MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	ATTG	2	8	1661	1668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014254	ATCT	2	8	1930	1937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014254	TGCA	2	8	2184	2191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014254	ACTG	2	8	2451	2458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014254	AAAT	2	8	2538	2545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014254	TTAA	2	8	2556	2563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014254	TCAT	2	8	2769	2776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014254	ATAC	2	8	2981	2988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014254	TCCT	2	8	12452	12459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014254	AAGG	2	8	12740	12747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014254	GAAA	2	8	13222	13229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014254	ACAA	2	8	13302	13309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014254	ACAA	2	8	13420	13427	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014254	TTGA	2	8	13428	13435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014254	ATCA	2	8	13438	13445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014254	TAAC	2	8	18054	18061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014254	GACA	2	8	18130	18137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014254	TATT	2	8	24084	24091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014254	TAAT	2	8	24263	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014254	TAGA	2	8	26162	26169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014254	ACCA	2	8	26217	26224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014254	TGAT	2	8	26349	26356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014254	TTTC	2	8	26405	26412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014254	ATAA	2	8	32185	32192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014254	TTTA	2	8	33588	33595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014254	TGTT	2	8	34248	34255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014254	ATTA	2	8	34278	34285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014254	ATTT	2	8	34617	34624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014254	TAAA	2	8	36529	36536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014254	ATAA	2	8	37632	37639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014254	ATTC	2	8	40526	40533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014254	CAAA	2	8	40583	40590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014254	ATTT	2	8	40627	40634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014254	TAAC	2	8	41268	41275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014254	GATT	2	8	41292	41299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014254	GATT	2	8	41454	41461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014254	ATAA	2	8	43231	43238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014254	AATT	2	8	45130	45137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014254	TTAA	2	8	46160	46167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014254	TAAA	2	8	49016	49023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014254	TATT	2	8	49050	49057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014254	TGTA	2	8	49198	49205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014254	AGAT	2	8	49234	49241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014254	TCAT	2	8	50296	50303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014254	ATTA	2	8	50477	50484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014254	AAAT	2	8	50566	50573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014254	AATT	2	8	52325	52332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014254	CCAT	2	8	53327	53334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014254	ATTT	2	8	53593	53600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014254	TGAT	2	8	53753	53760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014254	ATTT	2	8	53777	53784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014254	ATTT	2	8	53868	53875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014254	TTAT	2	8	54393	54400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014254	GTGG	2	8	54976	54983	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014254	TAAT	2	8	56564	56571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014254	ACGC	2	8	58985	58992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014254	TTTG	2	8	59041	59048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014254	ATTA	2	8	59094	59101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014254	TAAG	2	8	59721	59728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014254	TTTG	2	8	59930	59937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014254	TTTC	2	8	60468	60475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014254	GATC	2	8	60585	60592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014254	TTCA	2	8	60844	60851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014254	TGTA	2	8	61929	61936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014254	GGAT	2	8	69401	69408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014254	TAAA	2	8	69422	69429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014254	ACCA	2	8	69579	69586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014254	ACCA	2	8	71530	71537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014254	TGAT	2	8	78137	78144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014254	ATTT	2	8	79280	79287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014254	AAAT	2	8	79381	79388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014254	ATTT	2	8	79518	79525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014254	TATT	2	8	79898	79905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014254	TATT	3	12	79928	79939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014254	AGTA	2	8	79976	79983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014254	CTAT	2	8	86568	86575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014254	TTCT	2	8	86699	86706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014254	TTGT	2	8	89630	89637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014254	ACCA	2	8	89718	89725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014254	TAGT	2	8	91698	91705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014254	TAGT	2	8	91898	91905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014254	CTAA	2	8	93791	93798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014254	CTTG	2	8	94909	94916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014254	TATT	2	8	95017	95024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014254	AATA	3	12	96071	96082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014254	GAAA	2	8	96600	96607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014254	CTTT	2	8	98167	98174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014254	TTAA	2	8	99113	99120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014254	ATTT	2	8	99219	99226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014254	AAAT	2	8	99562	99569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014254	TAAT	2	8	99636	99643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014254	TAAG	2	8	101454	101461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014254	AGTA	2	8	104750	104757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014254	AACA	2	8	111583	111590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014254	TACT	2	8	111672	111679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014254	GATT	2	8	114317	114324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014254	GACC	2	8	114786	114793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014254	TTTA	2	8	116820	116827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014254	CAAA	2	8	117116	117123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014254	AATT	2	8	117161	117168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014254	TCAA	2	8	120297	120304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014254	ATTA	2	8	120870	120877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014254	AAAC	2	8	121128	121135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014254	ATAG	2	8	127343	127350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014254	AAAG	2	8	127759	127766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014254	CATG	2	8	128573	128580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014254	AACC	2	8	128858	128865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014254	ACAA	2	8	128942	128949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014254	CTAT	2	8	129593	129600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014254	TAAT	2	8	131071	131078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014254	AGAT	2	8	131206	131213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014254	ATTT	2	8	131937	131944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014254	AAAT	2	8	132003	132010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014254	AGTA	2	8	132117	132124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014254	TTTG	2	8	133316	133323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014254	TCTA	2	8	135355	135362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014254	TTAA	2	8	135419	135426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014254	TTTA	2	8	140080	140087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014254	AAAT	2	8	140418	140425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014254	TTGA	2	8	140445	140452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014254	GTTT	2	8	140994	141001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014254	AAAT	2	8	141055	141062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014254	AATT	2	8	158874	158881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014254	TTTA	2	8	158954	158961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014254	TAAC	2	8	159415	159422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014254	AATA	2	8	159557	159564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014254	TGTT	2	8	160299	160306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014254	CGGA	2	8	161497	161504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014254	TAAT	2	8	161561	161568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014254	TAAA	2	8	163687	163694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014254	TTAT	2	8	163900	163907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.