MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 1490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	TTCTT	2	10	1335	1344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013790	TTAAT	2	10	4981	4990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013790	TATTT	2	10	10469	10478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013790	ATTTT	2	10	10567	10576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013790	TGTGG	2	10	10577	10586	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013790	AATTC	2	10	13220	13229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013790	TTTTA	2	10	14193	14202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013790	TCTTT	2	10	14303	14312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013790	TAATC	2	10	16367	16376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013790	TAATA	2	10	17444	17453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013790	ATTTA	2	10	17610	17619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013790	CTTTT	2	10	19507	19516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013790	CTTTT	2	10	19539	19548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013790	TTATA	2	10	19690	19699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013790	AATGA	2	10	27654	27663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013790	TTTAT	2	10	33754	33763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013790	TATAT	2	10	39534	39543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013790	TTAAA	2	10	40586	40595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013790	TTGGG	2	10	49670	49679	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013790	TTTCT	2	10	51891	51900	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013790	AATTT	2	10	58928	58937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013790	AATTG	2	10	58987	58996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013790	AATAA	2	10	59352	59361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013790	AACTT	2	10	59490	59499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013790	ATCAA	2	10	64239	64248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013790	TAATT	2	10	64289	64298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013790	ATTTT	2	10	65603	65612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013790	ACTTA	2	10	65989	65998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013790	TTAAT	2	10	68334	68343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013790	TTGGT	2	10	76130	76139	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013790	TCATT	2	10	76998	77007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013790	TAAAT	2	10	77151	77160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013790	TCTAT	2	10	77261	77270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013790	TCCAA	2	10	77652	77661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013790	TTTAA	2	10	77843	77852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	AAAAT	2	10	83940	83949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	TTATA	2	10	87364	87373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013790	AATTT	2	10	96039	96048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013790	TATAA	2	10	96076	96085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013790	TATAA	2	10	96123	96132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013790	TAGTT	2	10	98396	98405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013790	TAGTT	2	10	98418	98427	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013790	TAGTT	2	10	98429	98438	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013790	TAGTT	2	10	98462	98471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013790	TAGTT	2	10	98473	98482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013790	TAGTT	2	10	98506	98515	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013790	TAGTT	2	10	98528	98537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013790	TAGTT	2	10	98539	98548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013790	TTGCT	2	10	98616	98625	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013790	TAACT	2	10	99536	99545	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013790	TTATT	2	10	99635	99644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013790	TAATT	2	10	99800	99809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013790	TAGTT	2	10	99844	99853	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013790	TTATT	2	10	100097	100106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013790	TACTT	2	10	100415	100424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013790	TAACT	2	10	100437	100446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013790	TAACT	2	10	100459	100468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013790	TTGAT	2	10	100624	100633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013790	ATATG	2	10	100669	100678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013790	ATATT	2	10	103468	103477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013790	ATTTT	2	10	120651	120660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013790	TAATT	2	10	121724	121733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013790	TTTAT	2	10	123074	123083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013790	TTAAT	2	10	123157	123166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013790	TATAT	2	10	123205	123214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013790	TGAAT	2	10	139879	139888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	TAATT	2	10	139918	139927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013790	TTTTA	2	10	140515	140524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013790	TTAAG	2	10	141764	141773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013790	ATTTT	2	10	148284	148293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013790	ATTTA	2	10	149603	149612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013790	TAATC	2	10	152513	152522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013790	TAAAT	2	10	154679	154688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013790	TTTAT	2	10	154742	154751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013790	TCTTA	2	10	154876	154885	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013790	TTTAT	2	10	169987	169996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013790	CTTAA	2	10	170121	170130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013790	TTTAA	2	10	170157	170166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013790	ATTTT	2	10	189316	189325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013790	AATAA	2	10	191184	191193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013790	GATTG	2	10	194280	194289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013790	ATTTT	2	10	197155	197164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013790	AGAAA	2	10	197330	197339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013790	AATTT	2	10	200153	200162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013790	TAAAT	2	10	200223	200232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013790	TAATG	2	10	202674	202683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013790	ATTAA	2	10	202701	202710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013790	TAGAT	2	10	202815	202824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013790	ATTAT	2	10	213885	213894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013790	TATTT	2	10	216556	216565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013790	TTTAG	2	10	219632	219641	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013790	TAAAT	2	10	222422	222431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013790	AAATT	2	10	222765	222774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013790	TAAAT	2	10	225592	225601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013790	TAAAT	2	10	226867	226876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013790	ATTTT	2	10	230537	230546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013790	TATTT	2	10	231060	231069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013790	ATTTT	2	10	233848	233857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013790	CTTTT	2	10	235422	235431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013790	CTTTT	2	10	235539	235548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013790	ATTTT	2	10	235549	235558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013790	TTATT	3	15	235568	235582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013790	AATTT	2	10	235665	235674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013790	TTTTA	2	10	238251	238260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013790	TTAGA	2	10	238928	238937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013790	TTTTA	2	10	240510	240519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013790	TTTTA	2	10	240568	240577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013790	TAAAA	2	10	251995	252004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013790	TTTTA	2	10	253351	253360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013790	TTTTG	2	10	253538	253547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013790	TTTTG	2	10	253598	253607	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013790	GACTA	2	10	256756	256765	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013790	AAAAT	2	10	256773	256782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013790	TTATA	2	10	259604	259613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013790	GATTT	2	10	260241	260250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013790	ATTTT	2	10	260290	260299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013790	AATAA	2	10	264857	264866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013790	ATATT	2	10	269851	269860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013790	TATTT	2	10	270518	270527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013790	AATTT	2	10	270570	270579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013790	TTACT	2	10	271207	271216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013790	TTATT	2	10	275416	275425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	TTTTC	2	10	277808	277817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013790	ATTTT	2	10	277932	277941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013790	TAATA	2	10	282406	282415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013790	ATTAA	2	10	282592	282601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	ATATT	2	10	286060	286069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013790	TAATC	2	10	287273	287282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013790	ATTTT	2	10	288774	288783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013790	TAATC	2	10	291196	291205	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013790	TTAAT	2	10	293146	293155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013790	TTATT	2	10	294330	294339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013790	ATTTA	2	10	294344	294353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013790	TCTAT	2	10	295386	295395	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013790	TTAAA	2	10	298045	298054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013790	TAGAT	2	10	300780	300789	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013790	ATTTA	2	10	301568	301577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013790	ATTGA	2	10	302687	302696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013790	ATTGA	2	10	302732	302741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013790	ATTGA	2	10	302777	302786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013790	TTTTA	2	10	303718	303727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013790	AAACA	2	10	303906	303915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013790	ATTTC	2	10	308598	308607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013790	TTATT	2	10	312473	312482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013790	TTATT	2	10	317342	317351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013790	AATTT	2	10	319425	319434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013790	ATTTT	2	10	320910	320919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013790	AACTA	2	10	321020	321029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013790	ATTTT	2	10	321047	321056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013790	TATAT	2	10	324379	324388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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