MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Maribacter sp. HTCC2170 chromosome

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014472	GCATCA	2	12	217	228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014472	GAAGGT	2	12	1716	1727	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014472	GAAGGT	2	12	1989	2000	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014472	ACCATC	2	12	2163	2174	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014472	GAAGGT	2	12	2262	2273	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014472	ACCATC	2	12	2436	2447	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014472	GAAGGT	2	12	2535	2546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014472	ACCATC	2	12	2709	2720	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014472	GAAGGT	2	12	2808	2819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014472	ACCATC	2	12	2982	2993	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014472	GAAGGT	2	12	3081	3092	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014472	ACCATC	2	12	3255	3266	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014472	AAGGTG	2	12	3355	3366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014472	ACCGTC	2	12	3528	3539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014472	AAGGTG	2	12	3628	3639	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014472	ACCGTC	2	12	3801	3812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014472	TCAAAA	2	12	47109	47120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014472	ATATTT	2	12	59361	59372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014472	TTTACC	2	12	137691	137702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014472	TTCATT	2	12	166938	166949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014472	AAAGGA	2	12	175972	175983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014472	GATATA	2	12	249127	249138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014472	TTTTCC	2	12	261792	261803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014472	TCAACG	2	12	305925	305936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014472	ATAAAT	2	12	311925	311936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014472	TTTTTG	2	12	327713	327724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014472	GATTTT	2	12	349174	349185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014472	ATTAAT	2	12	351876	351887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014472	TAAAAC	2	12	363080	363091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014472	AAATCC	2	12	381077	381088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014472	ATTTAA	2	12	454466	454477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014472	CCTTAA	2	12	472436	472447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014472	TTCAAG	2	12	482751	482762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014472	CTATTG	2	12	484962	484973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014472	CTAAAT	2	12	492905	492916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014472	AAACGT	2	12	540119	540130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014472	AATATT	2	12	564050	564061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014472	TATCTA	2	12	578577	578588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014472	CTAAAA	2	12	664298	664309	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014472	ATTGAA	2	12	668366	668377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014472	ATATTA	2	12	807043	807054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014472	TTAAAA	2	12	921136	921147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014472	ATAATT	2	12	956016	956027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014472	TGAAAA	2	12	962541	962552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014472	AACAAT	2	12	979045	979056	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014472	TTTCCA	2	12	980287	980298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014472	ACCAAA	2	12	1006097	1006108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014472	CTTTAC	2	12	1048504	1048515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014472	AAACAC	2	12	1115652	1115663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014472	TTGGTT	2	12	1181597	1181608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014472	TAAAAA	2	12	1290022	1290033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014472	ACATTT	2	12	1297784	1297795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014472	TTGGTT	2	12	1366365	1366376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014472	ATTTGC	2	12	1384312	1384323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014472	AAATCA	2	12	1402390	1402401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014472	TTCTTT	2	12	1402536	1402547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014472	ATTTGC	2	12	1448839	1448850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014472	ACAAAC	2	12	1455898	1455909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014472	AAGTCC	2	12	1473564	1473575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014472	ACCAAA	2	12	1490864	1490875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014472	TAAGTG	2	12	1518626	1518637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014472	TAATTT	2	12	1521291	1521302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014472	ATACCG	2	12	1528946	1528957	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014472	TGCCCT	2	12	1622194	1622205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014472	GATATA	2	12	1622751	1622762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014472	ATCATT	2	12	1633809	1633820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014472	AATTAT	2	12	1667096	1667107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014472	GGAAAA	2	12	1688089	1688100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014472	ACAAAA	2	12	1688193	1688204	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014472	GAGCTG	2	12	1688885	1688896	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014472	TTTAAG	2	12	1745865	1745876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014472	ATAAAA	2	12	1751480	1751491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014472	ATAAAA	2	12	1751683	1751694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014472	GGGAAT	2	12	1751885	1751896	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014472	TTTGAA	2	12	1823343	1823354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014472	TTAATA	2	12	1867834	1867845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014472	TGATTT	2	12	1884281	1884292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014472	TCTTTT	2	12	1951974	1951985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014472	GACCCT	2	12	1954001	1954012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014472	ATTTTT	2	12	1961750	1961761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014472	TAAAAT	2	12	1996125	1996136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014472	TAAAGA	2	12	2010436	2010447	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014472	AAAAAG	2	12	2010862	2010873	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014472	ATGTTA	2	12	2011048	2011059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014472	AAAAGA	2	12	2087363	2087374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014472	ATAATT	2	12	2157822	2157833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014472	TTTAAA	2	12	2176264	2176275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014472	CACCAA	2	12	2195225	2195236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014472	CGTTGA	2	12	2285405	2285416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014472	TTGAGT	2	12	2300546	2300557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014472	AATGTT	2	12	2324459	2324470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014472	GTTGGT	2	12	2335309	2335320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014472	CCATCA	2	12	2335849	2335860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014472	AAAGCA	2	12	2335948	2335959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014472	TCTGAT	2	12	2336689	2336700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014472	TACTTT	2	12	2336988	2336999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014472	ATACTA	2	12	2409908	2409919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014472	TAATAT	2	12	2424015	2424026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014472	CAGAAC	2	12	2456721	2456732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014472	TCCAAG	2	12	2460457	2460468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014472	TAAAGA	2	12	2467340	2467351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014472	TTTTTA	2	12	2476827	2476838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014472	AATATG	2	12	2496404	2496415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014472	ATTTTA	2	12	2507642	2507653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014472	TTATTT	2	12	2523683	2523694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014472	TTGAAA	2	12	2530479	2530490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014472	TATAAG	2	12	2543406	2543417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014472	TAATTT	2	12	2570918	2570929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014472	TAGTTG	2	12	2581276	2581287	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014472	CATTTT	2	12	2590437	2590448	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014472	TAATGA	2	12	2593732	2593743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014472	TATAAA	2	12	2611730	2611741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014472	CTTTTT	2	12	2614095	2614106	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014472	TTCATT	2	12	2638818	2638829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014472	ATTTTC	2	12	2641859	2641870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014472	CAAATC	2	12	2642006	2642017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014472	GCCATT	2	12	2642402	2642413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014472	TCAAAA	2	12	2642937	2642948	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014472	ACATTT	2	12	2654207	2654218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014472	TAACTT	2	12	2674819	2674830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014472	TTTGGG	2	12	2678855	2678866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014472	AAAAGC	2	12	2679236	2679247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014472	TTAATG	2	12	2709313	2709324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014472	AAAAGA	2	12	2714603	2714614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014472	TGAACC	2	12	2718010	2718021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014472	ATTTCC	2	12	2766354	2766365	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014472	CAATGA	2	12	2790781	2790792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014472	TCAAAA	2	12	2796486	2796497	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014472	AACCTA	2	12	2810189	2810200	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014472	CCTGTT	2	12	2820152	2820163	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014472	TCGTGT	2	12	2822466	2822477	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014472	TTGGTT	2	12	2831037	2831048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014472	ATGAAA	2	12	2836890	2836901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014472	TGTAAA	2	12	2836927	2836938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014472	ATATTG	2	12	2896376	2896387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014472	TAGAGA	2	12	3148580	3148591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_014472	GAAAAA	2	12	3359643	3359654	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.