MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 8853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013790	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013790	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013790	CAT	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013790	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013790	AAT	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013790	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013790	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013790	GAT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013790	TTA	3	9	2438	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013790	ACA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013790	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013790	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013790	ATT	2	6	5038	5043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013790	TGA	3	9	5071	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013790	TCC	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013790	ATT	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013790	ATT	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013790	TAT	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013790	TAT	2	6	8722	8727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013790	ATT	2	6	8776	8781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013790	ATT	2	6	9380	9385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013790	TAT	2	6	9387	9392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013790	AAT	2	6	9406	9411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013790	ATA	2	6	9423	9428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013790	ATA	2	6	9437	9442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013790	TAT	2	6	9454	9459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013790	CTT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013790	AAT	2	6	9485	9490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013790	ATT	2	6	9524	9529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013790	TAT	2	6	9583	9588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013790	ATT	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013790	GGT	2	6	10510	10515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013790	TTG	2	6	10547	10552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013790	TTA	2	6	10722	10727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	GTT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	AAT	2	6	10826	10831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013790	ATG	2	6	12384	12389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013790	ATT	2	6	13174	13179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013790	TAT	2	6	14210	14215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013790	ATT	2	6	14219	14224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013790	ATT	2	6	14238	14243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013790	ATT	2	6	14289	14294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013790	ATT	2	6	14323	14328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013790	TAA	2	6	14351	14356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013790	ATT	2	6	14385	14390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013790	AAT	2	6	14449	14454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013790	ATG	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013790	TAA	2	6	14556	14561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013790	ATG	2	6	14703	14708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013790	ATA	2	6	14709	14714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013790	ATT	2	6	15003	15008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013790	TAT	2	6	15033	15038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013790	ATT	2	6	15097	15102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013790	ATA	2	6	15152	15157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013790	ATT	2	6	15193	15198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013790	ATT	2	6	15211	15216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013790	TCT	2	6	16384	16389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013790	CTT	2	6	16406	16411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013790	TAA	2	6	16629	16634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013790	ATT	2	6	16700	16705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013790	ATA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013790	AAG	2	6	16879	16884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013790	TAT	3	9	17342	17350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013790	GTT	2	6	17354	17359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013790	ATA	2	6	17593	17598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	TTC	2	6	17730	17735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013790	ATA	2	6	17847	17852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013790	TTA	2	6	18011	18016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013790	ATT	2	6	19583	19588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013790	ATT	2	6	19628	19633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013790	TAA	2	6	19657	19662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013790	ATT	2	6	19669	19674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013790	TAA	2	6	19721	19726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013790	TTA	2	6	19758	19763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013790	TAT	2	6	23717	23722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013790	TAT	2	6	26165	26170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013790	TAA	2	6	26208	26213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013790	TGT	2	6	26216	26221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013790	TAT	2	6	26313	26318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013790	ATT	2	6	27594	27599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013790	ATT	2	6	27609	27614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013790	ATT	3	9	33745	33753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013790	ATT	2	6	33789	33794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013790	TAT	3	9	33836	33844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013790	ATA	2	6	33923	33928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013790	CCT	2	6	33931	33936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013790	CAA	2	6	33989	33994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013790	TTA	2	6	34044	34049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013790	ATT	2	6	34765	34770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013790	ATT	2	6	35572	35577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013790	GAA	2	6	37054	37059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013790	GAA	2	6	37096	37101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013790	ATT	2	6	37115	37120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013790	CTA	2	6	37169	37174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013790	TAA	2	6	37211	37216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013790	CAC	2	6	39510	39515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013790	ATT	2	6	39584	39589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013790	TAA	2	6	39609	39614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013790	ATT	2	6	39650	39655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013790	TAT	2	6	39700	39705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013790	ATT	2	6	40494	40499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013790	TAT	2	6	40568	40573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013790	ATT	2	6	40614	40619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013790	TGA	2	6	40691	40696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013790	TAT	2	6	40803	40808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013790	TTA	2	6	41021	41026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013790	AGG	2	6	41073	41078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013790	ATA	2	6	41620	41625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013790	ATC	2	6	46278	46283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013790	AAT	2	6	46317	46322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013790	CCT	2	6	46363	46368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013790	ATA	2	6	46405	46410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013790	AAT	2	6	46412	46417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013790	TTA	2	6	46432	46437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013790	TAT	2	6	46605	46610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013790	CAC	2	6	47624	47629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013790	TAA	2	6	47812	47817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013790	CTA	2	6	48959	48964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013790	ATT	2	6	48978	48983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013790	CTT	2	6	49302	49307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013790	ATT	2	6	49318	49323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	ATT	2	6	49348	49353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013790	TCT	2	6	49765	49770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013790	ATC	2	6	49775	49780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013790	ATT	2	6	49805	49810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	CTC	2	6	49843	49848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013790	TAT	2	6	49939	49944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013790	ATT	2	6	51940	51945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013790	TAA	2	6	53325	53330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013790	CTA	2	6	53364	53369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013790	CTA	2	6	53404	53409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013790	CTA	2	6	53444	53449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013790	CTA	2	6	53484	53489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013790	TAT	2	6	53508	53513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013790	TAT	2	6	53521	53526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013790	ATT	2	6	56942	56947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013790	ATT	2	6	57003	57008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013790	TAT	3	9	58754	58762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013790	TAT	2	6	58944	58949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013790	ACT	2	6	59036	59041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013790	TTC	2	6	59233	59238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013790	TTA	2	6	59295	59300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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