MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CGAG	2	8	46	53	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012987	CATC	2	8	6709	6716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012987	CCGG	2	8	11329	11336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012987	GCGG	2	8	11457	11464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012987	CCGC	2	8	11551	11558	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_012987	CCGG	2	8	12421	12428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012987	GCGG	2	8	12788	12795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012987	CCCG	2	8	15882	15889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_012987	CGGG	2	8	18292	18299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012987	CCTG	2	8	20535	20542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012987	GCGG	2	8	20548	20555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012987	CGCA	2	8	20597	20604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012987	CGCA	2	8	20674	20681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012987	TCGG	2	8	21738	21745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012987	CTCG	2	8	22187	22194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012987	GACG	2	8	22576	22583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012987	CAGC	2	8	26620	26627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012987	TGCT	2	8	29036	29043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012987	TTGG	2	8	32199	32206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012987	GCCA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012987	GCTG	2	8	32759	32766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012987	CGCC	2	8	32909	32916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_012987	CGAG	2	8	34553	34560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012987	CGGT	2	8	34592	34599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012987	GGCG	2	8	34617	34624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012987	TGCA	2	8	36956	36963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012987	ATAC	2	8	39989	39996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012987	AAAT	2	8	40351	40358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012987	CATC	2	8	40712	40719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012987	ATGA	2	8	40941	40948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012987	TGAT	2	8	41204	41211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012987	TGGA	2	8	41366	41373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012987	CTTT	2	8	41680	41687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012987	TTAT	2	8	41939	41946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012987	CGAA	2	8	43233	43240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012987	TTGG	2	8	43280	43287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012987	TGGA	2	8	43749	43756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012987	GCTC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012987	TCGC	2	8	44136	44143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012987	CGAG	2	8	44211	44218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012987	CGAA	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012987	TACA	2	8	44530	44537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012987	TCGA	2	8	45225	45232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012987	CCTC	2	8	46068	46075	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_012987	GGCG	2	8	46468	46475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012987	GCCG	2	8	46693	46700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012987	GCCG	2	8	46880	46887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012987	CCAA	2	8	50315	50322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012987	TGGA	2	8	50890	50897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012987	TGTC	2	8	53500	53507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012987	CGGC	2	8	53718	53725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012987	CTGC	2	8	53765	53772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012987	ACCA	2	8	54123	54130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012987	TTGA	2	8	54546	54553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012987	ATTC	2	8	54628	54635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012987	ATCA	2	8	54797	54804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012987	TGGG	2	8	54943	54950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012987	CACG	2	8	55546	55553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012987	GGCC	2	8	55554	55561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012987	CGAG	2	8	55969	55976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012987	GGCA	2	8	56055	56062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012987	GCTC	2	8	56260	56267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012987	TGTT	2	8	58587	58594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012987	TCAA	2	8	58812	58819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012987	AATG	2	8	58954	58961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012987	AAGC	2	8	59094	59101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012987	TGGC	2	8	59472	59479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012987	GGCT	2	8	59868	59875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012987	CTGC	2	8	59930	59937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012987	CGTC	2	8	60153	60160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012987	CCAT	2	8	60664	60671	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012987	GGCA	2	8	62189	62196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012987	CCTG	2	8	62239	62246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012987	CGAT	2	8	63013	63020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012987	CGCT	2	8	63116	63123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012987	CTGA	2	8	64890	64897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012987	GCCG	2	8	65507	65514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012987	GGCC	2	8	65678	65685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012987	GCCT	2	8	66868	66875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012987	GGAT	2	8	66929	66936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012987	CGGG	2	8	68427	68434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012987	CCGC	2	8	68459	68466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_012987	CAGC	2	8	76153	76160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012987	AGGT	2	8	76175	76182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012987	GCCA	2	8	76190	76197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012987	GTCG	2	8	76270	76277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012987	CCCG	2	8	76341	76348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_012987	CGGC	2	8	76833	76840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012987	GAGG	2	8	76961	76968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012987	TTCC	2	8	78381	78388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012987	TCTG	2	8	79214	79221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012987	AGGC	2	8	79226	79233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012987	GGTG	2	8	79374	79381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012987	ACCG	2	8	81203	81210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012987	CTTG	2	8	82715	82722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012987	ATTG	2	8	82800	82807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012987	ATCG	2	8	82926	82933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012987	CATC	2	8	84000	84007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012987	GTCG	2	8	86135	86142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012987	AGGT	2	8	87397	87404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012987	TCGG	2	8	88759	88766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012987	TGGC	2	8	88859	88866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012987	GGGC	2	8	89001	89008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012987	AAAG	2	8	91759	91766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012987	GCGG	2	8	92283	92290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012987	GAAC	2	8	93435	93442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012987	CGAA	2	8	93467	93474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012987	CCAT	2	8	93661	93668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012987	CGGG	2	8	94899	94906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012987	GTTC	2	8	96016	96023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012987	CTGG	2	8	96619	96626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012987	GCGG	2	8	99491	99498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012987	CGAA	2	8	101328	101335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012987	ACCG	2	8	101833	101840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012987	CCCG	2	8	102282	102289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_012987	CGGG	2	8	102292	102299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012987	CGGC	2	8	105164	105171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012987	CCTC	2	8	105630	105637	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_012987	GAGG	2	8	105645	105652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012987	CGGT	2	8	114248	114255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012987	CAGG	2	8	115974	115981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012987	CCGG	2	8	116700	116707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012987	CGGC	2	8	116737	116744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012987	CCAG	2	8	119711	119718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012987	CGTG	2	8	126411	126418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012987	TCCT	2	8	126490	126497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012987	CCGC	2	8	135163	135170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_012987	CGAA	2	8	135703	135710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012987	TCCG	2	8	141484	141491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.