MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	GAAAAT	2	12	11194	11205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012806	TTTTTA	2	12	31211	31222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012806	TTTCTT	2	12	46937	46948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012806	TTTAAT	2	12	66101	66112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012806	ATTTTT	2	12	71195	71206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012806	TTTTAA	2	12	79604	79615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012806	GTTTTT	2	12	84175	84186	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012806	TCTTTT	2	12	91851	91862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012806	AATTAA	2	12	97226	97237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012806	TATTTT	2	12	103457	103468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012806	ATTTTT	2	12	127104	127115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012806	ATAAAA	2	12	177874	177885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012806	TTGTTT	2	12	180845	180856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012806	ATTTCA	2	12	181218	181229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012806	TTTTAT	2	12	181403	181414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012806	TAAAAG	2	12	186993	187004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012806	TGATTT	2	12	187761	187772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012806	TATAAA	2	12	200016	200027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012806	AAAATG	2	12	213520	213531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012806	ATATTA	2	12	256345	256356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012806	TAAAAA	2	12	256435	256446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012806	ATATTT	2	12	275755	275766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012806	TTAGTT	2	12	303915	303926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012806	TACTTT	2	12	351063	351074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012806	ATATTT	2	12	401473	401484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012806	ATTATA	2	12	401561	401572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012806	TAAAAA	2	12	434333	434344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012806	TTTTAG	2	12	466098	466109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012806	TTTAAA	2	12	511172	511183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012806	AATTAA	2	12	523512	523523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012806	ATTTTA	2	12	531502	531513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012806	AAAATC	2	12	552110	552121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012806	AATTTA	2	12	567722	567733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012806	ATTTTT	2	12	572320	572331	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012806	TATAAA	2	12	622777	622788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012806	TTTTTA	2	12	672184	672195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012806	AAAATG	2	12	737352	737363	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012806	TTTTAG	2	12	785232	785243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012806	TAAAAT	2	12	787472	787483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012806	CAAAAA	2	12	801286	801297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012806	AATTTT	2	12	801945	801956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012806	ATTTTT	2	12	802275	802286	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012806	ATTATA	2	12	802309	802320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012806	TAAATA	2	12	816963	816974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012806	TCAAAA	2	12	823717	823728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012806	TATTAG	2	12	828254	828265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012806	CTCCAG	2	12	828591	828602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012806	TTTAAT	2	12	830162	830173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.