MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 8881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012207	CATG	2	8	2807220	2807227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_012207	GCC	2	6	2807261	2807266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_012207	ACT	2	6	2807280	2807285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_012207	TCG	2	6	2807328	2807333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_012207	GCG	2	6	2807380	2807385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_012207	CGA	2	6	2807435	2807440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_012207	AGT	2	6	2807479	2807484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_012207	GC	3	6	2807494	2807499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_012207	GCTG	2	8	2807509	2807516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_012207	TGG	2	6	2807531	2807536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012207	CGC	2	6	2807556	2807561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_012207	AC	3	6	2807631	2807636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_012207	CCG	2	6	2809374	2809379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_012207	CAT	2	6	2811479	2811484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_012207	GTC	2	6	2814351	2814356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_012207	CG	3	6	2814406	2814411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_012207	GCC	2	6	2821420	2821425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_012207	CGG	2	6	2821431	2821436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_012207	CGA	2	6	2821443	2821448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_012207	GCC	3	9	2821469	2821477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_012207	GGC	3	9	2821482	2821490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_012207	GC	3	6	2821507	2821512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_012207	CGG	2	6	2821546	2821551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_012207	GTG	2	6	2821607	2821612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_012207	CG	3	6	2821622	2821627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_012207	CGC	3	9	2821645	2821653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_012207	GCCG	2	8	2821658	2821665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_012207	CGG	2	6	2821690	2821695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_012207	CCG	2	6	2822919	2822924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_012207	GC	3	6	2825290	2825295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_012207	CGC	2	6	2825304	2825309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_012207	ATCG	2	8	2825332	2825339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_012207	GCT	2	6	2825349	2825354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_012207	CG	3	6	2825370	2825375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_012207	GTT	2	6	2826498	2826503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_012207	CGA	2	6	2826513	2826518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_012207	CGG	3	9	2826531	2826539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_012207	CGT	2	6	2826573	2826578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_012207	CGACT	2	10	2826579	2826588	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5540	NC_012207	TTC	2	6	2826595	2826600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_012207	TCT	2	6	2826647	2826652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_012207	GCG	3	9	2826752	2826760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_012207	CAGC	2	8	2826789	2826796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_012207	GTT	2	6	2826828	2826833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_012207	GCA	2	6	2826846	2826851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_012207	CAACG	2	10	2826873	2826882	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5547	NC_012207	GCTG	2	8	2827630	2827637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_012207	TTG	2	6	2827644	2827649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_012207	CGC	2	6	2827654	2827659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_012207	GTG	2	6	2827661	2827666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_012207	CCG	2	6	2827684	2827689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_012207	GCC	3	9	2827695	2827703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_012207	CG	3	6	2827777	2827782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_012207	GC	3	6	2827843	2827848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_012207	AGCA	2	8	2827876	2827883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_012207	CGC	2	6	2827892	2827897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_012207	CGACGG	2	12	2827900	2827911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_012207	TTC	2	6	2833716	2833721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_012207	GC	3	6	2834223	2834228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_012207	CGGC	2	8	2834268	2834275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_012207	GGA	2	6	2834281	2834286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_012207	CGG	2	6	2834980	2834985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_012207	GCCCGA	2	12	2834994	2835005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_012207	CTG	2	6	2835019	2835024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_012207	GCG	2	6	2835036	2835041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_012207	GAC	2	6	2837167	2837172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_012207	AAT	2	6	2837200	2837205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_012207	CG	3	6	2837207	2837212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_012207	CG	3	6	2837253	2837258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_012207	CCG	2	6	2838284	2838289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_012207	CTGAT	2	10	2838460	2838469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_012207	GCC	2	6	2838505	2838510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_012207	GGT	2	6	2838526	2838531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_012207	CGA	2	6	2838543	2838548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_012207	ACG	2	6	2838551	2838556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_012207	TGG	2	6	2838590	2838595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_012207	GAT	2	6	2839395	2839400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_012207	CGAC	2	8	2839412	2839419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_012207	GCG	2	6	2841597	2841602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_012207	CCG	2	6	2841603	2841608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_012207	C	6	6	2841621	2841626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5582	NC_012207	GCC	2	6	2841632	2841637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_012207	CCT	2	6	2851637	2851642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_012207	ATCAC	2	10	2851648	2851657	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_012207	CGG	2	6	2851662	2851667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_012207	TCG	2	6	2851682	2851687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_012207	CAA	2	6	2855108	2855113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_012207	ACG	2	6	2855158	2855163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_012207	CGC	2	6	2855166	2855171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_012207	CGC	2	6	2855195	2855200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_012207	TGT	2	6	2855201	2855206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_012207	CG	3	6	2855219	2855224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_012207	CGCC	2	8	2857927	2857934	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5594	NC_012207	AGC	2	6	2857973	2857978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_012207	ATT	2	6	2860755	2860760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_012207	AAC	2	6	2860763	2860768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_012207	CGAC	2	8	2861792	2861799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_012207	CG	3	6	2861808	2861813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_012207	GGT	2	6	2861842	2861847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_012207	CAC	2	6	2861881	2861886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_012207	TCT	2	6	2861918	2861923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_012207	GCC	2	6	2861975	2861980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_012207	GCG	2	6	2862034	2862039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_012207	GCCC	2	8	2865001	2865008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5605	NC_012207	CGG	2	6	2865029	2865034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_012207	TCG	2	6	2868178	2868183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_012207	TCG	2	6	2873038	2873043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_012207	GTATTG	2	12	2873427	2873438	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_012207	CAG	2	6	2873526	2873531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_012207	GAG	2	6	2873569	2873574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_012207	CAG	3	9	2874980	2874988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_012207	AT	3	6	2875003	2875008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_012207	GCGCC	2	10	2875042	2875051	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5614	NC_012207	GCC	2	6	2878607	2878612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_012207	GCG	2	6	2878613	2878618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_012207	AGC	2	6	2878630	2878635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_012207	AAG	2	6	2878669	2878674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_012207	ATC	2	6	2878721	2878726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_012207	TCC	2	6	2880416	2880421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_012207	CCGTTG	2	12	2883372	2883383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_012207	GT	3	6	2883385	2883390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_012207	CCGG	2	8	2883467	2883474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_012207	GA	3	6	2885153	2885158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_012207	GGC	2	6	2887192	2887197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_012207	GCA	2	6	2887213	2887218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_012207	GCG	2	6	2888839	2888844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_012207	TCG	2	6	2890377	2890382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_012207	CCT	2	6	2891294	2891299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_012207	TACGA	2	10	2891311	2891320	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5630	NC_012207	GCA	2	6	2891399	2891404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_012207	TCG	2	6	2892092	2892097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_012207	GAC	2	6	2892191	2892196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_012207	CGC	2	6	2892215	2892220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5634	NC_012207	GGT	2	6	2892221	2892226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_012207	GGTC	2	8	2900489	2900496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5636	NC_012207	CGA	2	6	2900550	2900555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5638	NC_012207	GCGG	2	8	2902239	2902246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5639	NC_012207	TGG	2	6	2902339	2902344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_012207	GTG	2	6	2902348	2902353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_012207	GT	3	6	2902383	2902388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5642	NC_012207	CAG	2	6	2902389	2902394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5644	NC_012207	AGC	2	6	2902428	2902433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5646	NC_012207	TG	3	6	2902504	2902509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5647	NC_012207	CG	3	6	2902512	2902517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5648	NC_012207	GGCGCC	2	12	2903052	2903063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5661	NC_012207	GGC	2	6	2910429	2910434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5752	NC_012207	TGG	2	6	2928972	2928977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5757	NC_012207	CGC	2	6	2929066	2929071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5760	NC_012207	GCG	4	12	2929232	2929243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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