MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	GCCCG	2	10	6645	6654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_012987	GACTC	2	10	7255	7264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012987	CGGCG	2	10	11559	11568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012987	GAGGG	2	10	11766	11775	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012987	GTCCG	2	10	18447	18456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012987	GCGCC	2	10	20269	20278	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_012987	CTACA	2	10	20960	20969	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012987	TCGCC	2	10	22354	22363	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012987	CTGCG	2	10	26439	26448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012987	CTTCG	2	10	29177	29186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_012987	GCCGC	2	10	36387	36396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_012987	ACAGT	2	10	36787	36796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012987	CATTC	2	10	40973	40982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012987	GTTAA	2	10	41124	41133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012987	CGTAT	2	10	42475	42484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012987	GATCA	2	10	44927	44936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012987	GTACG	2	10	44978	44987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012987	GCCGC	2	10	46045	46054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012987	CCGCT	2	10	46550	46559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_012987	CGTGT	2	10	53520	53529	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012987	CGGCA	2	10	53808	53817	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012987	TTGCT	2	10	57092	57101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012987	CGTCG	2	10	60042	60051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012987	CGCGC	2	10	75825	75834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_012987	ATGCC	2	10	76313	76322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012987	CTCGT	2	10	76892	76901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012987	GTTGC	2	10	78438	78447	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012987	TCTGA	2	10	79852	79861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012987	ATCCA	2	10	86269	86278	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012987	CCCCT	2	10	86346	86355	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_012987	ATGGC	2	10	87126	87135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012987	CGGCT	2	10	87658	87667	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012987	GGTTC	2	10	89401	89410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012987	GCTTT	2	10	92069	92078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012987	GCGTT	2	10	92364	92373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012987	TCATA	2	10	94766	94775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012987	CGATC	2	10	97485	97494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012987	TCCGC	2	10	99479	99488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_012987	CGAGC	2	10	101601	101610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012987	GCTGC	2	10	101782	101791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012987	CGGCG	2	10	102611	102620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012987	CGGGG	2	10	102682	102691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012987	CCCGA	2	10	105129	105138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_012987	CGGCC	2	10	106160	106169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_012987	CTCCC	2	10	106176	106185	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_012987	CCCGG	2	10	114292	114301	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_012987	GCTGC	2	10	116714	116723	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012987	CCGCG	2	10	117167	117176	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_012987	CAAGC	2	10	119730	119739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_012987	TCGTT	2	10	135767	135776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.