MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 6778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014212	CTG	2	6	3181021	3181026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_014212	AGG	2	6	3181066	3181071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_014212	CAA	2	6	3181091	3181096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_014212	CAG	2	6	3181106	3181111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_014212	CTC	2	6	3181141	3181146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_014212	TGA	2	6	3181237	3181242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_014212	CTT	2	6	3181293	3181298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_014212	CTT	2	6	3181363	3181368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_014212	AGG	2	6	3181463	3181468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_014212	GAA	2	6	3181496	3181501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_014212	TCCTGG	2	12	3181523	3181534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_014212	TGG	2	6	3181613	3181618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_014212	AGA	2	6	3181685	3181690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_014212	CCT	2	6	3181713	3181718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_014212	CTC	2	6	3181719	3181724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_014212	TGG	2	6	3181734	3181739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_014212	CGC	2	6	3181772	3181777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_014212	GGT	2	6	3181829	3181834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_014212	GCG	2	6	3181841	3181846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_014212	GCT	2	6	3181853	3181858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_014212	AGG	2	6	3181889	3181894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_014212	CCT	2	6	3181937	3181942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_014212	TTCC	2	8	3181949	3181956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_014212	GTGG	2	8	3181961	3181968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_014212	CGG	2	6	3181991	3181996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_014212	GCT	2	6	3182048	3182053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_014212	CGG	2	6	3182067	3182072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_014212	CTT	2	6	3182087	3182092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_014212	GGGT	2	8	3182105	3182112	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_014212	TGG	2	6	3182226	3182231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_014212	G	6	6	3182279	3182284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_014212	AGA	2	6	3182291	3182296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_014212	AGG	2	6	3182319	3182324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_014212	CTC	2	6	3182441	3182446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_014212	CCAAAG	2	12	3182488	3182499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_014212	GCG	2	6	3182517	3182522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_014212	TTG	2	6	3182523	3182528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_014212	ACCCA	2	10	3182596	3182605	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6539	NC_014212	CGAC	2	8	3182717	3182724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_014212	GAAC	2	8	3182726	3182733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_014212	CGG	2	6	3182802	3182807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_014212	CCG	2	6	3182834	3182839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_014212	G	8	8	3182936	3182943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_014212	TGC	2	6	3182961	3182966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_014212	GCGG	2	8	3183094	3183101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_014212	CAGC	2	8	3183194	3183201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_014212	CCG	2	6	3183234	3183239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_014212	CGC	2	6	3183369	3183374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_014212	GAG	2	6	3183376	3183381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_014212	TGG	2	6	3183512	3183517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_014212	AAG	2	6	3183578	3183583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_014212	GGC	2	6	3184979	3184984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_014212	G	7	7	3186041	3186047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_014212	CTG	2	6	3186086	3186091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_014212	GAA	2	6	3186112	3186117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_014212	GGC	2	6	3186118	3186123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_014212	TTC	3	9	3186134	3186142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_014212	CAA	2	6	3186210	3186215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_014212	AAGGGT	2	12	3186653	3186664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_014212	TGA	2	6	3186764	3186769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_014212	TCCA	2	8	3186781	3186788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_014212	CAG	2	6	3186810	3186815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_014212	CGC	2	6	3186875	3186880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_014212	GAG	2	6	3186913	3186918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_014212	ATG	2	6	3186919	3186924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_014212	GGC	2	6	3186966	3186971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_014212	CAC	2	6	3187003	3187008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6568	NC_014212	CA	3	6	3187081	3187086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_014212	CTATC	2	10	3188304	3188313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6570	NC_014212	TA	3	6	3188377	3188382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_014212	CCG	2	6	3192770	3192775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_014212	TGA	2	6	3192896	3192901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_014212	TCCA	2	8	3192913	3192920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_014212	GGC	2	6	3193077	3193082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_014212	CGA	2	6	3193101	3193106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_014212	CGG	2	6	3193123	3193128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_014212	CG	3	6	3193154	3193159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_014212	CAG	2	6	3193161	3193166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_014212	TCC	2	6	3193180	3193185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_014212	GA	3	6	3193229	3193234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_014212	AAG	2	6	3193257	3193262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014212	GAG	2	6	3193353	3193358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_014212	TTA	2	6	3193410	3193415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_014212	GAA	2	6	3193501	3193506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_014212	GAA	3	9	3193535	3193543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014212	GCC	2	6	3195566	3195571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_014212	GT	3	6	3200002	3200007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_014212	CAC	2	6	3200124	3200129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_014212	CTT	2	6	3200145	3200150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_014212	ACG	2	6	3200262	3200267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_014212	TGG	2	6	3200374	3200379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_014212	CCT	2	6	3200454	3200459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_014212	A	6	6	3200489	3200494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014212	GCC	2	6	3200707	3200712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_014212	TCC	2	6	3201258	3201263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6596	NC_014212	TGC	2	6	3201344	3201349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_014212	AGC	2	6	3201445	3201450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_014212	GC	3	6	3201486	3201491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_014212	CCT	2	6	3201891	3201896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_014212	CTT	2	6	3201916	3201921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_014212	GGC	2	6	3201979	3201984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_014212	CTC	2	6	3203268	3203273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_014212	TTC	2	6	3203279	3203284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_014212	GAA	2	6	3203286	3203291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_014212	CTT	2	6	3203303	3203308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_014212	CGC	2	6	3203326	3203331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_014212	CAC	2	6	3203367	3203372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6608	NC_014212	GCG	2	6	3203399	3203404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_014212	GTC	2	6	3203423	3203428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_014212	AGA	2	6	3203455	3203460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_014212	GGC	2	6	3203513	3203518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_014212	GGGA	2	8	3205024	3205031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_014212	ATC	2	6	3206875	3206880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_014212	G	6	6	3206893	3206898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014212	ACC	2	6	3206947	3206952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_014212	GGT	2	6	3207003	3207008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_014212	GCC	2	6	3207027	3207032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_014212	T	6	6	3207052	3207057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_014212	GCC	2	6	3207103	3207108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_014212	C	6	6	3207115	3207120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6621	NC_014212	GCC	2	6	3207141	3207146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_014212	GGC	2	6	3207149	3207154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_014212	ACC	2	6	3207166	3207171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_014212	GTG	2	6	3207184	3207189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_014212	GGC	2	6	3207191	3207196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6627	NC_014212	GAG	2	6	3207269	3207274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_014212	CG	3	6	3209297	3209302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6629	NC_014212	G	6	6	3209331	3209336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_014212	GGC	2	6	3209367	3209372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_014212	C	6	6	3209375	3209380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6632	NC_014212	GAG	2	6	3209433	3209438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6634	NC_014212	GGA	2	6	3211980	3211985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6635	NC_014212	TCC	2	6	3212126	3212131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6638	NC_014212	CAAAA	2	10	3214016	3214025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6760	NC_014212	CTA	2	6	3233697	3233702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6761	NC_014212	CG	3	6	3233704	3233709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6762	NC_014212	CCT	2	6	3234820	3234825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6763	NC_014212	TGC	2	6	3236127	3236132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6764	NC_014212	GCA	2	6	3236162	3236167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6765	NC_014212	GTG	2	6	3236295	3236300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6766	NC_014212	CAGA	2	8	3236312	3236319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6767	NC_014212	CGC	2	6	3236371	3236376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6768	NC_014212	AT	3	6	3237538	3237543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6769	NC_014212	AT	3	6	3237547	3237552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6770	NC_014212	GCCT	2	8	3238266	3238273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6771	NC_014212	CAT	2	6	3238279	3238284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6772	NC_014212	C	6	6	3240282	3240287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6773	NC_014212	TCC	2	6	3240490	3240495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6774	NC_014212	C	6	6	3240524	3240529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6775	NC_014212	CTC	2	6	3242240	3242245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6776	NC_014212	GTT	2	6	3247358	3247363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6777	NC_014212	GTC	2	6	3249283	3249288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6778	NC_014212	C	6	6	3249327	3249332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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