MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 1041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	AGTT	2	8	171	178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013665	ACAT	2	8	539	546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013665	CTTT	2	8	24837	24844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013665	AATA	2	8	27047	27054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013665	CCGC	2	8	30567	30574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_013665	CCGG	2	8	38607	38614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013665	GGGC	2	8	39153	39160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013665	CAGG	2	8	39222	39229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013665	TCAA	2	8	42332	42339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013665	CTAA	2	8	46543	46550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013665	TTAA	2	8	51989	51996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013665	AATA	2	8	57635	57642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013665	CAGG	2	8	63145	63152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013665	CGTC	2	8	65246	65253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013665	ATTT	2	8	76776	76783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013665	TGAT	2	8	80788	80795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013665	ATTT	2	8	88921	88928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013665	AGCG	2	8	92569	92576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013665	AAGC	2	8	92596	92603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013665	TCCC	2	8	95393	95400	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013665	TAAT	2	8	95497	95504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013665	GGGA	2	8	99622	99629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013665	CGGT	2	8	99747	99754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013665	TGGT	2	8	106446	106453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013665	GGAT	2	8	106735	106742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013665	CGAG	2	8	107619	107626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013665	AGGA	2	8	107700	107707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013665	GTGG	2	8	108424	108431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013665	GAAG	2	8	109355	109362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013665	CGGG	2	8	109757	109764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013665	GGGC	2	8	111505	111512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013665	GCCC	2	8	111907	111914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013665	CCAG	2	8	111920	111927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013665	AATA	2	8	119629	119636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013665	ATTT	2	8	119646	119653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013665	ATCC	2	8	122139	122146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013665	TAAA	2	8	125206	125213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013665	TACA	2	8	130149	130156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013665	AAAT	2	8	138049	138056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013665	CTTT	2	8	143926	143933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013665	TCAG	2	8	144161	144168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013665	AAAT	2	8	147259	147266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013665	CTTT	2	8	149022	149029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013665	TTTG	2	8	152314	152321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013665	TCTT	2	8	152387	152394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013665	GATG	2	8	152414	152421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013665	GCGG	2	8	152436	152443	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013665	TGGC	2	8	152447	152454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013665	TCAG	2	8	152559	152566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013665	TGCC	2	8	152718	152725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013665	CTCC	2	8	154862	154869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_013665	TAAA	2	8	164408	164415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013665	CTAA	2	8	170453	170460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013665	GTTA	2	8	173622	173629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013665	GTAT	2	8	174522	174529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013665	ACTC	2	8	180431	180438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013665	GAAA	2	8	190210	190217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013665	GCAA	2	8	192453	192460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013665	ACCC	2	8	192545	192552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_013665	AATG	2	8	192691	192698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013665	ACAA	2	8	192857	192864	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013665	GTTT	2	8	197767	197774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013665	ATTA	2	8	204047	204054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013665	TTAA	2	8	204106	204113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013665	CGTT	2	8	221051	221058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013665	ACCG	2	8	221195	221202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013665	TTTG	2	8	225366	225373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013665	AGCT	2	8	228454	228461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013665	TTAT	2	8	235674	235681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013665	TAAA	2	8	238232	238239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013665	ATTA	2	8	239124	239131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013665	AAAT	2	8	239151	239158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013665	TTAA	2	8	244159	244166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013665	TATT	2	8	252575	252582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013665	ATTA	2	8	265567	265574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013665	TTAC	2	8	270955	270962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013665	ACCG	2	8	273189	273196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013665	ACCG	2	8	275294	275301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013665	AATG	2	8	277399	277406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013665	GCTC	2	8	279361	279368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013665	ACCT	2	8	281277	281284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013665	AAGG	2	8	281296	281303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013665	ATTT	2	8	284842	284849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013665	TCAT	2	8	303773	303780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013665	CGAG	2	8	312406	312413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013665	GGCA	2	8	314884	314891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013665	ACCA	2	8	332582	332589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013665	AAAG	2	8	352249	352256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013665	TTCA	2	8	354501	354508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013665	AGGA	2	8	356203	356210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013665	CATT	2	8	361023	361030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013665	GCCC	2	8	363330	363337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_013665	AATC	2	8	376353	376360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013665	AATG	2	8	377222	377229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013665	AATT	2	8	392205	392212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013665	ATTT	2	8	400216	400223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013665	AGGA	2	8	400396	400403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013665	CTAA	2	8	400456	400463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013665	GCCA	2	8	404511	404518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013665	TAAA	2	8	409113	409120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013665	TTAA	2	8	410329	410336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013665	CGGT	2	8	418506	418513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013665	TAAT	2	8	419590	419597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013665	AGCT	2	8	419605	419612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013665	AGCG	2	8	422743	422750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013665	GGAT	2	8	424562	424569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013665	ATGA	2	8	424591	424598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013665	TAAT	2	8	424718	424725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013665	AAAT	2	8	424791	424798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013665	ACCG	2	8	424867	424874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013665	TTTC	2	8	424935	424942	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013665	GTAC	2	8	425694	425701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013665	CCGG	2	8	427200	427207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013665	AAAT	2	8	429521	429528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013665	AAAT	2	8	431424	431431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013665	TTTA	2	8	434628	434635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013665	TTTA	2	8	440907	440914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013665	AGGC	2	8	440917	440924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013665	ACCG	2	8	442002	442009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013665	CTGT	2	8	443910	443917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013665	ACCG	2	8	453432	453439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013665	AATG	2	8	458631	458638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013665	TTAT	2	8	459561	459568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013665	CTCC	2	8	459866	459873	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_013665	GAAT	2	8	463579	463586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013665	CTAT	2	8	471590	471597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013665	GTAC	2	8	471700	471707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013665	TACT	2	8	472148	472155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013665	TTAA	2	8	481403	481410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013665	TCAT	2	8	482895	482902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013665	AAAG	2	8	484680	484687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013665	CATA	2	8	488378	488385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013665	TAAC	2	8	488390	488397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013665	GTCG	2	8	488463	488470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013665	ATTT	2	8	488488	488495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013665	ACCG	2	8	488761	488768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013665	TTAT	2	8	489433	489440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013665	GCCC	2	8	498641	498648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_013665	TTTA	2	8	503699	503706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013665	TTAT	3	12	503820	503831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013665	ATAC	2	8	504154	504161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013665	GTAT	2	8	504199	504206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013665	TAGT	2	8	518837	518844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013665	ACGT	2	8	520135	520142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013665	TAAT	2	8	524118	524125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013665	CCAT	2	8	525029	525036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013665	GAAT	2	8	533950	533957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013665	CAAA	2	8	534036	534043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013665	GCCG	2	8	536000	536007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013665	AAAG	2	8	536048	536055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013665	AAAG	2	8	536108	536115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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