MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 3888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011999	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011999	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011999	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011999	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011999	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011999	TAA	2	6	6433	6438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011999	ATT	2	6	6630	6635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011999	ATC	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011999	AAG	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011999	GAT	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011999	GAC	2	6	6776	6781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011999	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011999	AAT	2	6	12576	12581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011999	ATT	2	6	12612	12617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011999	TAA	2	6	12653	12658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011999	ATA	2	6	15986	15991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011999	AGT	2	6	16032	16037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011999	TGG	2	6	16066	16071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011999	TGA	2	6	16088	16093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011999	GGA	2	6	16111	16116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011999	GAG	2	6	16243	16248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011999	TAA	2	6	17583	17588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011999	ATT	2	6	17691	17696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011999	AGT	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011999	TGC	2	6	21223	21228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011999	GAA	2	6	21254	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011999	ATT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011999	ATG	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011999	AGG	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011999	TGT	2	6	23250	23255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011999	TTA	2	6	23416	23421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011999	ATC	2	6	24798	24803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011999	TAA	2	6	25789	25794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011999	ATT	2	6	25815	25820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011999	CGG	2	6	25921	25926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011999	GTG	2	6	25989	25994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011999	AAG	2	6	26061	26066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011999	TCT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011999	AGT	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011999	TAA	2	6	31814	31819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011999	ATT	2	6	32433	32438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011999	TAA	2	6	32445	32450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011999	GAA	2	6	32455	32460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011999	GGA	2	6	32987	32992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011999	TAG	2	6	36310	36315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011999	TAA	2	6	36366	36371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011999	TAA	2	6	36422	36427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011999	CTT	2	6	36474	36479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011999	TTG	2	6	36480	36485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011999	TGA	2	6	36583	36588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011999	ATT	2	6	36627	36632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011999	AGT	2	6	36651	36656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011999	AGG	2	6	36753	36758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011999	GAG	3	9	37345	37353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011999	ATT	2	6	37721	37726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011999	AAT	2	6	37790	37795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011999	CAG	2	6	37824	37829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011999	GAA	2	6	37846	37851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011999	AAC	2	6	37857	37862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011999	TAA	2	6	38073	38078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011999	TTC	2	6	38143	38148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011999	AAT	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011999	CAA	2	6	38205	38210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011999	TAT	2	6	38351	38356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011999	ATT	2	6	38369	38374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011999	GAA	2	6	39767	39772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011999	ATT	3	9	39799	39807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011999	TAA	2	6	39844	39849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011999	AAT	2	6	39850	39855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011999	TGA	2	6	39856	39861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011999	ATA	2	6	39862	39867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011999	AGG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011999	ATG	2	6	40508	40513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011999	TAA	2	6	40564	40569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011999	TAT	2	6	41792	41797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011999	ACT	2	6	42299	42304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011999	TGG	2	6	42426	42431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011999	AAG	2	6	42549	42554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011999	GAG	2	6	43166	43171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011999	ATA	2	6	45515	45520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011999	CTT	2	6	45547	45552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011999	ATT	2	6	47037	47042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011999	TAT	2	6	47067	47072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011999	ATT	2	6	47598	47603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011999	TAG	2	6	47658	47663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011999	AGT	2	6	47664	47669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011999	GAT	2	6	47685	47690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011999	TGT	2	6	47693	47698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011999	TAT	2	6	47728	47733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011999	ATA	2	6	48159	48164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011999	ATA	2	6	48756	48761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011999	AAT	2	6	48798	48803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011999	ATT	2	6	48843	48848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011999	AGG	2	6	49318	49323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011999	TGA	2	6	50029	50034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011999	AGG	2	6	54449	54454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011999	AAT	2	6	55095	55100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011999	AAC	2	6	55118	55123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011999	GAA	2	6	56349	56354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011999	AAG	2	6	56356	56361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011999	AGG	2	6	56369	56374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011999	CTT	2	6	57325	57330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011999	TAA	2	6	59362	59367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011999	ATT	2	6	59381	59386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011999	ATA	2	6	59441	59446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011999	ATG	2	6	61658	61663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011999	ATG	2	6	63720	63725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011999	CCT	2	6	63727	63732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011999	CTG	2	6	63804	63809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011999	CCA	2	6	63860	63865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011999	TAC	2	6	64790	64795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011999	TCT	2	6	64843	64848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011999	AGA	2	6	65426	65431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011999	ATT	2	6	65475	65480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011999	CCT	2	6	65844	65849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011999	TAT	2	6	65858	65863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011999	TAA	2	6	66410	66415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011999	TTA	2	6	68269	68274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011999	GAA	2	6	68349	68354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011999	ATT	2	6	69654	69659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011999	TTC	2	6	70667	70672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011999	CTT	2	6	70673	70678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011999	TCT	2	6	70700	70705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011999	GAA	2	6	70757	70762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011999	GGT	2	6	70956	70961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011999	ATT	2	6	71946	71951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011999	AAT	3	9	71963	71971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011999	AAT	2	6	72042	72047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011999	CAG	2	6	72053	72058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011999	AAG	2	6	72176	72181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011999	AGG	2	6	72212	72217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011999	CCT	2	6	72227	72232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011999	AAT	2	6	73273	73278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011999	ATT	2	6	73332	73337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011999	TGA	2	6	73355	73360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011999	TGT	2	6	73486	73491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011999	TTA	2	6	73518	73523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011999	TAT	2	6	73608	73613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011999	AGG	2	6	73700	73705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011999	ATG	2	6	74081	74086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011999	AGA	2	6	74168	74173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011999	GAA	2	6	74208	74213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_011999	ATA	2	6	246839	246844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_011999	AAT	2	6	246854	246859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_011999	TAA	2	6	253566	253571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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