MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg chromosome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014408	AGGAT	2	10	15808	15817	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014408	TTTCT	2	10	18049	18058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014408	TAAAA	2	10	20642	20651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014408	ATTAT	2	10	37581	37590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014408	ATTAA	2	10	46916	46925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014408	AATGA	2	10	49067	49076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014408	AAGGT	2	10	68916	68925	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014408	GTGAT	2	10	88374	88383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014408	AATAT	2	10	95247	95256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014408	TATAT	2	10	101009	101018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014408	AGTGT	2	10	101248	101257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014408	TATAT	2	10	124048	124057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014408	GCTGG	2	10	137244	137253	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014408	TTTAT	2	10	142775	142784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014408	GGTGA	2	10	170671	170680	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014408	AGTGG	2	10	189544	189553	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014408	AATTA	2	10	223734	223743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014408	ATGGG	2	10	232972	232981	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014408	ACCAC	2	10	238935	238944	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014408	ACCAT	2	10	255214	255223	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014408	ATTTT	2	10	266388	266397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014408	TAAAA	2	10	273674	273683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014408	ATGAG	2	10	274072	274081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014408	TGATA	2	10	294469	294478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014408	TCAGA	2	10	318057	318066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014408	TAAAA	2	10	318108	318117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014408	TGGCT	2	10	321537	321546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014408	CGGCA	2	10	322091	322100	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014408	GTGTC	2	10	322168	322177	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014408	TGGTG	2	10	322832	322841	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014408	TTGTG	2	10	324632	324641	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014408	CATGG	2	10	324808	324817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014408	TTATG	2	10	336939	336948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014408	TGGGT	2	10	344212	344221	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014408	TTAAT	2	10	387818	387827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014408	ATTGG	2	10	413433	413442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014408	TTTTG	2	10	433190	433199	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014408	TGGCT	2	10	435373	435382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014408	CGGCA	2	10	435927	435936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014408	GTGTC	2	10	436004	436013	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014408	TGGTG	2	10	436668	436677	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014408	TCAAA	2	10	461049	461058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014408	TCCAG	2	10	475531	475540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014408	TAGCC	2	10	482905	482914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014408	TTTTA	2	10	486503	486512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014408	CCGAT	2	10	508025	508034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014408	TTTGA	2	10	511881	511890	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014408	CATGT	2	10	525665	525674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014408	GTTAT	2	10	526411	526420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014408	TTTAA	2	10	526517	526526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014408	ATAGG	2	10	529739	529748	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014408	TCTTT	2	10	532652	532661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014408	ATTTT	2	10	537817	537826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014408	TCAGG	2	10	580825	580834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014408	TCAGG	2	10	580889	580898	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014408	ATAAA	2	10	592036	592045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014408	CTATA	2	10	595842	595851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014408	TTTCT	2	10	603991	604000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014408	AAAGA	2	10	604030	604039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014408	AGTTA	2	10	613871	613880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014408	AGGTT	2	10	636723	636732	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014408	AAGTA	2	10	655544	655553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014408	ATCGG	2	10	663094	663103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014408	AACAT	2	10	664973	664982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014408	ATTAT	2	10	672085	672094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014408	ATATG	2	10	685125	685134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014408	ACCAT	2	10	706791	706800	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014408	TTCAG	2	10	712773	712782	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014408	TGGTG	2	10	732401	732410	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014408	CACTC	2	10	762383	762392	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014408	ATTAT	2	10	768025	768034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014408	ATTAA	2	10	775903	775912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014408	ATTTT	2	10	778452	778461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014408	ATTTC	2	10	778504	778513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014408	ATTAT	2	10	792864	792873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014408	ATTGT	2	10	804687	804696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014408	ATATC	2	10	816355	816364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014408	ATTTA	2	10	818479	818488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014408	TTTAA	2	10	826042	826051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014408	TGATA	2	10	828315	828324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014408	TGTGG	2	10	836282	836291	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014408	ATTTT	2	10	836299	836308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014408	TAAAT	2	10	837456	837465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014408	TATTT	2	10	843390	843399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014408	TTACA	2	10	845122	845131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014408	ATTTT	2	10	846531	846540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014408	CTTTT	2	10	847804	847813	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014408	AGGTG	2	10	857467	857476	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014408	ATAAA	2	10	861163	861172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014408	AAAAT	2	10	892020	892029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014408	TTATT	2	10	898628	898637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014408	GTGTT	2	10	898881	898890	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014408	TTAAA	2	10	901772	901781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014408	TAATA	2	10	915990	915999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014408	AATTA	2	10	953149	953158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014408	CATAA	2	10	977970	977979	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014408	CCATT	2	10	978226	978235	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014408	AATTA	2	10	981706	981715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014408	GATTG	2	10	990215	990224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014408	TAATA	2	10	1000742	1000751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014408	TATAA	2	10	1004855	1004864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014408	TATAA	2	10	1021464	1021473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014408	ATAGT	2	10	1023235	1023244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014408	AAAAT	2	10	1023369	1023378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014408	TAAAA	2	10	1041380	1041389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014408	TAAAA	2	10	1093829	1093838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014408	TAGTC	2	10	1099482	1099491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014408	AAAAC	2	10	1106608	1106617	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014408	AAATA	2	10	1128768	1128777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014408	AGAAC	2	10	1135214	1135223	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014408	ATTAT	2	10	1148075	1148084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014408	CAGAA	2	10	1163744	1163753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014408	ATTGA	2	10	1168134	1168143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014408	AACCT	2	10	1174401	1174410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014408	ATAAA	2	10	1176863	1176872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014408	AATTA	2	10	1179430	1179439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014408	ATTGT	2	10	1182298	1182307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014408	AGTGA	2	10	1229397	1229406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014408	TTAAT	2	10	1238744	1238753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014408	TATTT	2	10	1266202	1266211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014408	TAGAA	2	10	1276426	1276435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014408	AAAGC	2	10	1303223	1303232	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014408	TAATT	2	10	1307218	1307227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014408	TAATA	2	10	1313853	1313862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014408	TACCA	2	10	1314363	1314372	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014408	CCTCC	2	10	1317184	1317193	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_014408	TCCCT	2	10	1331713	1331722	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014408	TAGCC	2	10	1332140	1332149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014408	TAGCC	2	10	1332261	1332270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014408	TAGCC	2	10	1332382	1332391	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014408	AAAGG	2	10	1342112	1342121	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014408	ATGTC	2	10	1357120	1357129	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014408	GTTAA	2	10	1357379	1357388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014408	TCTCA	2	10	1375844	1375853	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014408	TTGGT	2	10	1397678	1397687	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014408	GACAT	2	10	1431824	1431833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014408	ACCAG	2	10	1432728	1432737	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014408	TATAA	2	10	1445342	1445351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014408	ATACT	2	10	1447785	1447794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014408	TTATT	2	10	1453037	1453046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014408	AAAAC	2	10	1460882	1460891	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014408	ATAAA	2	10	1475196	1475205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014408	ATTTA	2	10	1485169	1485178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014408	TTAAA	2	10	1486229	1486238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014408	CAGAA	2	10	1519071	1519080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014408	ACCCC	2	10	1519161	1519170	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
147	NC_014408	ACTAC	2	10	1519379	1519388	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014408	GCAGA	2	10	1520160	1520169	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014408	ACCCC	2	10	1533958	1533967	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
150	NC_014408	TAGCC	2	10	1540840	1540849	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014408	TAGCC	2	10	1540937	1540946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014408	CCCTG	2	10	1553458	1553467	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_014408	TCAGG	2	10	1561391	1561400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_014408	TTAAT	2	10	1565686	1565695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014408	ATTTT	2	10	1587512	1587521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014408	TATCT	2	10	1587645	1587654	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014408	AATCA	2	10	1603952	1603961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014408	AAAAG	2	10	1603970	1603979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.