MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GCT	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014214	TCC	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014214	CCT	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014214	ACC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014214	CCT	2	6	3633	3638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014214	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014214	GAT	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014214	GTC	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014214	CAG	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014214	CTG	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014214	ACC	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014214	GGA	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014214	GGT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014214	GCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014214	CAG	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014214	GCT	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014214	GGC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014214	GCC	2	6	5480	5485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014214	CTT	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014214	CCT	2	6	6113	6118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014214	GGC	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014214	GCC	2	6	6145	6150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014214	CCT	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014214	GGC	2	6	9211	9216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014214	GCC	2	6	9221	9226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014214	GGC	2	6	9776	9781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014214	GCC	2	6	9786	9791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014214	CCT	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014214	GGC	2	6	10494	10499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014214	GCC	2	6	10503	10508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014214	AGG	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014214	GGC	2	6	11593	11598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014214	GCC	2	6	11603	11608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014214	GCC	2	6	11622	11627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014214	CCG	2	6	11650	11655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014214	CCA	2	6	11824	11829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014214	GCC	2	6	11850	11855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014214	CGC	2	6	11871	11876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014214	TCC	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014214	CCT	2	6	12688	12693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014214	GGC	2	6	12710	12715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014214	GCC	2	6	12720	12725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014214	GCA	2	6	13964	13969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014214	ACA	2	6	14006	14011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014214	CAT	2	6	16189	16194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014214	CAA	2	6	16234	16239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014214	CCT	2	6	17614	17619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014214	GAG	2	6	17623	17628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014214	GCT	2	6	17754	17759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014214	AGC	2	6	17763	17768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014214	CAG	2	6	17775	17780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014214	TTA	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014214	GAA	2	6	18521	18526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014214	ATG	2	6	19387	19392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014214	CCT	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014214	GTA	2	6	20585	20590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014214	AGG	2	6	20605	20610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014214	AGC	2	6	21033	21038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014214	TAT	2	6	21065	21070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014214	TGT	2	6	21076	21081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014214	TGG	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014214	TCC	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014214	GAA	2	6	24716	24721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014214	GCG	2	6	25743	25748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014214	GCA	2	6	25829	25834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014214	GCG	2	6	25852	25857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014214	TCT	2	6	25903	25908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014214	GTA	2	6	25919	25924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014214	GCA	2	6	25947	25952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014214	GCT	2	6	25972	25977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014214	TCC	2	6	26001	26006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014214	TGA	2	6	26056	26061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014214	GGC	2	6	26153	26158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014214	TGC	2	6	26222	26227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014214	GGT	2	6	26236	26241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014214	GCG	2	6	26278	26283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014214	CGC	2	6	26371	26376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014214	CTT	2	6	26435	26440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014214	TCT	2	6	26548	26553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014214	GAA	2	6	26812	26817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014214	CCG	2	6	27039	27044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014214	GGC	2	6	27052	27057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014214	CCT	2	6	29108	29113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014214	TTA	2	6	29122	29127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014214	AGG	2	6	29188	29193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014214	AGG	2	6	29328	29333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014214	CTG	2	6	29769	29774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014214	TGG	2	6	29832	29837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014214	GCG	2	6	29841	29846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014214	GGC	2	6	29931	29936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014214	TCT	2	6	29952	29957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014214	CTG	2	6	29963	29968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014214	GCT	3	9	30037	30045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014214	TAC	2	6	30119	30124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014214	CGG	2	6	30242	30247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014214	AGC	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014214	GAG	2	6	30378	30383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014214	ATG	2	6	30385	30390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014214	GCG	2	6	30402	30407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014214	GCC	2	6	30421	30426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014214	GCG	2	6	30437	30442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014214	GGT	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014214	CCA	2	6	30592	30597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014214	TCC	2	6	30639	30644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014214	CGC	2	6	30651	30656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014214	CAG	2	6	30755	30760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014214	CCA	2	6	30787	30792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014214	TCC	2	6	30825	30830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014214	GGC	2	6	30995	31000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014214	TCG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014214	CCG	2	6	31125	31130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014214	GCC	2	6	31134	31139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014214	CCT	2	6	31183	31188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014214	GCC	2	6	31202	31207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014214	GGC	2	6	31229	31234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014214	GAT	2	6	31235	31240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014214	GGC	2	6	31252	31257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014214	TTC	2	6	31368	31373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014214	CCT	2	6	31381	31386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014214	GCC	2	6	33047	33052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014214	GCG	2	6	33081	33086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014214	GAC	2	6	34931	34936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014214	CCT	2	6	35085	35090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014214	CGG	2	6	35236	35241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014214	ACC	2	6	35303	35308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014214	GAG	2	6	35365	35370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014214	CGG	2	6	43835	43840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014214	GGC	2	6	43852	43857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014214	TGG	2	6	43875	43880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014214	TCG	2	6	43934	43939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014214	CGG	2	6	51447	51452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014214	GCC	2	6	51459	51464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014214	TCC	2	6	51465	51470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014214	GGT	2	6	51493	51498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014214	AGG	2	6	51563	51568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014214	AGG	2	6	56530	56535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014214	TCC	2	6	65231	65236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014214	TAC	2	6	65252	65257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014214	TGA	2	6	65298	65303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014214	AGG	2	6	68443	68448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014214	CCT	2	6	70120	70125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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143	NC_014214	CCG	2	6	77472	77477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_014214	CCT	2	6	91765	91770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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176	NC_014214	TCC	2	6	103925	103930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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266	NC_014214	AGG	2	6	121905	121910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.