MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014002	TA	3	6	1812808	1812813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014002	A	6	6	1812833	1812838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014002	TAA	2	6	1812842	1812847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014002	ATA	2	6	1815008	1815013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014002	TA	3	6	1815012	1815017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014002	CAG	2	6	1815040	1815045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_014002	GGT	2	6	1815142	1815147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014002	T	6	6	1815181	1815186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014002	AAG	2	6	1815263	1815268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014002	TACA	2	8	1815278	1815285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_014002	AT	3	6	1815321	1815326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014002	GTT	2	6	1816922	1816927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014002	AAT	2	6	1816935	1816940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014002	TCA	2	6	1816944	1816949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014002	TTG	2	6	1816972	1816977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014002	TCAT	2	8	1816978	1816985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_014002	AT	3	6	1817003	1817008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014002	AAAT	2	8	1817012	1817019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014002	TA	3	6	1817038	1817043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014002	AGCC	2	8	1819945	1819952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_014002	CCA	2	6	1819953	1819958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_014002	AAT	2	6	1820033	1820038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014002	A	6	6	1820047	1820052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014002	TAC	2	6	1820409	1820414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014002	TTAA	2	8	1820432	1820439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014002	AC	3	6	1821842	1821847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_014002	AG	3	6	1827102	1827107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014002	ATA	2	6	1828756	1828761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014002	ATT	2	6	1828917	1828922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014002	GA	3	6	1829781	1829786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5032	NC_014002	AATC	2	8	1829873	1829880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_014002	GAA	2	6	1830683	1830688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014002	AAT	2	6	1830689	1830694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014002	GGA	2	6	1830745	1830750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_014002	AT	3	6	1834470	1834475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5041	NC_014002	TA	3	6	1834505	1834510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014002	AT	3	6	1834514	1834519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014002	TGA	2	6	1834522	1834527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014002	AATA	2	8	1834530	1834537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014002	TTAT	2	8	1835573	1835580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5050	NC_014002	ATT	2	6	1839922	1839927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014002	TTA	2	6	1839930	1839935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014002	GGT	2	6	1839942	1839947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5055	NC_014002	TAT	2	6	1841177	1841182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_014002	TAAAT	2	10	1841232	1841241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014002	GAA	2	6	1841701	1841706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014002	ATC	2	6	1841753	1841758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5063	NC_014002	T	6	6	1841780	1841785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014002	TG	3	6	1843114	1843119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014002	TAAT	2	8	1843123	1843130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014002	ACTTCC	2	12	1845179	1845190	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5069	NC_014002	CAG	2	6	1845339	1845344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5082	NC_014002	AG	3	6	1858519	1858524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_014002	TTG	2	6	1862679	1862684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_014002	T	6	6	1863046	1863051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014002	A	6	6	1863061	1863066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014002	GAG	2	6	1863071	1863076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_014002	TA	3	6	1863164	1863169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_014002	T	7	7	1864211	1864217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014002	ATTT	2	8	1864268	1864275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_014002	TAT	2	6	1869283	1869288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014002	ACA	2	6	1869299	1869304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_014002	TA	3	6	1869313	1869318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014002	CAGGA	2	10	1870364	1870373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5106	NC_014002	TA	3	6	1870387	1870392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_014002	ACA	2	6	1870737	1870742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_014002	ACCA	2	8	1870783	1870790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_014002	AT	3	6	1870811	1870816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014002	GAA	2	6	1873801	1873806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014002	TAC	2	6	1873821	1873826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_014002	AAAAGA	2	12	1874454	1874465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014002	TATTC	2	10	1874504	1874513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5117	NC_014002	AGGG	2	8	1874526	1874533	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014002	AAT	2	6	1874536	1874541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014002	TAA	2	6	1876510	1876515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014002	CATA	2	8	1876521	1876528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_014002	AATTA	2	10	1876534	1876543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014002	GCA	2	6	1876600	1876605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_014002	CCA	2	6	1876709	1876714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_014002	ACC	2	6	1878877	1878882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_014002	TCC	2	6	1880130	1880135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_014002	AT	3	6	1880792	1880797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014002	AAT	2	6	1880813	1880818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014002	TA	3	6	1881812	1881817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014002	AT	3	6	1881819	1881824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_014002	A	6	6	1881847	1881852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_014002	ATT	2	6	1883936	1883941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_014002	AAGA	2	8	1883970	1883977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_014002	GAA	2	6	1907637	1907642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5400	NC_014002	ATG	2	6	1960814	1960819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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