MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 442

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013946	GT	3	6	2992	2997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013946	CA	3	6	11522	11527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013946	GC	3	6	15545	15550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013946	AT	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013946	AC	3	6	25683	25688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013946	AC	3	6	25705	25710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013946	GC	3	6	27143	27148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013946	GA	3	6	30496	30501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013946	GC	3	6	46532	46537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013946	GC	3	6	50771	50776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013946	TG	3	6	50777	50782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013946	AC	4	8	65590	65597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013946	GT	3	6	72128	72133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013946	CT	3	6	88711	88716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013946	CG	3	6	96825	96830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013946	CG	3	6	97184	97189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013946	CG	3	6	97503	97508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013946	CG	3	6	98163	98168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013946	CG	3	6	98293	98298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013946	GC	3	6	98438	98443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013946	TC	3	6	98598	98603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013946	CT	3	6	100806	100811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013946	TG	4	8	119455	119462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013946	AG	3	6	124966	124971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013946	AG	3	6	130282	130287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013946	TA	3	6	133883	133888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013946	CA	3	6	152699	152704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013946	TC	3	6	159226	159231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013946	AC	3	6	161082	161087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013946	GC	3	6	161101	161106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013946	CA	3	6	166905	166910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013946	AG	3	6	168273	168278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013946	GT	3	6	188920	188925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013946	TA	3	6	189063	189068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013946	CA	3	6	199017	199022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013946	GC	3	6	210400	210405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013946	GC	3	6	211180	211185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013946	TG	3	6	222133	222138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013946	AT	3	6	232191	232196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013946	AC	3	6	233825	233830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013946	CT	3	6	237922	237927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013946	TC	3	6	257025	257030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013946	AC	3	6	257657	257662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013946	AC	3	6	257827	257832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013946	AG	3	6	267182	267187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013946	CA	3	6	271493	271498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013946	GT	3	6	277660	277665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013946	GA	3	6	285602	285607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013946	AG	3	6	287432	287437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013946	CG	4	8	293849	293856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013946	GT	3	6	301827	301832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013946	GT	3	6	301878	301883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013946	AC	3	6	303757	303762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013946	AC	3	6	307408	307413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013946	GC	3	6	308792	308797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013946	AC	3	6	308813	308818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013946	AG	3	6	314681	314686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013946	AT	3	6	315624	315629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013946	GT	3	6	316013	316018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013946	CT	3	6	327319	327324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013946	TG	3	6	337565	337570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013946	GC	3	6	337574	337579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013946	AT	3	6	337607	337612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013946	TA	3	6	362381	362386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013946	TG	4	8	362415	362422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013946	GC	3	6	363741	363746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013946	TG	3	6	372310	372315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013946	AC	3	6	392099	392104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013946	GC	3	6	394829	394834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013946	AC	3	6	399653	399658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013946	GC	3	6	399704	399709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013946	TG	3	6	419598	419603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013946	TA	3	6	426695	426700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013946	CT	3	6	455698	455703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013946	CG	3	6	468860	468865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013946	CG	3	6	472586	472591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013946	TG	3	6	476834	476839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013946	CA	3	6	476849	476854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013946	TC	3	6	476908	476913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013946	GT	3	6	478483	478488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013946	CG	3	6	482379	482384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013946	GC	3	6	482593	482598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013946	CG	3	6	483250	483255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013946	CT	3	6	483748	483753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013946	GC	3	6	483865	483870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013946	AG	3	6	483935	483940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013946	AG	3	6	484760	484765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013946	AT	3	6	485513	485518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013946	AT	3	6	485535	485540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013946	GT	3	6	490493	490498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013946	GA	3	6	492356	492361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013946	CG	3	6	494840	494845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013946	GA	3	6	498007	498012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013946	GC	3	6	520782	520787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013946	GA	3	6	532972	532977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013946	AC	3	6	533585	533590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013946	CG	3	6	533612	533617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013946	CT	3	6	537128	537133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013946	CT	3	6	538758	538763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013946	AT	3	6	541406	541411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013946	AC	3	6	551830	551835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013946	CT	3	6	553795	553800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013946	AC	3	6	555225	555230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013946	AG	3	6	557904	557909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013946	TG	3	6	559185	559190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013946	GC	3	6	560214	560219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013946	GC	3	6	575252	575257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013946	TC	3	6	583141	583146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013946	AT	3	6	588129	588134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013946	CA	3	6	590662	590667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013946	GT	3	6	590914	590919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013946	GT	3	6	591084	591089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013946	GA	3	6	591716	591721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013946	CA	3	6	658058	658063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013946	TG	3	6	669380	669385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013946	TA	3	6	673480	673485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013946	CG	3	6	674279	674284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013946	TG	3	6	676542	676547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013946	GC	3	6	687260	687265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013946	AC	3	6	687746	687751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013946	GT	3	6	691546	691551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013946	AT	3	6	699944	699949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013946	GT	3	6	711971	711976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013946	AG	3	6	712374	712379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013946	AC	3	6	718297	718302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013946	GC	3	6	736428	736433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013946	TG	3	6	749876	749881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013946	GT	3	6	772046	772051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013946	GC	3	6	773056	773061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013946	CG	3	6	773863	773868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013946	GC	3	6	786989	786994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013946	AC	3	6	814458	814463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013946	AT	3	6	823430	823435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013946	GC	3	6	831780	831785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013946	TG	3	6	834146	834151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013946	AT	3	6	854234	854239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013946	AG	3	6	856924	856929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013946	GA	4	8	857227	857234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013946	TC	3	6	888360	888365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013946	CA	3	6	888690	888695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013946	CT	3	6	888776	888781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013946	GC	3	6	889097	889102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013946	CG	3	6	889420	889425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013946	CT	3	6	890385	890390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013946	TC	3	6	891094	891099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013946	AG	3	6	891256	891261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013946	TG	3	6	892274	892279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013946	CA	3	6	904858	904863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013946	CA	4	8	913550	913557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013946	GC	3	6	914016	914021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013946	GT	3	6	915301	915306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013946	TG	3	6	921440	921445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013946	TG	3	6	932820	932825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.