MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	AAATA	2	10	2380	2389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014254	AAAAT	2	10	2821	2830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014254	AAATC	2	10	13139	13148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014254	ATTTT	2	10	32281	32290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014254	TATAA	2	10	37590	37599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014254	AAGAA	2	10	41234	41243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014254	TTATG	2	10	41661	41670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014254	ATATT	2	10	41727	41736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014254	TACAC	2	10	52030	52039	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014254	TTAAA	2	10	54099	54108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014254	ATGGT	2	10	54622	54631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014254	TAGAT	2	10	55005	55014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014254	AAAAT	2	10	57887	57896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014254	TAGTT	2	10	60691	60700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014254	TTATT	2	10	61509	61518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014254	AAGTT	2	10	62041	62050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014254	ATTAT	2	10	81527	81536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014254	ATTTT	2	10	87148	87157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014254	ATAAG	2	10	88636	88645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014254	CATAT	2	10	89376	89385	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014254	TGAGG	2	10	95058	95067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014254	CAATA	2	10	96632	96641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014254	ACAAA	2	10	98302	98311	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014254	ACATA	2	10	100496	100505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014254	TATAG	2	10	100677	100686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014254	AACTT	2	10	104506	104515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014254	ATTTT	2	10	110465	110474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014254	ATTAA	2	10	114427	114436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014254	AGTAC	2	10	114647	114656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014254	GAAAA	2	10	117351	117360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014254	TACTG	2	10	120360	120369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014254	TCATT	2	10	120397	120406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014254	AGATT	2	10	129538	129547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014254	TTATT	2	10	131349	131358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014254	TAAAA	2	10	131650	131659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014254	TCACA	2	10	134071	134080	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014254	ATTTG	2	10	135789	135798	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014254	AAAAT	2	10	136063	136072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014254	TTAAA	2	10	140686	140695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014254	GTATA	2	10	140927	140936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014254	TATAA	2	10	159011	159020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014254	TTTTA	2	10	159323	159332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014254	AAATG	2	10	160732	160741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014254	TTATT	2	10	161571	161580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014254	TTATT	2	10	161583	161592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014254	AATAA	2	10	161917	161926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014254	TTCAT	2	10	163484	163493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.