MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012943	TGTACA	2	12	983411	983422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1502	NC_012943	AGG	2	6	983434	983439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012943	CG	3	6	983497	983502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_012943	CGT	2	6	983517	983522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_012943	TCG	2	6	984036	984041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_012943	ACC	2	6	984089	984094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_012943	CAG	2	6	984119	984124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_012943	CCG	2	6	984175	984180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_012943	GCG	2	6	984228	984233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_012943	GCT	2	6	986579	986584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_012943	CCCG	2	8	986588	986595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1512	NC_012943	CGA	2	6	986602	986607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012943	GACA	2	8	988273	988280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_012943	AGG	2	6	988338	988343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012943	CGG	2	6	988651	988656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012943	GT	3	6	992069	992074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012943	AGC	2	6	992129	992134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_012943	CTG	2	6	992166	992171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_012943	AGC	2	6	992226	992231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_012943	TGC	2	6	992238	992243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_012943	ATC	2	6	992287	992292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_012943	CTT	2	6	992302	992307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_012943	AGC	2	6	992356	992361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_012943	GCT	2	6	992431	992436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_012943	CAGC	2	8	992453	992460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_012943	TCG	2	6	992526	992531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_012943	TCA	2	6	992567	992572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_012943	GTC	2	6	992638	992643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012943	CG	3	6	992697	992702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_012943	CGG	2	6	992708	992713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_012943	CGC	2	6	992735	992740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_012943	CCG	2	6	992807	992812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_012943	GGT	2	6	994314	994319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012943	ATCG	2	8	995078	995085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_012943	CCG	2	6	995109	995114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_012943	CGC	2	6	996016	996021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_012943	CCG	2	6	996037	996042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_012943	CAA	2	6	997778	997783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012943	CGG	2	6	998415	998420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_012943	GCG	2	6	998428	998433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012943	GC	3	6	1001698	1001703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_012943	CGT	2	6	1001739	1001744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_012943	GCG	2	6	1002563	1002568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_012943	CAA	2	6	1002592	1002597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_012943	CGC	2	6	1002666	1002671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_012943	CTT	2	6	1004310	1004315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_012943	TTG	2	6	1004372	1004377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012943	CTA	2	6	1005446	1005451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_012943	GGCC	2	8	1005768	1005775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_012943	GC	3	6	1005869	1005874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_012943	TCG	2	6	1005940	1005945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_012943	GAC	2	6	1005960	1005965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_012943	GTG	2	6	1006009	1006014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012943	CGC	2	6	1006040	1006045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_012943	TGG	2	6	1006082	1006087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012943	CCG	2	6	1008643	1008648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_012943	CG	3	6	1008697	1008702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_012943	CGG	2	6	1008733	1008738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_012943	ACG	2	6	1008751	1008756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_012943	GCC	2	6	1008775	1008780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_012943	GGA	2	6	1008845	1008850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012943	CAC	2	6	1015378	1015383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_012943	CCG	2	6	1015479	1015484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_012943	GGC	2	6	1016579	1016584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_012943	TGG	2	6	1018437	1018442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012943	TCG	2	6	1018449	1018454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_012943	GCT	2	6	1018462	1018467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_012943	GGC	2	6	1018471	1018476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_012943	CGG	2	6	1018566	1018571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_012943	GCC	2	6	1018580	1018585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_012943	CGG	2	6	1018655	1018660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_012943	CAC	2	6	1018750	1018755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_012943	GGCG	2	8	1018770	1018777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_012943	CGTGT	2	10	1018830	1018839	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_012943	GTG	2	6	1018842	1018847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012943	GTGTG	2	10	1018887	1018896	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012943	GC	3	6	1022243	1022248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_012943	AGGC	2	8	1024681	1024688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_012943	CCG	2	6	1024731	1024736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_012943	ACC	2	6	1024772	1024777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_012943	CAC	2	6	1024796	1024801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_012943	GCC	2	6	1024877	1024882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_012943	GAG	2	6	1024886	1024891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012943	G	6	6	1026748	1026753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012943	CCAG	2	8	1028625	1028632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_012943	GCT	2	6	1028644	1028649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_012943	GC	3	6	1028663	1028668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_012943	CGC	2	6	1028680	1028685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_012943	GTG	2	6	1031045	1031050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012943	GCT	2	6	1032483	1032488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_012943	CCG	2	6	1032494	1032499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_012943	CGA	2	6	1032520	1032525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_012943	CGGGG	2	10	1032548	1032557	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1594	NC_012943	CCTACG	2	12	1032608	1032619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_012943	TAG	2	6	1032623	1032628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012943	AAT	2	6	1032713	1032718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012943	GT	3	6	1032752	1032757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_012943	AAGG	2	8	1032765	1032772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012943	GCT	2	6	1034749	1034754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_012943	GAT	2	6	1035098	1035103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012943	CGCAC	2	10	1035476	1035485	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1602	NC_012943	GGGT	2	8	1035522	1035529	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012943	TCGA	2	8	1036870	1036877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_012943	CG	3	6	1037289	1037294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_012943	TGG	2	6	1037295	1037300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012943	GTC	2	6	1037317	1037322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012943	GCGCA	2	10	1037323	1037332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1608	NC_012943	GCA	2	6	1038058	1038063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_012943	GGC	2	6	1038073	1038078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_012943	CGA	2	6	1038083	1038088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_012943	GGCA	2	8	1039206	1039213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_012943	GAG	2	6	1039220	1039225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012943	TTA	2	6	1039246	1039251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012943	ATC	2	6	1039269	1039274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_012943	CGA	2	6	1039289	1039294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_012943	GCT	2	6	1039295	1039300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_012943	GAG	2	6	1039320	1039325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012943	CGG	2	6	1039370	1039375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_012943	CGAA	2	8	1039415	1039422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_012943	CCG	2	6	1039447	1039452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_012943	CGC	2	6	1039460	1039465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_012943	GCCG	2	8	1039470	1039477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_012943	CGC	2	6	1039499	1039504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_012943	TG	3	6	1039513	1039518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012943	CGA	2	6	1039667	1039672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_012943	TCT	2	6	1039711	1039716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_012943	GAC	2	6	1039725	1039730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_012943	TCG	2	6	1039754	1039759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1630	NC_012943	GCG	2	6	1039798	1039803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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