MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 2604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012806	CTA	2	6	830802	830807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_012806	TCGC	2	8	830876	830883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_012806	CTA	2	6	830886	830891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_012806	ATT	2	6	830900	830905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_012806	TTTTC	2	10	830908	830917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2506	NC_012806	TGT	2	6	830919	830924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_012806	TTAG	2	8	830999	831006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_012806	TAT	2	6	831030	831035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_012806	CTT	2	6	831080	831085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_012806	CCA	2	6	831107	831112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_012806	CTTA	2	8	831119	831126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_012806	GTT	2	6	831244	831249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_012806	TAA	2	6	831250	831255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_012806	TTA	2	6	831276	831281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_012806	ATAC	2	8	831342	831349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_012806	TAAT	2	8	831354	831361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012806	AAAT	2	8	831364	831371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_012806	TAAAA	2	10	831383	831392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_012806	A	6	6	831389	831394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012806	A	6	6	831415	831420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_012806	AGG	2	6	831487	831492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_012806	TCA	2	6	831544	831549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_012806	GT	3	6	831626	831631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_012806	ACT	2	6	831731	831736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_012806	T	6	6	831736	831741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_012806	GTA	2	6	831777	831782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012806	GT	3	6	831796	831801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_012806	ATG	2	6	831821	831826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012806	CGT	2	6	831833	831838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_012806	TCC	2	6	831847	831852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_012806	AAAG	2	8	831903	831910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_012806	CACGA	2	10	831946	831955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2533	NC_012806	GAC	2	6	831959	831964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_012806	TAC	2	6	832128	832133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_012806	ACC	2	6	832177	832182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_012806	ATC	2	6	832191	832196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_012806	TTC	2	6	832299	832304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_012806	A	6	6	832423	832428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_012806	AAT	2	6	832449	832454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_012806	GCT	2	6	832489	832494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_012806	TAA	2	6	832519	832524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_012806	T	6	6	832558	832563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_012806	CAG	2	6	832576	832581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_012806	CTG	2	6	832657	832662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_012806	CAT	2	6	832730	832735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_012806	AACT	2	8	832761	832768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2547	NC_012806	TTC	2	6	832821	832826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_012806	A	6	6	832832	832837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_012806	TAT	2	6	832838	832843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012806	AGT	2	6	832867	832872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_012806	AGGT	2	8	832887	832894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012806	CTA	2	6	832920	832925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_012806	CATG	2	8	832958	832965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2554	NC_012806	CA	3	6	832973	832978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_012806	A	7	7	833013	833019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_012806	TTTAA	2	10	833027	833036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_012806	TGC	2	6	833074	833079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_012806	ATA	2	6	833100	833105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_012806	T	7	7	833116	833122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012806	T	6	6	833138	833143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_012806	T	8	8	833145	833152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_012806	TTG	2	6	833154	833159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_012806	AATT	2	8	833183	833190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012806	A	7	7	833205	833211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_012806	T	7	7	833221	833227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012806	T	7	7	833229	833235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_012806	ATT	2	6	833261	833266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_012806	TA	3	6	833289	833294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_012806	AT	3	6	833295	833300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_012806	A	6	6	833967	833972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_012806	GGAA	2	8	833973	833980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_012806	AGG	2	6	836069	836074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012806	TAT	2	6	836075	836080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_012806	A	6	6	841427	841432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_012806	GTT	2	6	841445	841450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_012806	T	6	6	841449	841454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_012806	TAAT	2	8	843690	843697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_012806	TAT	2	6	843708	843713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_012806	T	6	6	843713	843718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_012806	A	6	6	843760	843765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_012806	A	7	7	843796	843802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_012806	GAAA	2	8	843804	843811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_012806	A	6	6	843809	843814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_012806	T	7	7	843838	843844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_012806	CAA	2	6	845679	845684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_012806	TTC	2	6	845685	845690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_012806	T	6	6	845696	845701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_012806	T	6	6	845705	845710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_012806	CTT	2	6	845711	845716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_012806	A	6	6	845737	845742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_012806	AAT	2	6	845760	845765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_012806	TTA	2	6	845792	845797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_012806	T	6	6	845812	845817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_012806	T	6	6	845859	845864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_012806	TAA	2	6	845905	845910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_012806	T	6	6	845920	845925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_012806	TGC	2	6	845935	845940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_012806	ATT	2	6	845950	845955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_012806	CTT	2	6	846055	846060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_012806	CTG	2	6	846083	846088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_012806	GC	3	6	846096	846101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_012806	ATTT	2	8	846131	846138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_012806	T	6	6	846177	846182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_012806	CAA	2	6	846193	846198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.