MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	TCCC	2	8	2878	2885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_014214	ACGA	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014214	GCGA	2	8	4064	4071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014214	CCTT	2	8	5373	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014214	TACC	2	8	5443	5450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014214	AAAC	2	8	12143	12150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014214	TATT	2	8	16265	16272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014214	TCGG	2	8	21049	21056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014214	GCAA	2	8	21088	21095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014214	CGCC	2	8	25681	25688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014214	CTTC	2	8	26089	26096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014214	TTCC	2	8	26209	26216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014214	CCTG	2	8	27151	27158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014214	CCCG	2	8	29910	29917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_014214	CCGC	2	8	30369	30376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_014214	GGCC	2	8	30905	30912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014214	GTCC	2	8	44011	44018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014214	CCCT	2	8	65280	65287	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014214	GCGG	2	8	68377	68384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014214	TCGT	2	8	77448	77455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014214	CCCG	2	8	92187	92194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014214	GCGG	2	8	92294	92301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014214	GCCC	2	8	92345	92352	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_014214	ACCC	2	8	95662	95669	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014214	CTTC	2	8	95670	95677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014214	TCCC	2	8	98232	98239	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_014214	AAGC	2	8	104082	104089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014214	TTGG	2	8	104253	104260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014214	CCGC	2	8	104799	104806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_014214	GCCA	2	8	105869	105876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014214	CGGG	2	8	106521	106528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014214	CGCC	2	8	106637	106644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014214	AGCC	2	8	106646	106653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014214	GCGG	2	8	106838	106845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014214	CTTG	2	8	108835	108842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014214	CAGC	2	8	109158	109165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014214	CTAG	2	8	109309	109316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014214	TCCT	2	8	111150	111157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014214	CAGG	2	8	111194	111201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014214	GCCC	2	8	113109	113116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_014214	GGGC	2	8	113195	113202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.