6	2812985	2812990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_014507	AAT	2	6	2812991	2812996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_014507	TGA	2	6	2815479	2815484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_014507	A	7	7	2815484	2815490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_014507	ACTGC	2	10	2817681	2817690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8528	NC_014507	ACA	2	6	2817728	2817733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_014507	CGAA	2	8	2817742	2817749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8530	NC_014507	GAAT	2	8	2817750	2817757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_014507	CCCG	2	8	2817772	2817779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8532	NC_014507	CTA	2	6	2817838	2817843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_014507	AAT	2	6	2821115	2821120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_014507	ATA	2	6	2821127	2821132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_014507	CCCACC	2	12	2822494	2822505	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
8536	NC_014507	T	7	7	2823516	2823522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_014507	TCC	2	6	2824265	2824270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8538	NC_014507	ACTT	2	8	2824290	2824297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8539	NC_014507	ACC	2	6	2825538	2825543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8540	NC_014507	AAT	2	6	2825614	2825619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_014507	A	6	6	2825630	2825635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_014507	AT	3	6	2825655	2825660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_014507	A	6	6	2825680	2825685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_014507	ATTT	2	8	2825696	2825703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_014507	TA	3	6	2825761	2825766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014507	TGA	2	6	2825767	2825772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_014507	ATT	2	6	2828428	2828433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014507	A	7	7	2828474	2828480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_014507	T	6	6	2831334	2831339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_014507	TCT	2	6	2831357	2831362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_014507	GAT	2	6	2831416	2831421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_014507	T	6	6	2832890	2832895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_014507	A	8	8	2832920	2832927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_014507	TAA	2	6	2832928	2832933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014507	ATT	2	6	2832945	2832950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014507	TAAAA	2	10	2833748	2833757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_014507	T	7	7	2833761	2833767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_014507	ATT	2	6	2833809	2833814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_014507	AAT	2	6	2833820	2833825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_014507	TCA	2	6	2833858	2833863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_014507	CTT	3	9	2833877	2833885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_014507	CTC	2	6	2833965	2833970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8563	NC_014507	GGAA	2	8	2833995	2834002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_014507	AGG	2	6	2834008	2834013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_014507	AT	3	6	2834072	2834077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_014507	TCA	2	6	2834102	2834107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_014507	CAC	2	6	2834113	2834118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8568	NC_014507	CCG	2	6	2834124	2834129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_014507	GAT	2	6	2834197	2834202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_014507	GAA	2	6	2834212	2834217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_014507	ATT	2	6	2834222	2834227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_014507	GAG	2	6	2834263	2834268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_014507	CAG	2	6	2834317	2834322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_014507	GAA	2	6	2834368	2834373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_014507	GTAT	2	8	2834477	2834484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_014507	CAG	2	6	2834499	2834504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_014507	GGT	2	6	2834647	2834652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_014507	TCA	2	6	2834698	2834703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_014507	GAA	2	6	2834743	2834748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_014507	TAA	2	6	2834775	2834780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_014507	TGT	2	6	2836308	2836313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_014507	TCAT	2	8	2836327	2836334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_014507	GCC	2	6	2838193	2838198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8584	NC_014507	TTATT	2	10	2838211	2838220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_014507	T	7	7	2838308	2838314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_014507	AAC	2	6	2839229	2839234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_014507	TA	3	6	2839248	2839253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_014507	TA	3	6	2839266	2839271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014507	GTA	2	6	2839304	2839309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_014507	TTATA	2	10	2839340	2839349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_014507	AGC	2	6	2839373	2839378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_014507	GAATCA	2	12	2839948	2839959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8593	NC_014507	A	6	6	2839978	2839983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_014507	ATA	2	6	2840010	2840015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014507	T	7	7	2842943	2842949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014507	TGA	2	6	2842993	2842998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_014507	AG	3	6	2843017	2843022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_014507	TTCT	2	8	2843058	2843065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8599	NC_014507	TTC	2	6	2843075	2843080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_014507	TGTTT	2	10	2843093	2843102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_014507	A	7	7	2843224	2843230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_014507	CAT	2	6	2843233	2843238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014507	TAAG	2	8	2843243	2843250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_014507	TAA	2	6	2843251	2843256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_014507	A	6	6	2843260	2843265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_014507	TAA	2	6	2843284	2843289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.