MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg chromosome

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014408	CCCACC	2	12	21740	21751	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_014408	GATTAT	2	12	61914	61925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014408	ACCTTC	2	12	64935	64946	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014408	TAAACT	2	12	124036	124047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014408	CTATTT	2	12	151676	151687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014408	TGCGGA	2	12	224232	224243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014408	GGGGGT	2	12	224295	224306	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014408	CTGATT	2	12	259990	260001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014408	ATTTTT	2	12	271500	271511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014408	AATTAA	2	12	309641	309652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014408	ATTTAA	2	12	318044	318055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014408	TGTTTG	2	12	319438	319449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014408	TCCTAA	2	12	321979	321990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014408	CTCATA	2	12	324776	324787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014408	ATGAAC	2	12	342377	342388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014408	ACCTTC	2	12	384528	384539	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014408	ATTATC	2	12	407537	407548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014408	AAAAAT	3	18	409598	409615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014408	ACCTCA	2	12	426931	426942	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014408	CAGAAA	2	12	426975	426986	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014408	TTCTGA	2	12	427150	427161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014408	TGTTTG	2	12	433280	433291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014408	TCCTAA	2	12	435815	435826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014408	TTTAAC	2	12	457303	457314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014408	ACTTTA	2	12	459251	459262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014408	GAAAAG	2	12	508553	508564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014408	ATAATT	2	12	523085	523096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014408	CATTTC	2	12	580784	580795	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014408	GCCCTT	2	12	622043	622054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014408	TGGATT	2	12	655588	655599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014408	TGATAG	2	12	703205	703216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014408	CTTAAG	2	12	719972	719983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014408	GTTGAC	2	12	722676	722687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014408	TTTTCA	2	12	732233	732244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014408	ATATAC	2	12	778163	778174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014408	AACATT	2	12	845284	845295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014408	TTAATT	2	12	905888	905899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014408	TTTGGG	2	12	979794	979805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014408	AAAAAC	2	12	1031625	1031636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014408	TTAATA	2	12	1061267	1061278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014408	TGCAAG	2	12	1098263	1098274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014408	ATCCAT	2	12	1125069	1125080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014408	CAGGTT	2	12	1211820	1211831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014408	TGTACC	2	12	1252557	1252568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014408	TATATG	2	12	1257152	1257163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014408	ACTTGC	2	12	1314339	1314350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014408	TACAGA	2	12	1333207	1333218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014408	GGTGTG	2	12	1341368	1341379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014408	ATGTGA	2	12	1384713	1384724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014408	TAATAT	2	12	1407209	1407220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014408	GAATGT	2	12	1442470	1442481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014408	ATAAAT	2	12	1475255	1475266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014408	TAAAAA	2	12	1509770	1509781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014408	GGGGCC	2	12	1519099	1519110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014408	TACATA	2	12	1524867	1524878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014408	AAATAT	2	12	1555730	1555741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014408	AGGATT	2	12	1561373	1561384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.