MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	CGC	2	6	72	77	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012809	GGC	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012809	CGG	2	6	130	135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012809	GCG	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012809	CGA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012809	GCC	2	6	286	291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012809	CGG	2	6	296	301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012809	CGG	2	6	306	311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012809	AGC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012809	GCC	2	6	416	421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012809	AGA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012809	GCC	3	9	512	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012809	GAC	2	6	543	548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012809	CGA	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012809	CGC	2	6	602	607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012809	GGC	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012809	CCG	2	6	740	745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012809	GGC	2	6	779	784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012809	GTC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012809	GCC	2	6	839	844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012809	GAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012809	CCG	2	6	930	935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012809	GGC	2	6	956	961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012809	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012809	CAC	3	9	1411	1419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012809	GCC	2	6	1539	1544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012809	TCG	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012809	CTT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012809	CAT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012809	AGG	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012809	CTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012809	GGC	2	6	2580	2585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012809	GCG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012809	CGG	2	6	2690	2695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012809	GCC	2	6	2723	2728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012809	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012809	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012809	GCC	2	6	2929	2934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012809	GGC	2	6	2939	2944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012809	GCC	2	6	2960	2965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012809	GGC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012809	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012809	CAC	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012809	GGC	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012809	GCT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012809	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012809	GCG	2	6	3518	3523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012809	CTG	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012809	CAG	2	6	4768	4773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012809	GCA	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012809	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012809	CTG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012809	GCG	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012809	TGA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012809	CAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012809	CAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012809	AGG	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012809	AAT	2	6	10888	10893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012809	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012809	CAC	2	6	11053	11058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012809	GCC	2	6	11064	11069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012809	GAC	3	9	11104	11112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012809	GTT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012809	TGC	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012809	ACC	2	6	11213	11218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012809	TAA	2	6	11502	11507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012809	TTC	3	9	11635	11643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012809	GCC	2	6	11645	11650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012809	GCG	2	6	12045	12050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012809	GCT	2	6	12165	12170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012809	GCT	2	6	12284	12289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012809	CTT	2	6	12293	12298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012809	TTG	2	6	12310	12315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012809	GCC	2	6	12405	12410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_012809	TGG	2	6	12448	12453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012809	GCG	2	6	12480	12485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012809	CGG	2	6	12539	12544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012809	CTT	2	6	12665	12670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012809	TGC	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012809	TGG	2	6	12727	12732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012809	GCC	2	6	12787	12792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012809	CGA	2	6	12817	12822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012809	CCG	2	6	12861	12866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012809	TTC	2	6	12981	12986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012809	CTT	2	6	12998	13003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012809	TCG	2	6	13054	13059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012809	CTT	2	6	13106	13111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012809	GCT	2	6	13121	13126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012809	CGG	2	6	13156	13161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012809	GCC	2	6	13456	13461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012809	TTC	2	6	13475	13480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012809	TGC	2	6	13511	13516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012809	GCG	2	6	13539	13544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012809	AGA	2	6	13553	13558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012809	AAG	2	6	13630	13635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012809	GAA	2	6	13660	13665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012809	GAG	2	6	13699	13704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012809	CAC	2	6	13758	13763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012809	CTC	2	6	13912	13917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012809	GCC	2	6	13976	13981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012809	GCT	2	6	14016	14021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012809	AGG	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012809	GGC	2	6	14174	14179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012809	CAC	2	6	14208	14213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_012809	CGG	3	9	14273	14281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012809	GCG	4	12	14286	14297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012809	ATC	2	6	14365	14370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012809	GCC	2	6	14491	14496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012809	CCG	2	6	14581	14586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012809	CGG	2	6	14597	14602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012809	GGA	2	6	14633	14638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012809	TTG	2	6	14651	14656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012809	GCT	2	6	14804	14809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012809	GCA	2	6	15502	15507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012809	GCC	2	6	15698	15703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012809	GCG	2	6	15740	15745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012809	GCC	2	6	15800	15805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012809	GCC	2	6	15837	15842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012809	CGG	2	6	15888	15893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012809	TCT	2	6	15909	15914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012809	GAG	2	6	15925	15930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012809	CAG	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012809	ACA	2	6	16007	16012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012809	CGA	2	6	16244	16249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012809	CCA	2	6	16273	16278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012809	CGG	2	6	16377	16382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012809	CGC	2	6	16475	16480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012809	GCT	2	6	16519	16524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012809	GAT	2	6	16720	16725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012809	GGC	2	6	16741	16746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012809	CGC	3	9	16882	16890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012809	GCT	2	6	16891	16896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012809	GGC	2	6	16962	16967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012809	CTC	2	6	17027	17032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012809	GGC	2	6	17074	17079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012809	CGG	2	6	17168	17173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012809	CGC	2	6	17210	17215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012809	GCG	2	6	17225	17230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012809	CCG	2	6	17349	17354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_012809	CGC	2	6	17395	17400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_012809	GCC	2	6	17408	17413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_012809	GGC	2	6	17449	17454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012809	AGG	2	6	17475	17480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_012809	CGA	2	6	37845	37850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.