MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylotenera versatilis 301 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014207	TAAATT	2	12	36651	36662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014207	AATTTT	2	12	67311	67322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014207	TTCACA	2	12	77887	77898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014207	CAATTA	2	12	85809	85820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014207	TAAATT	2	12	141060	141071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014207	ATTAAT	2	12	191540	191551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014207	AAATTT	2	12	217675	217686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014207	TCAGAG	2	12	224081	224092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014207	AAAAAT	2	12	233453	233464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014207	TAAAAA	2	12	242447	242458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014207	TTTATT	2	12	288595	288606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014207	ATGAAA	2	12	319504	319515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014207	TTAGAT	2	12	342052	342063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014207	AGCAAA	2	12	427253	427264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014207	GGTGCT	2	12	456368	456379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014207	AATTTT	2	12	547241	547252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014207	TTAAAA	2	12	581299	581310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014207	TTAAAA	2	12	738898	738909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014207	ATCATT	2	12	892441	892452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014207	TTTACT	2	12	915528	915539	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014207	CTCCGG	2	12	946412	946423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014207	GGCTCA	2	12	953481	953492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014207	CAAAGT	2	12	966006	966017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014207	ACTAAT	2	12	978873	978884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014207	ATGAAA	2	12	986608	986619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014207	CGAATT	2	12	990317	990328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014207	TCAAAA	2	12	1006666	1006677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014207	AATGTA	2	12	1102685	1102696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014207	TTTAAA	2	12	1172396	1172407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014207	ATTTTT	2	12	1213308	1213319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014207	TTTAAA	2	12	1233838	1233849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014207	AAGCAA	2	12	1267820	1267831	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014207	TTAATA	2	12	1268136	1268147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014207	AAATAA	2	12	1288800	1288811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014207	AAATGC	2	12	1317221	1317232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014207	ATTTTA	2	12	1333942	1333953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014207	AGTTGT	2	12	1351426	1351437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014207	CTCATT	2	12	1398688	1398699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014207	TAAATC	2	12	1426403	1426414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014207	TAAAAA	2	12	1427024	1427035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014207	TAATTT	2	12	1464032	1464043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014207	TTAAAC	2	12	1503052	1503063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014207	TACTTG	2	12	1506230	1506241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014207	GCTAAA	2	12	1561001	1561012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014207	CATTCT	2	12	1565609	1565620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014207	ATTAAA	2	12	1612730	1612741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014207	ATTTAT	2	12	1612789	1612800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014207	TGCCAA	2	12	1642687	1642698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014207	TACTAA	2	12	1688990	1689001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014207	GCAAAA	2	12	1708993	1709004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014207	TAGCTT	2	12	1767843	1767854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014207	CAACTA	2	12	1929706	1929717	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014207	GAGGCC	2	12	1975770	1975781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014207	GCTTTA	2	12	1979040	1979051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014207	TAAATT	2	12	1983003	1983014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014207	AAAACT	2	12	1997779	1997790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014207	ATAATT	2	12	2023219	2023230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014207	GATTTT	2	12	2026029	2026040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014207	AAAACA	2	12	2047121	2047132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014207	AATTAT	2	12	2059533	2059544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014207	ATATTC	2	12	2061905	2061916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014207	TAAAGT	2	12	2067189	2067200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014207	ATAATT	2	12	2145407	2145418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014207	TTAAAT	2	12	2175066	2175077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014207	AGGAAT	2	12	2257743	2257754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014207	TTTGAT	2	12	2287540	2287551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014207	CCATAC	2	12	2299263	2299274	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014207	TAAAAA	2	12	2320464	2320475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014207	AATTAA	2	12	2345922	2345933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014207	TCAATT	2	12	2365434	2365445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014207	TTATTG	4	24	2367642	2367665	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014207	AATTTA	2	12	2405710	2405721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014207	TTAAAA	2	12	2427639	2427650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014207	TTTCAG	2	12	2434079	2434090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014207	GATATA	2	12	2438846	2438857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014207	ACGCAA	2	12	2438864	2438875	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014207	TTAAAT	2	12	2438954	2438965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014207	TAATGT	2	12	2449338	2449349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014207	ATTATC	2	12	2470571	2470582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014207	GAATGA	2	12	2569246	2569257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014207	GAAATT	2	12	2577024	2577035	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014207	AATTAA	2	12	2577292	2577303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014207	AATTTA	2	12	2602194	2602205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014207	ACTTTA	2	12	2616181	2616192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014207	ATTTGT	2	12	2632920	2632931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014207	TATAAG	2	12	2639526	2639537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014207	AGTTTA	2	12	2649283	2649294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014207	TTTTAA	2	12	2706059	2706070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014207	AATAAA	2	12	2733728	2733739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014207	ATACAA	2	12	2777426	2777437	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014207	ATAAAA	2	12	2778116	2778127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014207	ATTAAA	2	12	2795147	2795158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014207	AAACCA	2	12	2798909	2798920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014207	TGAAGC	2	12	2799174	2799185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014207	ACCTAG	2	12	2799598	2799609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014207	TAAATT	2	12	2806669	2806680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014207	TTTATT	2	12	2812608	2812619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014207	TTTTAA	2	12	2915282	2915293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014207	TTTACA	2	12	2946760	2946771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014207	TTAAGA	2	12	2952595	2952606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014207	ACAAAA	2	12	2954518	2954529	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014207	AAAAAG	2	12	2976363	2976374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014207	TTTTAC	2	12	2997186	2997197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.