MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Micrococcus luteus NCTC 2665 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012803	GCCACG	2	12	11575	11586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012803	CGTCTT	2	12	11863	11874	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012803	GCGAGG	2	12	11961	11972	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012803	GTCAGC	2	12	12396	12407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012803	GGATCG	2	12	14846	14857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012803	GGACGA	2	12	37671	37682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012803	TTTGAA	2	12	94667	94678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012803	CCGGCC	2	12	133243	133254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012803	CCGCCC	2	12	141667	141678	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
10	NC_012803	GCCCCG	2	12	155613	155624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012803	GCGGGG	2	12	193081	193092	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012803	AGGGTG	2	12	224914	224925	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012803	CAGGGC	2	12	225111	225122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012803	AGGCCC	2	12	225385	225396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012803	CACGAA	2	12	225426	225437	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012803	GTGGCG	2	12	229555	229566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012803	CCGTGA	2	12	231318	231329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012803	CGGCTC	2	12	244530	244541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012803	CACCGG	2	12	246437	246448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012803	CGAGGG	2	12	248399	248410	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012803	CCCCGG	2	12	256249	256260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012803	GCCCCC	2	12	281004	281015	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_012803	AGGGCG	2	12	356472	356483	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012803	CCGCTG	2	12	358568	358579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012803	CGACGG	2	12	359633	359644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012803	CCGGCA	2	12	360362	360373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012803	GCCCCC	2	12	364254	364265	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
28	NC_012803	TGGAGA	2	12	370222	370233	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012803	GGGGCC	2	12	406158	406169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012803	TCCCCG	2	12	414627	414638	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012803	GGGTTG	2	12	421660	421671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012803	AGTGCA	2	12	424393	424404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012803	GCGCCT	2	12	455048	455059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012803	AGGGGC	2	12	465288	465299	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012803	CCACGG	2	12	474048	474059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012803	CTCCGC	2	12	527846	527857	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012803	CCCGCC	2	12	548303	548314	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_012803	CGGGGC	2	12	560671	560682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012803	CGTCCC	2	12	573452	573463	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012803	CCCGGC	2	12	575591	575602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012803	TCGGGG	2	12	591925	591936	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012803	GCCGGC	2	12	593999	594010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012803	TCAACA	2	12	627416	627427	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012803	CCTCGA	2	12	636043	636054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012803	CGTGGG	2	12	642869	642880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012803	AGGCTG	2	12	711078	711089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012803	CCCGAC	2	12	721818	721829	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012803	CCCGGC	2	12	755781	755792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012803	GCGCCG	2	12	766332	766343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012803	CGTCCC	2	12	781840	781851	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012803	GAGGGG	2	12	801706	801717	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012803	CGGGGC	2	12	803078	803089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012803	GCCCGC	2	12	819873	819884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012803	ACGCGG	2	12	835998	836009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012803	AACCTC	2	12	854674	854685	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012803	CGGCTG	2	12	870282	870293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012803	AGGTGC	2	12	915378	915389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012803	GCCGGA	2	12	957270	957281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012803	CGCCTG	2	12	972652	972663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012803	GACCTC	2	12	989201	989212	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012803	GCACGG	2	12	989498	989509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012803	GCGGAC	2	12	1087497	1087508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012803	CACCGG	2	12	1091377	1091388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012803	CCCGCC	2	12	1091776	1091787	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
65	NC_012803	GCGTTG	2	12	1098430	1098441	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012803	GGTCGG	2	12	1104074	1104085	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012803	GGCGCG	2	12	1104445	1104456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012803	GCTGCC	2	12	1132179	1132190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012803	GACCCG	2	12	1132207	1132218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012803	TCCGTG	2	12	1154210	1154221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012803	CCGTCC	2	12	1174874	1174885	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012803	AGGACG	2	12	1216160	1216171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012803	CCGGCC	2	12	1238055	1238066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012803	CGGGCG	2	12	1248983	1248994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012803	GACCTC	2	12	1284556	1284567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012803	CCTCGC	2	12	1312855	1312866	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012803	GACGGG	2	12	1341475	1341486	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012803	ACGGCG	2	12	1351026	1351037	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012803	GCTCGA	2	12	1379658	1379669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012803	CCGGCC	2	12	1411638	1411649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012803	CCGCGG	2	12	1419715	1419726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012803	CCCCGG	2	12	1429922	1429933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012803	ACCTTC	2	12	1486984	1486995	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012803	CCGGGA	2	12	1502504	1502515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012803	CGATGC	2	12	1522533	1522544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012803	GCCTCG	2	12	1556905	1556916	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012803	TAACCC	2	12	1559384	1559395	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012803	TGCACT	2	12	1560153	1560164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012803	GCCGAC	2	12	1570617	1570628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012803	GCCCCC	2	12	1596423	1596434	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_012803	TCAGCT	2	12	1614934	1614945	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012803	CGGTGC	2	12	1615057	1615068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012803	TCGACC	2	12	1615386	1615397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012803	CGGAAC	2	12	1632969	1632980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012803	CCTTCT	2	12	1639260	1639271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012803	GGACGC	2	12	1689904	1689915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012803	AAGGGA	2	12	1708742	1708753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012803	GTCTCC	2	12	1718353	1718364	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012803	GGGACG	2	12	1752292	1752303	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012803	CGTCTG	2	12	1755335	1755346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012803	CACCAG	2	12	1767345	1767356	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012803	CAGCCC	2	12	1768789	1768800	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012803	CCGGGC	2	12	1779368	1779379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012803	CCCCCG	2	12	1782271	1782282	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_012803	GCCCCC	2	12	1782356	1782367	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_012803	CGTCGC	2	12	1810340	1810351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012803	ACCGGC	2	12	1833168	1833179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012803	AGGACG	2	12	1833500	1833511	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012803	CGCGCT	2	12	1834710	1834721	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012803	GCGGAC	2	12	1843978	1843989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012803	GGGGGT	2	12	1874242	1874253	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012803	CCCGCC	2	12	1897224	1897235	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_012803	CGCCGA	2	12	1933014	1933025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012803	GCGTCG	2	12	1945356	1945367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012803	TCGGGC	2	12	1956178	1956189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012803	GCTGCG	2	12	1959913	1959924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012803	CCGCGG	2	12	1998158	1998169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012803	TGGCCC	2	12	2004202	2004213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012803	TTCTGC	2	12	2033718	2033729	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012803	CGGCCG	2	12	2043932	2043943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012803	CGGCCG	2	12	2054505	2054516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012803	CGTGTC	2	12	2059293	2059304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012803	CCCCCG	2	12	2060137	2060148	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_012803	TCGGGG	2	12	2060674	2060685	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012803	CGGCCC	2	12	2069739	2069750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012803	GCCCGG	2	12	2074585	2074596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012803	GCGCGG	2	12	2082709	2082720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012803	GCGCGG	2	12	2110078	2110089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012803	ACGGTC	2	12	2116065	2116076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012803	CACGGG	2	12	2120348	2120359	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012803	GACTTC	2	12	2139511	2139522	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012803	CGGTGG	2	12	2145527	2145538	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_012803	GCCGAC	2	12	2157186	2157197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012803	CTGAAC	2	12	2182938	2182949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012803	GCGGGG	2	12	2185995	2186006	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_012803	ACGCCG	2	12	2202439	2202450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012803	GGCGAC	2	12	2202451	2202462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012803	CGGCGT	2	12	2220268	2220279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012803	CTGGGG	2	12	2224760	2224771	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_012803	CGAAAA	2	12	2242091	2242102	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_012803	TCCTTC	2	12	2252550	2252561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012803	GTGGAG	2	12	2255223	2255234	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012803	ACCGCC	2	12	2257528	2257539	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_012803	CCGGGC	2	12	2288035	2288046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012803	GCGGCC	2	12	2306794	2306805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012803	GAGGGC	2	12	2343039	2343050	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_012803	CGCCCC	2	12	2347613	2347624	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
148	NC_012803	CCGACG	2	12	2357839	2357850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012803	CACGCC	2	12	2365606	2365617	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_012803	TCCCGA	2	12	2396778	2396789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012803	GGAGGC	2	12	2406480	2406491	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_012803	CCCCGG	2	12	2412409	2412420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_012803	AGGGAG	2	12	2414088	2414099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012803	GTCGGC	2	12	2416554	2416565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_012803	CTCCCG	2	12	2417102	2417113	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_012803	CGGGCA	2	12	2418850	2418861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_012803	GCCACG	2	12	2428742	2428753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_012803	GACACC	2	12	2437746	2437757	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
159	NC_012803	CTCACC	2	12	2453781	2453792	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_012803	CACTGA	2	12	2462520	2462531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012803	ATCAAC	2	12	2495812	2495823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.