MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	ATAA	2	8	44	51	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	AAGG	2	8	464	471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	AATT	2	8	499	506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	TAAT	2	8	1782	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013156	ATTA	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013156	TTTC	2	8	3066	3073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013156	ATTA	2	8	19502	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013156	AATT	2	8	19513	19520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013156	TAAT	2	8	19557	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013156	AATT	2	8	24073	24080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013156	TTAT	2	8	24082	24089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013156	AATT	2	8	33707	33714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013156	AATT	2	8	33870	33877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013156	ATTT	2	8	34361	34368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013156	ATAA	2	8	34462	34469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013156	ATTT	2	8	38831	38838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013156	ATTT	2	8	40671	40678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013156	AATT	2	8	42450	42457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013156	TTAA	2	8	46038	46045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013156	TATT	2	8	46308	46315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013156	CAAT	2	8	60213	60220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013156	AATA	2	8	63301	63308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013156	TTTA	2	8	63678	63685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013156	TAAA	2	8	65447	65454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013156	ATTC	2	8	66613	66620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013156	ATAA	2	8	69856	69863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013156	ATTT	2	8	72490	72497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013156	AAAG	2	8	77379	77386	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013156	TTTA	2	8	97856	97863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013156	TAAA	2	8	98705	98712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013156	TCAA	2	8	98714	98721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013156	ATTT	2	8	101152	101159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013156	TTAT	2	8	101727	101734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013156	TATT	2	8	103043	103050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013156	TAAT	2	8	119117	119124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013156	TCAA	2	8	122539	122546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013156	TTAT	2	8	122547	122554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013156	ATTT	2	8	123385	123392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013156	AATT	2	8	128245	128252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013156	AACA	2	8	128339	128346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013156	ATTG	2	8	129344	129351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013156	TTTC	2	8	129654	129661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013156	TAAA	2	8	130651	130658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013156	TAAA	2	8	130671	130678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013156	CAAA	2	8	130681	130688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013156	CATT	2	8	133674	133681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013156	ATTT	2	8	133691	133698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013156	AAAT	2	8	140931	140938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013156	AAGG	2	8	144215	144222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013156	AAAG	2	8	151792	151799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013156	GTAT	2	8	155788	155795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	TCAC	2	8	155834	155841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013156	GGTA	2	8	155887	155894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013156	GAAA	2	8	157913	157920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013156	AGGG	2	8	158008	158015	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013156	CCAC	2	8	158029	158036	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_013156	TGAA	2	8	159207	159214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013156	AAAG	2	8	159779	159786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013156	ATTA	2	8	159801	159808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013156	TAAA	2	8	160712	160719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013156	AATA	2	8	162064	162071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013156	TAAA	2	8	180444	180451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013156	ATTT	2	8	180771	180778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013156	ATTT	2	8	182081	182088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013156	AAAT	2	8	185900	185907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013156	TTAA	2	8	185975	185982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013156	ATCA	2	8	185993	186000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013156	ATTT	2	8	188020	188027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013156	ATAA	2	8	190925	190932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013156	TCCC	2	8	191657	191664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_013156	CGAG	2	8	192518	192525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013156	GCAG	2	8	193280	193287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013156	GAGG	2	8	193797	193804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013156	CCGT	2	8	193834	193841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013156	GCCG	2	8	194459	194466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013156	GGTT	2	8	195892	195899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013156	TAAA	2	8	196336	196343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013156	CTGA	2	8	202573	202580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013156	ATAA	2	8	204336	204343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013156	AGGA	2	8	207218	207225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013156	TTAA	2	8	207238	207245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013156	TTAT	2	8	207888	207895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013156	CTCA	2	8	207948	207955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013156	TTAA	2	8	209700	209707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013156	AAAT	2	8	209726	209733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013156	ATTA	3	12	209751	209762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013156	CTAA	2	8	215588	215595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013156	ACAA	2	8	216943	216950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013156	ATTT	2	8	222042	222049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013156	TTAA	2	8	226135	226142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013156	TATT	2	8	228100	228107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013156	TTTG	2	8	229904	229911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013156	CCCA	2	8	230092	230099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_013156	AACT	2	8	230146	230153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013156	TTAA	2	8	230154	230161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013156	CTTA	2	8	235277	235284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013156	TAAT	2	8	238259	238266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013156	ATAA	2	8	238301	238308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013156	TAAT	2	8	252750	252757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013156	AGAA	2	8	259686	259693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013156	ATTC	2	8	259786	259793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013156	ATAA	2	8	261479	261486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013156	TTAA	2	8	261801	261808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013156	TAAG	2	8	261833	261840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013156	GTAT	2	8	261961	261968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013156	GTTT	2	8	275366	275373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013156	AAAT	2	8	279421	279428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013156	GCCG	2	8	280197	280204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013156	TAAT	2	8	280451	280458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013156	GATT	2	8	281962	281969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013156	GATT	2	8	282030	282037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013156	CTTT	2	8	282449	282456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013156	CATT	2	8	282971	282978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013156	ATTT	2	8	304323	304330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013156	TAAA	2	8	311869	311876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013156	ATTA	2	8	313011	313018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013156	CTAA	2	8	313316	313323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013156	TAAA	2	8	313367	313374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013156	TAAA	2	8	318545	318552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013156	AAGG	2	8	323867	323874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013156	TTAA	2	8	323998	324005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013156	ATAA	2	8	326049	326056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013156	TCCC	2	8	328061	328068	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_013156	ATTA	2	8	328161	328168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013156	TAAA	2	8	342632	342639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013156	TTAT	2	8	342743	342750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013156	TCCC	2	8	342915	342922	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_013156	ATTT	3	12	342952	342963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013156	ATTA	2	8	347143	347150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013156	AATG	2	8	347295	347302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013156	GCTC	2	8	347688	347695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013156	GTAT	2	8	358590	358597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013156	AAGG	2	8	358748	358755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013156	TTTA	2	8	360152	360159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013156	ATTT	2	8	360184	360191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013156	TCCC	2	8	361933	361940	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_013156	AAGG	2	8	361978	361985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013156	AATC	2	8	362029	362036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013156	AATA	2	8	362763	362770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013156	TTAA	2	8	370052	370059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013156	TAAA	2	8	371494	371501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013156	TATC	2	8	371503	371510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013156	TTTA	2	8	371534	371541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013156	AATT	2	8	372323	372330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013156	TCAA	2	8	374417	374424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013156	ATAA	2	8	375226	375233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013156	TTTA	2	8	377439	377446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013156	CATG	2	8	377477	377484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013156	CCTT	2	8	377616	377623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013156	AAAC	2	8	385321	385328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_013156	TAAA	2	8	386304	386311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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