MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 5723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013946	CAC	2	6	2746275	2746280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_013946	GAC	2	6	2746338	2746343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_013946	T	6	6	2746385	2746390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013946	G	6	6	2746406	2746411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013946	TGGG	2	8	2746453	2746460	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013946	AGC	2	6	2746604	2746609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_013946	G	6	6	2746738	2746743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013946	ACC	2	6	2746752	2746757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_013946	CCT	2	6	2749854	2749859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_013946	CCCT	2	8	2750039	2750046	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5011	NC_013946	GACC	2	8	2750098	2750105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_013946	CCT	2	6	2750148	2750153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_013946	GAG	2	6	2750159	2750164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013946	CCGA	2	8	2755205	2755212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_013946	AAG	2	6	2755261	2755266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_013946	GCT	2	6	2755308	2755313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013946	ACC	2	6	2756782	2756787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_013946	CCA	2	6	2756796	2756801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_013946	GCC	2	6	2756970	2756975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_013946	CG	3	6	2756984	2756989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_013946	GCA	2	6	2756996	2757001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013946	CCAC	2	8	2757020	2757027	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5023	NC_013946	CAT	2	6	2759683	2759688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_013946	A	6	6	2762145	2762150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013946	CGG	2	6	2762170	2762175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_013946	TCG	2	6	2762376	2762381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013946	CCT	2	6	2764467	2764472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013946	A	8	8	2765763	2765770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013946	CCGC	2	8	2765771	2765778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5030	NC_013946	TG	3	6	2765783	2765788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013946	T	7	7	2765843	2765849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013946	ATC	2	6	2765859	2765864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_013946	TCC	2	6	2767219	2767224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_013946	CAGTTT	2	12	2767235	2767246	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5035	NC_013946	TG	3	6	2767256	2767261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013946	A	6	6	2767264	2767269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013946	ATC	2	6	2767276	2767281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_013946	GC	4	8	2769070	2769077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_013946	CAA	2	6	2770193	2770198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_013946	TGG	2	6	2770296	2770301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013946	CACC	2	8	2770367	2770374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5042	NC_013946	CGGG	2	8	2770392	2770399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_013946	G	6	6	2770397	2770402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013946	CACCCC	2	12	2770489	2770500	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
5045	NC_013946	TGC	2	6	2770505	2770510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013946	GGT	2	6	2770516	2770521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013946	GCG	2	6	2770566	2770571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013946	GGC	2	6	2770592	2770597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_013946	GCGT	2	8	2770641	2770648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_013946	CCCAA	2	10	2770676	2770685	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5051	NC_013946	TGA	2	6	2770702	2770707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013946	GCCGG	2	10	2775480	2775489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5053	NC_013946	TCC	2	6	2776992	2776997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_013946	CAG	2	6	2777003	2777008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013946	CTG	2	6	2777067	2777072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_013946	T	6	6	2783334	2783339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013946	CAG	2	6	2784576	2784581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013946	AAC	2	6	2787298	2787303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013946	CGCC	2	8	2787328	2787335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5060	NC_013946	AAAG	2	8	2787341	2787348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013946	ATA	2	6	2787395	2787400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013946	ATAA	2	8	2788807	2788814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013946	GCT	2	6	2791063	2791068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013946	G	6	6	2791825	2791830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013946	T	7	7	2791910	2791916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013946	G	6	6	2791917	2791922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_013946	GCAC	2	8	2791954	2791961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_013946	GAG	2	6	2792088	2792093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013946	TGCA	2	8	2792445	2792452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_013946	CA	4	8	2792451	2792458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_013946	CGG	2	6	2792461	2792466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_013946	AGCG	2	8	2792473	2792480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_013946	CCG	2	6	2792540	2792545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_013946	TAA	2	6	2792612	2792617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_013946	GC	3	6	2792885	2792890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_013946	AG	3	6	2792964	2792969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013946	TTG	2	6	2793059	2793064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_013946	GGCTG	2	10	2793101	2793110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5080	NC_013946	GGC	2	6	2793116	2793121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5082	NC_013946	TAGCG	2	10	2793394	2793403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5083	NC_013946	GGA	2	6	2793407	2793412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013946	GGC	2	6	2793475	2793480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_013946	GAA	2	6	2793831	2793836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013946	CGC	2	6	2793902	2793907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_013946	AG	3	6	2793975	2793980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013946	TGT	2	6	2794122	2794127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_013946	CCA	2	6	2794207	2794212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_013946	GCC	2	6	2795912	2795917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_013946	AGCCC	2	10	2798284	2798293	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5096	NC_013946	AAAGC	2	10	2798681	2798690	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5098	NC_013946	CCT	2	6	2798797	2798802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_013946	CAG	3	9	2799017	2799025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_013946	C	6	6	2799070	2799075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5101	NC_013946	CAG	2	6	2799104	2799109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013946	GCT	2	6	2799181	2799186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013946	C	6	6	2799206	2799211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5104	NC_013946	GC	3	6	2799220	2799225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_013946	GCA	2	6	2799248	2799253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_013946	GTT	2	6	2799408	2799413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013946	C	6	6	2799447	2799452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5110	NC_013946	CCT	2	6	2799474	2799479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_013946	AGCC	2	8	2799502	2799509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_013946	CTT	2	6	2799540	2799545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_013946	CGT	2	6	2799605	2799610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_013946	CTC	2	6	2799646	2799651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_013946	CTA	2	6	2799703	2799708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_013946	A	7	7	2807310	2807316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013946	CA	3	6	2807392	2807397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_013946	TCAAC	2	10	2809203	2809212	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5122	NC_013946	GTGG	2	8	2809241	2809248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013946	TTG	2	6	2810387	2810392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013946	T	7	7	2810464	2810470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013946	GTG	2	6	2810481	2810486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_013946	G	8	8	2810707	2810714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013946	GGCA	2	8	2810803	2810810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_013946	CAA	2	6	2810830	2810835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_013946	TTC	2	6	2810855	2810860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_013946	T	6	6	2810897	2810902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_013946	TGA	2	6	2810929	2810934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_013946	ACA	2	6	2815866	2815871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_013946	AGC	2	6	2815940	2815945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_013946	CGC	2	6	2815978	2815983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5136	NC_013946	CG	3	6	2815993	2815998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_013946	GTCACA	2	12	2816032	2816043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_013946	AGG	2	6	2816050	2816055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_013946	ACC	2	6	2816114	2816119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5140	NC_013946	G	6	6	2816137	2816142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_013946	CAAAA	2	10	2816153	2816162	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5142	NC_013946	TACT	2	8	2816166	2816173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5143	NC_013946	CTGGTG	2	12	2817692	2817703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5144	NC_013946	A	8	8	2819716	2819723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_013946	TAGCG	2	10	2820135	2820144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5146	NC_013946	AGA	2	6	2820176	2820181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_013946	C	6	6	2822290	2822295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5148	NC_013946	AGG	2	6	2822753	2822758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_013946	GC	3	6	2822824	2822829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5150	NC_013946	GTTTT	2	10	2822873	2822882	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_013946	CTTT	2	8	2822901	2822908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5152	NC_013946	CT	3	6	2822932	2822937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5153	NC_013946	TGC	2	6	2823106	2823111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_013946	CGG	2	6	2825339	2825344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5156	NC_013946	TTC	2	6	2826184	2826189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5157	NC_013946	AGG	2	6	2826220	2826225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_013946	C	6	6	2830850	2830855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5159	NC_013946	TCC	2	6	2834235	2834240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5160	NC_013946	TTG	2	6	2834246	2834251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_013946	CG	3	6	2834279	2834284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5162	NC_013946	A	6	6	2834347	2834352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_013946	T	6	6	2834368	2834373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_013946	CTCG	2	8	2834378	2834385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5165	NC_013946	C	6	6	2834408	2834413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5166	NC_013946	GGAC	2	8	2836648	2836655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5167	NC_013946	G	8	8	2838900	2838907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_013946	T	6	6	2838908	2838913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_013946	TTC	2	6	2840715	2840720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5172	NC_013946	GTT	2	6	2840802	2840807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5175	NC_013946	GTG	2	6	2843951	2843956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5177	NC_013946	TTTG	2	8	2846383	2846390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_013946	T	6	6	2847216	2847221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5187	NC_013946	T	6	6	2855284	2855289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_013946	AAAAC	2	10	2859914	2859923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5201	NC_013946	CTT	2	6	2860505	2860510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5204	NC_013946	CCG	2	6	2860654	2860659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5205	NC_013946	ATC	2	6	2860676	2860681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5211	NC_013946	CCCCT	2	10	2861255	2861264	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5212	NC_013946	CG	3	6	2861460	2861465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5213	NC_013946	ACCC	2	8	2861481	2861488	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5214	NC_013946	TACGG	2	10	2861502	2861511	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5217	NC_013946	C	6	6	2861681	2861686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5218	NC_013946	GTA	2	6	2861697	2861702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5220	NC_013946	GAC	2	6	2861777	2861782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5223	NC_013946	CTC	2	6	2861912	2861917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5229	NC_013946	CT	3	6	2862425	2862430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5230	NC_013946	CTCCC	2	10	2862613	2862622	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5235	NC_013946	TCT	2	6	2862924	2862929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5240	NC_013946	CTC	3	9	2863137	2863145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_013946	ACCC	2	8	2863177	2863184	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5242	NC_013946	CTACCG	2	12	2863195	2863206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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5248	NC_013946	TTCT	2	8	2864775	2864782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5249	NC_013946	GGTT	2	8	2864808	2864815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_013946	GGGGGT	2	12	2866998	2867009	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_013946	AGG	2	6	2868980	2868985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_013946	TCC	2	6	2870021	2870026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5253	NC_013946	CA	3	6	2870790	2870795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_013946	AGC	2	6	2873998	2874003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_013946	GGCCG	2	10	2875431	2875440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5256	NC_013946	TGGG	2	8	2876044	2876051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_013946	GC	3	6	2876054	2876059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5258	NC_013946	GCT	2	6	2876097	2876102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_013946	TTC	2	6	2876103	2876108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_013946	GCA	2	6	2876119	2876124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_013946	GGA	2	6	2876145	2876150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_013946	ACC	2	6	2877836	2877841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_013946	GAA	2	6	2878630	2878635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_013946	AT	3	6	2879629	2879634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_013946	GTT	2	6	2958824	2958829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5431	NC_013946	TG	3	6	2983022	2983027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_013946	AGCC	2	8	2983830	2983837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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