MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 chromosome

Total Repeats: 5017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012969	GAAT	2	8	13	20	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012969	GGC	2	6	56	61	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012969	TAA	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012969	CAG	2	6	1659	1664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012969	ATA	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012969	A	7	7	1718	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012969	ATT	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012969	TTA	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012969	TAT	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012969	ATC	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012969	A	6	6	5398	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012969	T	6	6	5420	5425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012969	A	7	7	6804	6810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012969	CTC	2	6	8097	8102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012969	CAT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012969	GGA	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012969	GTA	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012969	A	6	6	8649	8654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012969	GA	3	6	9267	9272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012969	TGC	2	6	9826	9831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012969	TCA	2	6	9906	9911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012969	TCAG	2	8	11436	11443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012969	GGCG	2	8	13779	13786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012969	TGC	2	6	13795	13800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012969	TGA	2	6	13917	13922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012969	A	6	6	13938	13943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012969	ATT	2	6	13964	13969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012969	GCA	2	6	13998	14003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012969	AATG	2	8	14006	14013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012969	GCATG	2	10	14027	14036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012969	GGCT	2	8	14037	14044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012969	GAT	2	6	15393	15398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012969	TGG	2	6	15458	15463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012969	CAG	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012969	GTT	2	6	15561	15566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012969	ATA	2	6	15570	15575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012969	AT	3	6	15606	15611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012969	CGG	2	6	15615	15620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012969	AAT	2	6	15636	15641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012969	GCA	2	6	19445	19450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012969	CTC	2	6	19930	19935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012969	T	6	6	19970	19975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012969	CCA	2	6	21897	21902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012969	CGG	2	6	21907	21912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012969	GCCA	2	8	21959	21966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012969	GAT	2	6	21981	21986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012969	CG	3	6	21998	22003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012969	ACA	2	6	24186	24191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012969	AT	3	6	24789	24794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012969	CCT	2	6	25747	25752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012969	T	6	6	25752	25757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012969	CCT	2	6	25783	25788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012969	GGA	2	6	30299	30304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012969	GCA	2	6	30324	30329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012969	CAT	2	6	33197	33202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012969	GTTT	2	8	33792	33799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012969	TG	3	6	33801	33806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012969	TCA	2	6	33853	33858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012969	GAT	2	6	39094	39099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012969	GTT	2	6	39890	39895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012969	ATT	2	6	40988	40993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012969	CGC	2	6	42429	42434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012969	TGCT	2	8	43315	43322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012969	TGCC	2	8	43354	43361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012969	TG	3	6	43362	43367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012969	TGA	2	6	43394	43399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012969	GCGG	2	8	43437	43444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012969	TGA	2	6	43515	43520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012969	CAAT	2	8	45864	45871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012969	GTCA	2	8	48694	48701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012969	GA	3	6	48707	48712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012969	TGG	2	6	52380	52385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012969	GCG	2	6	53657	53662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012969	AAT	2	6	55263	55268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012969	GCC	2	6	55291	55296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012969	A	6	6	57187	57192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012969	CAT	3	9	57197	57205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012969	GCC	2	6	57219	57224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012969	GCG	2	6	57225	57230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012969	CGG	2	6	57258	57263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012969	CGG	2	6	58196	58201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012969	GCC	2	6	58213	58218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012969	CGC	2	6	58230	58235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012969	GGA	2	6	58887	58892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012969	CAAG	2	8	59145	59152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012969	TG	3	6	59172	59177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012969	T	7	7	59194	59200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012969	GGT	2	6	59235	59240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012969	CAC	2	6	61482	61487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012969	ATA	2	6	64004	64009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012969	AT	3	6	65453	65458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012969	T	6	6	65503	65508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012969	CAA	2	6	66476	66481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012969	TTA	2	6	68740	68745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012969	TCAA	2	8	69159	69166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012969	A	6	6	69168	69173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012969	T	6	6	69189	69194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012969	GCG	2	6	70533	70538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012969	GATAGG	2	12	73082	73093	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012969	AAT	2	6	74367	74372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012969	TAA	2	6	74376	74381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012969	AAAT	2	8	74487	74494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012969	AAC	2	6	74615	74620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012969	GCG	2	6	74621	74626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012969	AGC	2	6	74639	74644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012969	TGA	2	6	74705	74710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012969	AAG	2	6	74724	74729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012969	TGAA	2	8	74840	74847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012969	GGC	2	6	74974	74979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012969	AG	3	6	75010	75015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012969	GCTT	2	8	75018	75025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012969	CTG	2	6	75028	75033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012969	AT	3	6	75056	75061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012969	TGG	2	6	75189	75194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012969	CCA	2	6	75204	75209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012969	CGA	2	6	75213	75218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012969	GAC	2	6	75238	75243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012969	GCA	2	6	75287	75292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012969	GTGA	2	8	75340	75347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012969	GAAA	2	8	75382	75389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012969	AAG	2	6	75431	75436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012969	CAG	2	6	75455	75460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012969	AGCG	2	8	75510	75517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012969	G	6	6	75602	75607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012969	GGA	2	6	75646	75651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012969	CTA	2	6	75759	75764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012969	GTT	2	6	75765	75770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012969	CTA	2	6	75936	75941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012969	TGC	2	6	75989	75994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012969	GTC	2	6	76001	76006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012969	TCGTG	2	10	76010	76019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012969	AAT	2	6	76060	76065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012969	CAT	2	6	76069	76074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012969	GGA	2	6	76113	76118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012969	AC	3	6	76333	76338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012969	AGT	2	6	76373	76378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012969	CCT	2	6	76474	76479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012969	GTT	2	6	76521	76526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012969	CCA	2	6	76627	76632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_012969	GTC	2	6	76692	76697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012969	TCC	2	6	76713	76718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_012969	TGA	2	6	76729	76734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012969	TATT	2	8	76763	76770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012969	GAA	2	6	76808	76813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012969	TGA	2	6	76837	76842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_012969	A	6	6	140190	140195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012969	CAG	2	6	140217	140222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_012969	TGG	2	6	140223	140228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012969	TGC	2	6	140242	140247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_012969	GA	3	6	140290	140295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012969	TAA	2	6	140417	140422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012969	CGG	2	6	141150	141155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_012969	CCCG	2	8	141164	141171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
294	NC_012969	AGCA	2	8	141194	141201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_012969	AGC	3	9	141856	141864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_012969	CTG	2	6	141898	141903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_012969	CGA	2	6	144284	144289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_012969	GC	3	6	144303	144308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
302	NC_012969	CAA	2	6	144316	144321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_012969	T	6	6	144342	144347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_012969	GCAA	2	8	144367	144374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
305	NC_012969	ATTG	2	8	144396	144403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
306	NC_012969	TTC	2	6	144421	144426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_012969	CAT	2	6	159457	159462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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319	NC_012969	TGG	2	6	159799	159804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_012969	GCC	2	6	159980	159985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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400	NC_012969	TGG	2	6	221287	221292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_012969	GC	3	6	237554	237559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
410	NC_012969	GCC	2	6	238127	238132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_012969	CTTG	2	8	238677	238684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
412	NC_012969	TGGA	2	8	240935	240942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
413	NC_012969	CAG	2	6	241815	241820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_012969	T	7	7	241891	241897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012969	ATG	2	6	241917	241922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012969	ATT	2	6	241976	241981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_012969	AT	3	6	242000	242005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_012969	AATT	2	8	242021	242028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012969	TAT	3	9	242031	242039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_012969	AACC	2	8	242071	242078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
421	NC_012969	CTG	2	6	242687	242692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_012969	AAC	2	6	242819	242824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_012969	GGCCAG	2	12	244427	244438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_012969	T	6	6	244476	244481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_012969	TAA	2	6	263293	263298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_012969	CAT	2	6	291058	291063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_012969	GAGT	2	8	291126	291133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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