MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012207	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012207	C	6	6	23206	23211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_012207	G	6	6	33187	33192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012207	G	6	6	34175	34180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012207	G	6	6	53482	53487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012207	C	6	6	53529	53534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_012207	G	6	6	130951	130956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012207	G	6	6	231049	231054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012207	G	6	6	243518	243523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012207	C	6	6	285505	285510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_012207	C	6	6	291992	291997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_012207	G	6	6	300084	300089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012207	G	6	6	334724	334729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012207	G	6	6	337683	337688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012207	G	7	7	365805	365811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012207	A	6	6	484921	484926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012207	C	6	6	508177	508182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_012207	C	6	6	630980	630985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_012207	A	6	6	773234	773239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012207	C	6	6	782193	782198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_012207	A	7	7	796443	796449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012207	C	6	6	811664	811669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_012207	G	6	6	835405	835410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012207	A	6	6	836796	836801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012207	C	8	8	857754	857761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_012207	C	6	6	890602	890607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_012207	G	6	6	907025	907030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012207	C	7	7	914834	914840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_012207	G	6	6	996013	996018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012207	G	7	7	1029109	1029115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012207	G	6	6	1150153	1150158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012207	G	6	6	1153845	1153850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012207	T	6	6	1165674	1165679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012207	A	6	6	1203128	1203133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012207	C	6	6	1217982	1217987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_012207	G	6	6	1301629	1301634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012207	C	6	6	1301644	1301649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_012207	T	6	6	1302955	1302960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012207	T	6	6	1341452	1341457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012207	G	6	6	1356793	1356798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012207	C	6	6	1359855	1359860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_012207	G	6	6	1368443	1368448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012207	G	6	6	1379558	1379563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012207	G	6	6	1412729	1412734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012207	G	6	6	1419860	1419865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012207	C	6	6	1476115	1476120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_012207	C	6	6	1476281	1476286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_012207	G	6	6	1562422	1562427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012207	G	6	6	1603969	1603974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012207	G	23	23	1620780	1620802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012207	A	7	7	1713816	1713822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012207	C	6	6	1742613	1742618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_012207	G	6	6	1784284	1784289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012207	T	6	6	1792932	1792937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012207	C	6	6	1806283	1806288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_012207	T	6	6	1830326	1830331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012207	C	7	7	1836857	1836863	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_012207	C	6	6	1859854	1859859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_012207	C	6	6	1893136	1893141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_012207	G	6	6	1893177	1893182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012207	C	6	6	1893497	1893502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_012207	C	6	6	1899656	1899661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_012207	A	6	6	1912107	1912112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012207	G	6	6	1935353	1935358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012207	C	6	6	1981754	1981759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_012207	C	6	6	1982666	1982671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_012207	T	6	6	2011066	2011071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012207	C	6	6	2038560	2038565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_012207	G	6	6	2133806	2133811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012207	C	6	6	2152579	2152584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_012207	G	6	6	2191788	2191793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012207	G	7	7	2205681	2205687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012207	T	6	6	2339622	2339627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012207	G	6	6	2341332	2341337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012207	C	6	6	2374843	2374848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_012207	C	6	6	2375628	2375633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_012207	T	6	6	2382471	2382476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012207	G	7	7	2411491	2411497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012207	T	7	7	2535026	2535032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012207	G	6	6	2569849	2569854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012207	T	6	6	2604512	2604517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012207	C	6	6	2633709	2633714	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_012207	C	6	6	2637839	2637844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_012207	G	6	6	2638418	2638423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012207	C	6	6	2650547	2650552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_012207	C	6	6	2656279	2656284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_012207	C	6	6	2717509	2717514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_012207	C	6	6	2751947	2751952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_012207	C	6	6	2841621	2841626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_012207	C	6	6	2922675	2922680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_012207	C	7	7	2946447	2946453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_012207	C	6	6	3061040	3061045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_012207	C	6	6	3121452	3121457	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_012207	C	6	6	3161048	3161053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_012207	A	6	6	3190468	3190473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012207	C	6	6	3229692	3229697	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_012207	C	6	6	3282797	3282802	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_012207	A	6	6	3310170	3310175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012207	C	6	6	3334105	3334110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_012207	A	6	6	3353334	3353339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012207	C	6	6	3361282	3361287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_012207	G	6	6	3445607	3445612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012207	G	6	6	3514026	3514031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012207	C	6	6	3514128	3514133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_012207	G	7	7	3728474	3728480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012207	C	6	6	3744325	3744330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_012207	C	6	6	3746491	3746496	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_012207	C	6	6	3750625	3750630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_012207	C	6	6	3752613	3752618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_012207	C	6	6	3828410	3828415	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_012207	G	6	6	3857997	3858002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012207	C	6	6	3858008	3858013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_012207	G	6	6	3858026	3858031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012207	C	6	6	3858047	3858052	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_012207	A	6	6	3859530	3859535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012207	C	6	6	3884788	3884793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_012207	C	6	6	3898204	3898209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_012207	C	6	6	3899615	3899620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_012207	C	7	7	4002676	4002682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_012207	T	6	6	4032646	4032651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012207	C	6	6	4068358	4068363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_012207	G	8	8	4069766	4069773	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012207	G	6	6	4069804	4069809	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012207	C	6	6	4079887	4079892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_012207	T	6	6	4092078	4092083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012207	T	6	6	4184503	4184508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012207	C	6	6	4286950	4286955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_012207	G	7	7	4292947	4292953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012207	C	6	6	4306169	4306174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_012207	A	6	6	4309751	4309756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012207	C	6	6	4309769	4309774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.