MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 4959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013156	T	6	6	930200	930205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013156	ATTTT	2	10	930212	930221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013156	TA	3	6	930299	930304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_013156	TA	4	8	930313	930320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013156	TGT	2	6	930323	930328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013156	ATT	2	6	930342	930347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_013156	TTA	2	6	931463	931468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013156	ATT	2	6	931535	931540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013156	ATA	2	6	931547	931552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013156	ATT	2	6	931553	931558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_013156	TA	3	6	931596	931601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013156	TAC	2	6	931624	931629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013156	TTA	2	6	931630	931635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_013156	A	6	6	931643	931648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_013156	T	8	8	932704	932711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013156	T	6	6	932713	932718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013156	T	6	6	932746	932751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013156	ATC	2	6	932758	932763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_013156	AGA	2	6	936130	936135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013156	ATG	2	6	936176	936181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013156	TTG	2	6	936182	936187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013156	ACA	2	6	936571	936576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_013156	AATT	2	8	936586	936593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_013156	GGGGA	2	10	936618	936627	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_013156	ATT	3	9	941040	941048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013156	TA	3	6	941077	941082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013156	ACTTT	2	10	941132	941141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_013156	TAAAT	2	10	942040	942049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013156	TGA	2	6	942062	942067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013156	TA	3	6	942092	942097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013156	T	6	6	943360	943365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013156	T	6	6	943368	943373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013156	GAG	2	6	943967	943972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013156	ATC	2	6	947189	947194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013156	ATA	2	6	947220	947225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013156	A	7	7	947225	947231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013156	TA	3	6	947242	947247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_013156	TTA	2	6	948397	948402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_013156	T	6	6	948405	948410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013156	AT	3	6	948412	948417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013156	AG	3	6	948451	948456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_013156	ACTTT	2	10	948482	948491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3043	NC_013156	TAA	2	6	948501	948506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013156	TTA	2	6	948515	948520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013156	TAA	2	6	948528	948533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013156	TGAG	2	8	948536	948543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013156	ACT	2	6	948588	948593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3049	NC_013156	T	7	7	949782	949788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013156	A	6	6	949802	949807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013156	TTAA	2	8	949809	949816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013156	ATT	2	6	949846	949851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013156	TAT	2	6	950866	950871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013156	TGA	2	6	951673	951678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013156	A	7	7	951726	951732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013156	TAT	2	6	951737	951742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013156	A	6	6	951751	951756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_013156	TAT	2	6	954095	954100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013156	TCCCC	2	10	955594	955603	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3061	NC_013156	T	6	6	955606	955611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013156	CAT	2	6	955615	955620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_013156	A	6	6	955628	955633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013156	ATA	2	6	955664	955669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013156	TA	4	8	955684	955691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013156	T	7	7	955692	955698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013156	A	6	6	955705	955710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013156	TGT	2	6	955750	955755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013156	ATAAAT	2	12	955767	955778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3071	NC_013156	TAAAA	2	10	956626	956635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013156	AAT	2	6	956639	956644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013156	TCG	2	6	956654	956659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3075	NC_013156	TATT	2	8	956751	956758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013156	GTA	2	6	956954	956959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_013156	TAG	2	6	956966	956971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_013156	ACA	2	6	958002	958007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_013156	ATA	2	6	958022	958027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_013156	CCA	2	6	958032	958037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_013156	TAT	2	6	958055	958060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013156	TTCT	2	8	958061	958068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_013156	T	6	6	958073	958078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013156	ATA	2	6	958130	958135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_013156	AT	3	6	958264	958269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013156	TAT	2	6	958291	958296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_013156	TAT	2	6	958319	958324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_013156	CTTT	3	12	959588	959599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_013156	TAT	2	6	959605	959610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013156	AAT	2	6	959615	959620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_013156	AT	3	6	960237	960242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013156	TA	4	8	960253	960260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013156	A	6	6	960268	960273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_013156	TA	4	8	960298	960305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013156	AAAT	2	8	960320	960327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013156	AT	3	6	960332	960337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_013156	A	6	6	961625	961630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013156	GGT	2	6	961677	961682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013156	ACTTTA	2	12	966231	966242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3108	NC_013156	TAA	2	6	967893	967898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_013156	A	7	7	967897	967903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013156	ATA	2	6	970079	970084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013156	TAT	2	6	970122	970127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013156	AATT	2	8	970158	970165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013156	TTA	2	6	970168	970173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_013156	AT	3	6	970190	970195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_013156	A	6	6	970212	970217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_013156	A	6	6	970242	970247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_013156	ATA	2	6	970261	970266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013156	AGA	2	6	970297	970302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_013156	AATAAA	2	12	970310	970321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013156	AAT	2	6	970322	970327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_013156	AT	3	6	970326	970331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_013156	ATT	2	6	970334	970339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_013156	TAA	2	6	970341	970346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_013156	TTAATT	2	12	970354	970365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013156	AT	3	6	970387	970392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_013156	AAAAT	2	10	970395	970404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013156	A	6	6	970431	970436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013156	ATT	2	6	970450	970455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013156	AT	3	6	970468	970473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013156	CAA	2	6	970490	970495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_013156	A	6	6	970504	970509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_013156	AAAT	3	12	970524	970535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013156	CATGC	2	10	970537	970546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3134	NC_013156	TGG	2	6	970604	970609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_013156	ATA	2	6	970677	970682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_013156	AAC	2	6	970690	970695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_013156	A	7	7	970702	970708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_013156	ATGT	2	8	971273	971280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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