MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 4959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013156	CG	3	6	1012794	1012799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_013156	CG	3	6	1012808	1012813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_013156	CTT	2	6	1013045	1013050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013156	CTGC	2	8	1013129	1013136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_013156	CTT	2	6	1013170	1013175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013156	CGAGC	2	10	1013184	1013193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3507	NC_013156	CCA	2	6	1013197	1013202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_013156	TGG	2	6	1013210	1013215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013156	T	6	6	1013454	1013459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013156	AGG	2	6	1013463	1013468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013156	C	6	6	1013514	1013519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3512	NC_013156	GT	3	6	1013595	1013600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013156	TAC	2	6	1013645	1013650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013156	TCC	2	6	1013815	1013820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_013156	CGG	2	6	1013831	1013836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013156	CTC	2	6	1013852	1013857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_013156	GGA	3	9	1013860	1013868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013156	GAC	2	6	1013935	1013940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013156	CAC	2	6	1013948	1013953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013156	GTC	2	6	1013974	1013979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013156	GGC	2	6	1014112	1014117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013156	GGT	2	6	1014279	1014284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013156	CCA	2	6	1014445	1014450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_013156	GCC	2	6	1014456	1014461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_013156	GCT	2	6	1014474	1014479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013156	C	6	6	1014560	1014565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3527	NC_013156	CTG	2	6	1014599	1014604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013156	TGG	2	6	1014683	1014688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013156	CCA	2	6	1014698	1014703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_013156	CCG	2	6	1014714	1014719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_013156	GGC	2	6	1014734	1014739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013156	GGGA	2	8	1014752	1014759	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013156	CCT	2	6	1014770	1014775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_013156	TGC	2	6	1014990	1014995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013156	CAC	2	6	1015003	1015008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_013156	A	6	6	1015126	1015131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013156	A	6	6	1015133	1015138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013156	CCGGGA	2	12	1015142	1015153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_013156	ACCCC	2	10	1015199	1015208	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3540	NC_013156	GCAGGG	2	12	1015227	1015238	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3541	NC_013156	ATG	2	6	1015339	1015344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013156	CCGG	2	8	1015347	1015354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_013156	ACC	2	6	1015407	1015412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_013156	TGG	2	6	1015431	1015436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013156	A	7	7	1015520	1015526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013156	A	6	6	1015528	1015533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013156	CAG	2	6	1015547	1015552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013156	TA	3	6	1015735	1015740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013156	TAT	2	6	1015769	1015774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013156	ATT	2	6	1015795	1015800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013156	ATC	2	6	1016865	1016870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013156	CAC	2	6	1018247	1018252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_013156	A	6	6	1018262	1018267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013156	T	6	6	1018998	1019003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013156	T	6	6	1019005	1019010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013156	ATTTT	2	10	1019013	1019022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013156	ATTT	2	8	1019030	1019037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013156	TAT	2	6	1019043	1019048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013156	TCT	2	6	1022588	1022593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013156	CTT	2	6	1022602	1022607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013156	T	6	6	1022653	1022658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013156	GGA	2	6	1028400	1028405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013156	TAA	2	6	1028437	1028442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013156	ATA	2	6	1028451	1028456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013156	CTA	2	6	1028465	1028470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013156	AAC	2	6	1028517	1028522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_013156	CCA	2	6	1029199	1029204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_013156	TAAAAT	2	12	1029213	1029224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013156	A	6	6	1029936	1029941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013156	A	6	6	1030899	1030904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013156	A	6	6	1030906	1030911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013156	TAAAA	2	10	1030912	1030921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013156	A	6	6	1030918	1030923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013156	ATTT	3	12	1031781	1031792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_013156	TAG	2	6	1033448	1033453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013156	TAAT	2	8	1033456	1033463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013156	TA	3	6	1034372	1034377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013156	CAAT	2	8	1034383	1034390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_013156	AAT	2	6	1034403	1034408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_013156	ATG	3	9	1034412	1034420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_013156	ATT	2	6	1034486	1034491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_013156	T	6	6	1037235	1037240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013156	T	7	7	1037249	1037255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_013156	TATT	2	8	1037264	1037271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013156	TCA	2	6	1037341	1037346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_013156	AAG	2	6	1038486	1038491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013156	A	6	6	1038530	1038535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013156	TAATT	2	10	1038782	1038791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013156	TCA	2	6	1039030	1039035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013156	TAA	3	9	1039038	1039046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013156	A	7	7	1039067	1039073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013156	ATA	3	9	1039096	1039104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013156	TAA	2	6	1039122	1039127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013156	CCT	2	6	1039491	1039496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_013156	GGA	2	6	1039517	1039522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013156	ATC	2	6	1039559	1039564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_013156	AAC	2	6	1039583	1039588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013156	TA	3	6	1039603	1039608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013156	AT	3	6	1039619	1039624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013156	ATC	2	6	1040487	1040492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013156	TAA	2	6	1042045	1042050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013156	TAA	2	6	1042090	1042095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013156	A	6	6	1042111	1042116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013156	T	6	6	1042120	1042125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013156	T	6	6	1042199	1042204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_013156	TTGTT	2	10	1042242	1042251	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013156	TA	4	8	1042267	1042274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013156	TAAAA	2	10	1043826	1043835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013156	TAA	2	6	1044708	1044713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013156	A	6	6	1044728	1044733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013156	ACC	2	6	1045116	1045121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_013156	TA	4	8	1045152	1045159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013156	TA	3	6	1045176	1045181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013156	AAC	2	6	1045198	1045203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013156	TTTA	2	8	1046283	1046290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013156	ATA	3	9	1046324	1046332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013156	TGTT	2	8	1046349	1046356	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013156	ATA	2	6	1046376	1046381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013156	ATA	3	9	1046389	1046397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013156	CAGA	2	8	1046424	1046431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_013156	TAT	2	6	1046443	1046448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_013156	AGG	2	6	1046450	1046455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013156	AT	3	6	1046541	1046546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013156	TACA	2	8	1048069	1048076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_013156	TA	3	6	1048105	1048110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013156	AT	3	6	1048112	1048117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_013156	AT	5	10	1048137	1048146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3903	NC_013156	TAT	2	6	1129984	1129989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3904	NC_013156	AT	3	6	1132581	1132586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3905	NC_013156	TAA	2	6	1132595	1132600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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