MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma crocodyli MP145 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014014	TTTAAA	2	12	79231	79242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014014	ATTTTG	2	12	80459	80470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014014	TGAAAA	2	12	80648	80659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014014	TTTGTT	2	12	83164	83175	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014014	GTTAAT	2	12	89075	89086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014014	ATTTTT	2	12	108648	108659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014014	TTTAAT	2	12	145430	145441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014014	ATTAAT	2	12	161391	161402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014014	CTGGAG	2	12	165938	165949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014014	CTGGAG	2	12	172185	172196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014014	TAGGAT	2	12	181868	181879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014014	CATTTT	2	12	182451	182462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014014	CATTTG	2	12	244712	244723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014014	TTTAAA	2	12	246144	246155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014014	ATATGA	2	12	296295	296306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014014	TTAAAA	2	12	296387	296398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014014	TTTTAG	2	12	297129	297140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014014	ATTTAT	2	12	301394	301405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014014	AAATTA	2	12	306785	306796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014014	ATTTTA	2	12	311585	311596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014014	TAAAAA	2	12	312433	312444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014014	AAAGAA	2	12	320413	320424	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014014	TAAATA	2	12	326752	326763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014014	ATTTTA	2	12	330092	330103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014014	AATTTA	2	12	332994	333005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014014	TTAAAT	2	12	347112	347123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014014	TTTGTT	2	12	348413	348424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014014	ATATTA	2	12	366170	366181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014014	TTTTAT	2	12	367414	367425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014014	TGAAGC	2	12	382330	382341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014014	TTACTT	2	12	399378	399389	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014014	TAAAAA	2	12	399515	399526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014014	TTTATT	2	12	399601	399612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014014	TTTAGC	2	12	402019	402030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014014	ATATTT	2	12	407581	407592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014014	GATATT	2	12	409963	409974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014014	TGAAAA	2	12	416888	416899	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014014	TATAAT	2	12	439524	439535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014014	TTTAAA	2	12	442984	442995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014014	GTTTGA	2	12	446103	446114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014014	AAAATG	2	12	446188	446199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014014	CTTTAA	2	12	459883	459894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014014	TAAATT	2	12	459923	459934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014014	TGTTTT	2	12	460859	460870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014014	TTGCAT	2	12	468807	468818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014014	TTTTTA	2	12	476148	476159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014014	AAAAGC	2	12	496428	496439	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014014	GAAAAA	2	12	496900	496911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014014	TAAAAA	2	12	498060	498071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014014	TAAAAA	2	12	499088	499099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014014	AAAATA	2	12	519467	519478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014014	ATATTA	2	12	523057	523068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014014	TAAATT	2	12	529344	529355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014014	ATAAAA	2	12	538299	538310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014014	CTTCTA	2	12	538761	538772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014014	TAGGAT	2	12	539424	539435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014014	CATTTT	2	12	540007	540018	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014014	ATAAAA	2	12	542133	542144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014014	TAAAAA	2	12	544503	544514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014014	TTTTTC	2	12	544723	544734	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014014	TTTCAA	2	12	557103	557114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014014	AATTAC	2	12	557181	557192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014014	GTTTTT	2	12	557286	557297	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014014	TAAATA	2	12	561770	561781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014014	TTATAT	2	12	566214	566225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014014	CAAAGT	2	12	570979	570990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014014	ACCATA	2	12	578115	578126	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014014	AAATAA	2	12	587334	587345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014014	TTTTAA	2	12	606497	606508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014014	TAATTT	2	12	607967	607978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014014	ATTACA	2	12	628280	628291	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014014	TTTATC	2	12	636718	636729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014014	ACGACA	2	12	672392	672403	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014014	ATATTG	2	12	673067	673078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014014	TTTCTT	2	12	675021	675032	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014014	TTCAAC	2	12	675976	675987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014014	AGCCAT	2	12	676093	676104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014014	TTAACT	2	12	676544	676555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014014	TAATAT	2	12	683218	683229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014014	ATTAAT	2	12	685117	685128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014014	ATTATA	2	12	694406	694417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014014	TATATT	2	12	694418	694429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014014	ATATGT	2	12	728454	728465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014014	ATTTTT	2	12	746003	746014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014014	AATAGA	2	12	747787	747798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014014	TACAAA	2	12	747862	747873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014014	TTGAAA	2	12	748575	748586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014014	ATATTT	2	12	752929	752940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014014	TAAAAT	2	12	761386	761397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014014	TTGCTT	2	12	761727	761738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014014	CAGTTG	2	12	762513	762524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014014	TTAAAA	2	12	768311	768322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014014	ATTTTA	2	12	792096	792107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014014	TAAAAA	2	12	818264	818275	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014014	TAAAAA	2	12	854394	854405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014014	AAAATT	2	12	854476	854487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014014	TAATTA	2	12	888361	888372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014014	CGAAAA	2	12	888896	888907	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014014	TAATTA	2	12	894309	894320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014014	TAATTA	2	12	896860	896871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014014	TTATAT	2	12	922300	922311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014014	TTTATT	2	12	922833	922844	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014014	AAAGCA	2	12	924400	924411	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.