MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma crocodyli MP145 chromosome

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014014	ATTTA	2	10	19627	19636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014014	TTTAA	2	10	19665	19674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014014	TATTT	2	10	44021	44030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014014	ATTTG	2	10	47379	47388	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014014	TTATA	2	10	50646	50655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014014	ATATT	2	10	50711	50720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014014	AAAGA	2	10	56377	56386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014014	TTATT	2	10	79787	79796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014014	AGTTT	2	10	80449	80458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014014	TATAT	2	10	80781	80790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014014	AAGCC	2	10	83199	83208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014014	AAAAT	2	10	83263	83272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014014	TTAAA	2	10	89008	89017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014014	TAAAG	2	10	95633	95642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014014	TAAAA	2	10	98422	98431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014014	ATAAA	2	10	99801	99810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014014	TTATA	2	10	109695	109704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014014	ATATA	2	10	111210	111219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014014	TTTAA	2	10	111231	111240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014014	AATTT	2	10	115856	115865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014014	TTATC	2	10	115991	116000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014014	AAATA	2	10	116044	116053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014014	TAATT	2	10	135130	135139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014014	TGTTA	2	10	135427	135436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014014	TAAAA	2	10	136902	136911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014014	TTAAT	2	10	139075	139084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014014	ATTTA	2	10	151200	151209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014014	CATTT	2	10	156656	156665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014014	TAATT	2	10	159432	159441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014014	TAAAT	2	10	161440	161449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014014	TCGTG	2	10	162627	162636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014014	GCTAC	2	10	162902	162911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014014	GGGAG	2	10	163941	163950	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014014	AAGCG	2	10	165288	165297	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014014	ATTTT	2	10	166450	166459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014014	TCGTG	2	10	168874	168883	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014014	GCTAC	2	10	169149	169158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014014	GGGAG	2	10	170188	170197	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014014	AAGCG	2	10	171535	171544	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014014	ATTAA	2	10	179503	179512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014014	TTATA	2	10	179549	179558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014014	TCTTT	2	10	181523	181532	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014014	ATTTT	2	10	182035	182044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014014	TTTTG	2	10	182224	182233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014014	TATAA	2	10	182674	182683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014014	TTTGG	2	10	194412	194421	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014014	TAATT	2	10	194484	194493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014014	TAAAA	2	10	196098	196107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014014	TAAAA	2	10	198869	198878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014014	ATAAA	2	10	200271	200280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014014	ATTTT	2	10	206582	206591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014014	TAAAT	2	10	213552	213561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014014	AAAAC	2	10	217089	217098	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014014	CACAA	2	10	217099	217108	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014014	AAAAT	2	10	217118	217127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014014	TTTTA	2	10	218009	218018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014014	ATTAA	2	10	219644	219653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014014	ATTTT	2	10	223628	223637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014014	CATTT	2	10	229061	229070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014014	TTCAT	2	10	229487	229496	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014014	CATTT	2	10	229709	229718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014014	TAATT	2	10	231453	231462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014014	AATTA	2	10	232023	232032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014014	TAATA	2	10	237439	237448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014014	AATTA	2	10	244869	244878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014014	ATACT	2	10	246104	246113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014014	TGATT	2	10	255593	255602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014014	TAATT	2	10	265541	265550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014014	TTTTA	2	10	269754	269763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014014	TAGGA	2	10	280274	280283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014014	ATAAA	2	10	295997	296006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014014	CAAAT	2	10	297681	297690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014014	TCAAT	2	10	297834	297843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014014	AGAAA	2	10	298284	298293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014014	AACAA	2	10	298537	298546	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014014	CAAAC	2	10	298862	298871	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014014	TTAAT	2	10	301458	301467	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014014	ATTTA	2	10	311679	311688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014014	ATTTT	2	10	311885	311894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014014	ATTTT	2	10	312338	312347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014014	TTTTA	2	10	316007	316016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014014	TTTTA	2	10	316269	316278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014014	ATTCA	2	10	320248	320257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014014	TAATT	2	10	326534	326543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014014	TTTTA	2	10	349743	349752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014014	TGGCG	2	10	349886	349895	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014014	AACAA	2	10	350041	350050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014014	TAAAA	2	10	350069	350078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014014	TATAT	2	10	358959	358968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014014	TTTAA	2	10	359040	359049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014014	TAAAT	2	10	366864	366873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014014	AGCAA	2	10	367443	367452	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014014	GCTTA	2	10	367471	367480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014014	ATTTT	2	10	368484	368493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014014	AAAAT	2	10	368682	368691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014014	GATAA	2	10	372402	372411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014014	ATGAA	2	10	373421	373430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014014	AATTA	2	10	373922	373931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014014	TAAAT	2	10	374609	374618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014014	TAATT	2	10	374717	374726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014014	TTTGA	2	10	374830	374839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014014	TGTCA	2	10	375664	375673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014014	AATTA	2	10	381235	381244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014014	GAAAA	2	10	381395	381404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014014	AAATG	2	10	381633	381642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014014	TAGAT	2	10	382282	382291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014014	AACAT	2	10	382502	382511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014014	AACTA	2	10	383012	383021	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014014	CAAAT	2	10	383194	383203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014014	ATTTA	2	10	401533	401542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014014	TTTTG	2	10	402667	402676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014014	ATAGT	2	10	405554	405563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014014	GGTAT	2	10	405703	405712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014014	AATTC	2	10	406472	406481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014014	TTTGA	2	10	407345	407354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014014	TTTTG	2	10	408365	408374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014014	CAATT	2	10	408742	408751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014014	TTTTG	2	10	409129	409138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014014	TTGAT	2	10	409271	409280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014014	ATTTT	2	10	416982	416991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014014	TTAAT	2	10	424277	424286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014014	TTGTA	2	10	426251	426260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014014	ATTTT	2	10	445861	445870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014014	CAACC	2	10	446896	446905	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014014	ATTAT	2	10	451658	451667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014014	TTTAG	2	10	458733	458742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014014	GTTGT	2	10	459366	459375	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014014	TTTAA	2	10	459840	459849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014014	AATAA	2	10	472926	472935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014014	ATTAT	2	10	476684	476693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014014	ATATG	2	10	489892	489901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014014	ATTAT	2	10	495718	495727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014014	TAGAA	2	10	495795	495804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014014	CAAAA	2	10	497003	497012	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014014	AAATT	2	10	499596	499605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014014	ATTTT	2	10	502076	502085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014014	TAAAA	2	10	503208	503217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014014	ATTAA	2	10	523227	523236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014014	ATTAT	2	10	536758	536767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014014	TATTT	2	10	538276	538285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014014	TCTTT	2	10	539079	539088	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014014	ATTTT	2	10	539591	539600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014014	TTTTG	2	10	539780	539789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014014	TAAAA	2	10	541590	541599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014014	ATATG	2	10	541733	541742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014014	TATTT	2	10	542110	542119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014014	GTTTT	2	10	544213	544222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014014	TATTT	2	10	555855	555864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014014	ATTTG	2	10	557366	557375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014014	AAATT	2	10	561854	561863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014014	TATAA	2	10	571455	571464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014014	ATTAA	2	10	571684	571693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014014	TAAAT	2	10	574031	574040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_014014	TAATT	2	10	577541	577550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014014	AAAAT	2	10	578191	578200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014014	TAATT	2	10	587268	587277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014014	TTAAT	2	10	587287	587296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014014	TAAAT	2	10	587402	587411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014014	CTTTT	2	10	590141	590150	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_014014	CATTT	2	10	620550	620559	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_014014	ATTTA	2	10	636904	636913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014014	AAGTG	2	10	636946	636955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014014	CTATA	2	10	638605	638614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_014014	TAAAA	2	10	651513	651522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014014	TAGCT	2	10	665417	665426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_014014	GTTTT	2	10	672731	672740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014014	TTAAA	2	10	683484	683493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_014014	TATAA	2	10	685149	685158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014014	ATATA	2	10	687027	687036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_014014	TATTT	2	10	710275	710284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014014	TAAAT	2	10	710908	710917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014014	GATTT	2	10	714002	714011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014014	CTTTT	2	10	715810	715819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_014014	GTTTT	2	10	717002	717011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_014014	TGATA	2	10	747122	747131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.