MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011996	AGG	2	6	35	40	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011996	TAA	2	6	155	160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011996	ATT	2	6	4752	4757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011996	ATG	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011996	ATT	2	6	4892	4897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011996	AAC	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011996	GAC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011996	AAT	2	6	5021	5026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011996	AAT	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011996	CAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011996	ATT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011996	CCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011996	AGG	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011996	TTA	3	9	8220	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011996	GGA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011996	CTA	2	6	11013	11018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011996	CCA	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011996	GTG	2	6	11089	11094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011996	CCA	2	6	11135	11140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011996	AAT	2	6	11262	11267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011996	GAT	2	6	11287	11292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011996	AGA	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011996	AGT	2	6	11348	11353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011996	TAA	2	6	11379	11384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011996	AAG	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011996	TGA	2	6	11443	11448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011996	TAA	3	9	11473	11481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011996	GAA	2	6	11498	11503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011996	AGA	2	6	11530	11535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011996	AGG	2	6	13408	13413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011996	AGG	2	6	13734	13739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011996	GTT	2	6	13769	13774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011996	GAA	2	6	13787	13792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011996	TTA	2	6	13817	13822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011996	ATT	2	6	13832	13837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011996	TAC	2	6	13843	13848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011996	GAA	2	6	13880	13885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011996	GGA	2	6	13927	13932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011996	ATT	2	6	15479	15484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011996	TAT	2	6	17652	17657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011996	AGG	2	6	17658	17663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011996	ACC	2	6	18180	18185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011996	AAG	2	6	18201	18206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011996	CTT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011996	GAG	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011996	TAT	2	6	20047	20052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011996	TAG	2	6	20055	20060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011996	TTA	2	6	20425	20430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011996	TAA	2	6	20439	20444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011996	AGA	2	6	20491	20496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011996	ATT	2	6	20501	20506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011996	ATC	2	6	20576	20581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011996	AGG	2	6	20695	20700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011996	ATG	2	6	20773	20778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011996	AAG	2	6	20812	20817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011996	GGA	2	6	20882	20887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011996	TTA	2	6	21675	21680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011996	ATT	2	6	21700	21705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011996	ATT	2	6	21760	21765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011996	TAA	2	6	21802	21807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011996	CTT	2	6	22670	22675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011996	CTT	2	6	23246	23251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011996	TGA	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011996	AGG	2	6	25497	25502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011996	AAC	2	6	28439	28444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011996	GTT	2	6	28469	28474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011996	AGA	2	6	28559	28564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011996	ATT	2	6	28571	28576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011996	CTT	2	6	28621	28626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011996	ATA	2	6	28693	28698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011996	TAA	3	9	32720	32728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011996	TAA	2	6	32743	32748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011996	TCT	2	6	32763	32768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011996	TCT	2	6	32781	32786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011996	ATC	2	6	32789	32794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011996	ATT	3	9	32927	32935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011996	TAA	2	6	33015	33020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011996	AAC	2	6	33064	33069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011996	GTG	2	6	33090	33095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011996	AGA	2	6	33138	33143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011996	TAA	2	6	33214	33219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011996	ATA	2	6	33733	33738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011996	AAT	2	6	33774	33779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011996	AAT	3	9	33788	33796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011996	AGG	2	6	33800	33805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011996	TAT	2	6	35213	35218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011996	ATT	2	6	35288	35293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011996	TAA	2	6	35413	35418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011996	GAT	2	6	35465	35470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011996	ATC	2	6	35819	35824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011996	ATT	2	6	35865	35870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011996	TTA	2	6	35880	35885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011996	GAA	3	9	35925	35933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011996	AAC	2	6	35977	35982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011996	AAG	2	6	35998	36003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011996	TAA	2	6	36230	36235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011996	CTC	2	6	36934	36939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011996	CTT	2	6	37137	37142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011996	TCC	2	6	37621	37626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011996	AAT	3	9	37693	37701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011996	TAC	2	6	37730	37735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011996	GCA	2	6	37758	37763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011996	TTG	2	6	37775	37780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011996	CAT	2	6	37795	37800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011996	CTT	2	6	37805	37810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011996	GTT	2	6	37903	37908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011996	AAT	2	6	38458	38463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011996	GTA	2	6	38555	38560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011996	TTA	2	6	38561	38566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011996	TGT	2	6	38658	38663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011996	TTA	2	6	38669	38674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011996	TGA	2	6	39659	39664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011996	TGT	2	6	39871	39876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011996	ATA	2	6	39916	39921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011996	ATG	2	6	41177	41182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011996	TAC	2	6	42299	42304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011996	GGT	2	6	42401	42406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011996	AAT	2	6	43144	43149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011996	AGG	2	6	43163	43168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011996	ATT	2	6	43997	44002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011996	TTA	2	6	44008	44013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011996	GTT	2	6	44035	44040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011996	TAA	2	6	44053	44058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011996	GGT	2	6	44103	44108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011996	TTA	2	6	45707	45712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011996	GTG	2	6	45748	45753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011996	AAG	2	6	45999	46004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011996	ATT	2	6	47023	47028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011996	TAC	2	6	47034	47039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011996	AGG	2	6	47304	47309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011996	TAT	2	6	50920	50925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011996	ATG	2	6	50945	50950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011996	AAT	2	6	51072	51077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011996	GAT	2	6	51089	51094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011996	GTT	2	6	54065	54070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011996	AAG	2	6	54372	54377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011996	CAA	3	9	54955	54963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011996	TTA	2	6	55074	55079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011996	TTC	2	6	55205	55210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011996	TAT	2	6	55302	55307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011996	TTA	2	6	55309	55314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.